Logró ascender a la Primera División en 1913 y se mantuvo jugando desde 1914 hasta 1919.
La numeración en el nombre, se aplicaba en esa época para diferenciar a su contraparte del Callao, Atlético Peruano Nr.
Disputó el Torneo Intermedio en 1985 y participó en la Segunda División en 1986 pero descendió ese mismo año.
Actualmente está afiliado y participando en torneos de fútbol máster peruano.
Existió el club llamado Atlético Perú,[1] fundado en el Cercado de Lima.
Atlético Peruano participa varias temporadas en la Segunda División Distrital de Trujillo.