[1]​ Concebida por el filólogo y escritor Júlio Ribeiro en 1888, tenía como objetivo servir como bandera para el régimen republicano, que fue proclamado de manera efectiva el 15 de noviembre del año siguiente.

Para materializar su idea, Ribeiro invitó a su hermano Amador Amaral, artista gráfico y visual, que desarrolló el diseño de la bandera del estado.

Los colores utilizados en la bandera (negro, blanco, amarillo y azul) no poseen tonos definidos en las leyes.

[4]​ Cuenta con un rectángulo rojo dispuesto en horizontal, que representa la sangre derramada por los bandeirantes, ubicado en la parte superior izquierda, y en el cual se encuentra un círculo blanco con el mapa del Brasil en azul, color que representa la fuerza, que los bandeirantes dicen haber traído para el estado de São Paulo, con todos los días y las noches, y el derramamiento de sangre como gran contribución al estado.

Según el propio Ribeiro, las cuatro estrellas amarillas representan la constelación de la Cruz del Sur.