Ingresó a la universidad de Lovaina para hacer sus estudios en derecho.
A partir de 1787 se desempeñó como párroco en Schijndel.
Antonius van Alphen se negó a seguir las órdenes del emperador Napoleón con respecto a las oraciones eclesiásticas prescritas por él y fue encarcelado el 14 de abril de 1810.
Napoleón entonces, bajo su propia autoridad, hizo de Bolduque una diócesis y nombró obispo a Mathias van Camp, división y cargo que no fue reconocido por el papa Pío VII.
[2] Durante su gobierno Van Alphen fundó un seminario en Berlicum que fue transferido en 1817 a la finca Beekvliet en Sint-Michielsgestel.