El arroyo Fraile Muerto es un arroyo uruguayo que discurre en sentido sudeste-noroeste en el departamento de Cerro Largo,[1]​ ubicada en el noreste del país.

Este arroyo es el afluente más importante del río Negro en dicho departamento, destacado por sus aguas salobres.

[cita requerida] Nace en los ramales más septentrionales de la Cuchilla Grande, en el límite entre los departamentos de Cerro Largo y Treinta y Tres, muy próximo a la fuente de otro arroyo el Yerbalito, tras recorrer cerca de 100 kilómetros y recibir las aguas de varios afluentes desemboca en el río Negro.