Clasificó las plantas en sus obras según sus frutos y semillas en lugar de por orden alfabético o por sus propiedades medicinales.
Cesalpino también llevó a cabo algunos trabajos en el área de la fisiología.
Propuso una teoría sobre la circulación de la sangre, que para él era una "circulación química" basada en la repetida evaporación y condensación de la sangre.
Al presente, ese género incluye aproximadamente 150 especies y se ubica en la familia Fabaceae, subfamilia Caesalpinioideae, con un gran número de spp.
Linneo en sus escritos con frecuencia cita a su gran predecesor en la ciencia botánica, y de él dice: Quisquis hic exstiterit primos concedat honores Casalpine Tibi primaque certa dabit.