La EuroLat, está dirigida por una copresidencia (un presidente por continente).
El presidente europeo actual es Javier López Fernández y el presidente latinoamericano es José Leonel Vásquez Búcaro.
Hay 14 covicepresidentes, divididos en partes iguales como los anteriores.
Los copresidentes y covicepresidentes, constituyen la mesa ejecutiva, la cual es el órgano administrativo de EuroLat.
El Organismo cuenta con cuatro comisiones permanentes: Los 150 miembros, están repartidos en partes iguales entre Europeos y Latinoamericanos, y en la actualidad, proceden de los siguientes órganos gubernamentales: