[3]​[6]​ Además, es internacional absoluto con la selección de Honduras, con la que ha participado en todas sus categorías.

[7]​ Luego de su fallido paso por el fútbol europeo, en 2008 retornó a su país e inmediatamente se enroló en las divisiones menores del Real España.

[3]​ En ese último torneo, la llegada de Mario Zanabria al banquillo también le permitió tomar mayor protagonismo individual, convirtiéndose en el capitán más joven en la historia del club y del fútbol hondureño.

[10]​ El 12 de septiembre de 2010, en un encuentro válido por la sexta fecha del Torneo Apertura frente a Hispano, Mejía convirtió su primer doblete en primera división, a los minutos 70 y 85 del partido, el cual finalizó con triunfo por 3-1 como visitantes.

[13]​ En la final, el equipo dirigido por Zanabria y capitaneado por Mejía se enfrentó a Olimpia, que venía de consagrarse campeón en el torneo anterior.

[13]​ En la vuelta, disputada el 11 de diciembre en el Estadio Morazán, Real España ganó 2-1 y se consagró campeón del fútbol hondureño.

[18]​ Mejía, quien alineó como titular, no había podido jugar las primeras dos fechas del torneo debido a que se encontraba sancionado.

[19]​[20]​ Por decisión técnica de José Treviño, solamente disputó un partido del Torneo Apertura 2012.

[21]​ El jugador se mantendría en la titularidad durante 13 partidos de ese torneo, sin embargo, en el Torneo Apertura esa progresión se vio frenada ante la llegada del técnico Hristo Vidaković, con quien soló jugó siete partidos —cuatro como titular— y pasó la mayor parte del torneo con el cuadro de reservas (situación que orilló a Mejía a solicitar su salida del club).

[26]​ Realizó su debut oficial en la primera fecha del Torneo Clausura, el 11 de enero, durante un partido disputado en el Estadio Olímpico Metropolitano contra Parrillas One, al cual ingresó de titular y jugó los 90 minutos; los verdolagas y parrilleros empataron a una unidad.

[28]​ A pesar de que solamente jugó un semestre con el club, en el que disputó 20 partidos y convirtió un gol, Mejía se consolidó como una pieza fundamental en el esquema técnico de Manuel Keosseian, quien los lideró a la final del torneo, en donde perdieron el título ante Olimpia.

[33]​ En total, jugó 28 partidos —26 de titular— y convirtió una anotación durante su primer año con el club.

[44]​ Hizo su reestreno el 29 de julio, jugando los 90 minutos, durante la primera fecha del Torneo Apertura en un compromiso ante Juticalpa que se empató 1-1.

[59]​[60]​ Tras una gira en Nueva Jersey, donde se disputaron amistosos contra Estados Unidos, finalmente fue convocado a la Copa Mundial Sub-17 de 2007.

[67]​ El 10 de marzo, Mejía volvió a participar con su selección durante el partido en que los catrachos se impusieron por 4-0 ante Jamaica y consiguieron clasificar al mundial.

[73]​ En el siguiente partido, jugado el 25 de marzo, Mejía volvió a ser titular durante la derrota por 3-0 contra México.

[79]​ Para la siguiente fecha, disputada el 29 de julio en Newcastle, derrotaron y eliminaron a España con un triunfo por la mínima.

[92]​ En la semifinal, jugada el 22 de junio, se enfrentaron a México y perdieron por 2-0 en la prórroga.

[94]​ Mejía únicamente tuvo participación el 26 de mayo durante el amistoso en Dallas contra los kiwis, el cual perdieron por 1-0.

[96]​ Mejía convenció al seleccionador colombiano, quien finalmente lo incluyó en la nómina definitiva para encarar la Copa de Oro 2015 y un amistoso previo contra México.

[1]​ Asimismo, en el comienzo de su carrera el exfutbolista y director técnico, Carlos Orlando Caballero, definió a Mejía como «un líder nato y un adelantado a su edad», tomando en cuenta que en 2010 —a sus 20 años— se convirtió en el capitán más joven en la historia del fútbol hondureño.

[10]​ Desde niño se consideró admirador de Amado Guevara, con quien llegó a compartir vestuario en Motagua y, posteriormente, en Marathón.

[25]​ Públicamente se ha dado a conocer que mantiene estrechas relaciones de amistad con otros futbolistas, entre ellos Anthony Lozano,[106]​ Johnny Leverón y Christian Altamirano,[107]​[108]​ asimismo con el español Fali y el chileno Mauricio Isla.