[5][6] La especie A. spinicauda fue descrita por primera vez por el naturalista alemán Johann Friedrich Gmelin en 1789 bajo el nombre científico Motacilla spinicauda; la localidad tipo es: «Tierra del Fuego».
[5] El nombre genérico femenino «Aphrastura» se compone de las palabras del griego «aphrastos» que significa ‘maravilloso’, y «oura» que significa cola; y el nombre de la especie «spinicauda», se compone de las palabras del latín «spina» que significa ‘espina’, ‘púa’, y «cauda» que significa ‘cola’.
[7] La validez de la muy poco conocida subespecie bullocki fue recientemente confirmada.
[8] Individuos con las partes inferiores ocráceas, parecidos a la subespecie fulva, que aparentemente ocurren en las islas costeras chilenas, sugieren que este patrón ventral puede aparecer de forma independiente en poblaciones insulares, tal vez como respuesta a condiciones más húmedas; las poblaciones en las islas Diego Ramírez aparentemente difieren morfológicamente y genéticamente de la subespecie nominal.
[11][12] Según las clasificaciones del Congreso Ornitológico Internacional (IOC)[11] y Clements checklist/eBird[12] se reconocen cuatro subespecies, con su correspondiente distribución geográfica:[5]