Durante la dictadura franquista fue ministro de Obras Públicas, siendo también durante esta época procurador en las Cortes franquistas y miembro del Consejo Nacional de FET y de las JONS.

Peña Boeuf, simpatizante de la antigua monarquía alfonsina,[4]​ colaboraría con las autoridades franquistas tras el estallido de la Guerra civil.

En octubre de 1937 se le encargó la realización de un plan de Obras Públicas,[5]​ proyecto que redactó durante el transcurso de la contienda y que vería la luz en 1939 como «Plan General de Obras Públicas»[6]​, el hoy informalmente nombrado como Plan Peña.

[9]​ Considerado una persona de perfil «técnico», durante su etapa ministerial se centraría en la reconstrucción de las infraestructuras destruidas por la contienda.

[12]​ Posteriormente sería nombrado presidente del consejo de administración de RENFE, cargo que desempeñaría entre 1952 y 1957.