Bowen hizo su debut en el teatro en Broadway en 1996 como Cosette/Eponine joven en la obra basada en la novela Los Miserables de Victor Hugo, siendo la actriz de menor edad en interpretar dicho papel.
Entre 1996 y 2001 Bowen tuvo una presencia constante en las tablas de Broadway.
Desde 2004, Bowen ha interpretado a Julie Mayer en Desperate Housewives.
Ha tenido también participación en series como Nip/Tuck, One Tree Hill, Boston Public, Law & Order: Special Victims Unit y Scandal.
Igualmente, interpretó el papel de Candace en la película esotérica de aventura Eye of the Dolphin, y protagoniza la película Girl, Positive.