Su sede actual fue abierta al público en 2014 tras un largo proceso de remodelación del edificio que la acoge.

El depósito quedó instalado en la misma Casa de la Universitat hasta el siglo XVII, momento en el que se construye la nueva Casa Consistorial en ese mismo lugar, conservándose el archivo en el nuevo ayuntamiento de la ciudad.

Desde ese momento, se sitúa al frente del mismo a un funcionario de diputación: Francisco Massanet.

El edificio ha sufrido una profunda remodelación para adecuarlo a las necesidades actuales de conservación documental.

Desde 1956 también intervienen los arquitectos Gabriel Alomar Esteve y José Ferragut, que le dan su claro marcado neoregionalista.