Está separado del continente por un amplio canal que en su recorrido va tomando los nombres de canal de Capones, estero Grande y estero Santa Rosa.

Este canal se extiende a lo largo de unos 54 km hacia el norte desde la boca de Capones hasta la boca del estero Santa Rosa.

El archipiélago posee un clima tropical seco con precipitaciones anuales menores a 500 mm.

[3]​ Las islas más pobladas son Jambelí y Tembleque; esta última también conocida como isla Costa Rica.

La actividad económica en el archipiélago la constituyen: la camaronera, el turismo, el comercio y la pesca, siendo el turismo la más importante en la isla Jambelí, ya que la mayor parte está dedicada a la venta de servicios turísticos.