Avendaño Figueroa incursionó en la política a nivel local y llegó de manera circunstancial a ser alcalde interino de San Cristóbal de las Casas, Chiapas, en 1973.
Participó como candidato de la Sociedad Civil a la gubernatura de Chiapas en 1994 impulsado por la Asamblea Estatal Democrática del Pueblo Chiapaneco, compuesta por organizaciones socieles y campesinas de todo el estado y durante la campaña, el 25 de julio de 1994 fue víctima de un atentado en el que perdieron la vida tres de sus cinco acompañantes: Ernesto Fonseca García, Rigoberto Mauricio Villafuerte y Agustín Rubio Montoya y en el que él resultó gravemente lesionado.
A raíz de su derrota en las urnas en 1994 en condiciones absolutamente inequitativas, el grupo Neozapatista lo declararo "Gobernador en Rebeldía" y el mismo 8 de diciembre de ese año, al tomar posesión Robledo Rincón, él fue investido con un bastón de mando por un grupo de indígenas.
Fue profesor preparatoriano y catedrático de la Facultad de Derecho de Chiapas, de donde salió para viajar por varias partes del mundo dictando conferencias sobre el movimiento armado que se registró en esta entidad.
También fue miembro fundador del Centro de Derechos Humanos Fray Bartolomé de Las Casas, cuyo presidente fue el obispo emérito Samuel Ruiz García.