Se afilió en 1915 a la Liga Peruana de Foot Ball.

Un año después terminó en último lugar del campeonato de 1929 y desciende a la División Intermedia.

[1]​ En 1930, Alianza Chorrillos terminó penúltimo en Intermedia y descendió a la Segunda División de Lima.

Retornó a la Tercera de Chorrillos para la temporada 2014, desempeñando una regular campaña.

Al año siguiente no participó de torneos oficiales.