Los habitantes latgalianos del asentamiento fueron conquistados en 1342 por los cruzados alemanes pertenecientes a la Orden Livona.

A la villa que floreció cerca del castillo se le bautizó también como Marienburg.

Se anexionó a la República de las Dos Naciones en 1582 y en 1629 formó parte del Imperio sueco.

Ernst Glück (Johann Ernst Glück), un clérigo luterano y el primer traductor de la Biblia al letón, fundó las primeras escuelas en Vidzeme en las que se impartía el idioma letón en 1683 y en honor al cual se creó el actual Museo Alūksne.

El ejército ruso liderado por Borís Sheremétev tomó la villa durante la Gran Guerra del Norte en 1702, produciendo serios daños en la zona y deportando a todos los habitantes, incluyendo a Glück y su hija de acogida, Marta Skavronska, quién llegaría a convertirse en la zarina Catalina I de Rusia.