Estuvo vinculado con la resistencia contra Hitler y el nazismo.
Alexis Freiherr von Roenne vio amenazados sus valores cristianos por el nazismo, así como Wilhelm Canaris y el Círculo de Kreisau, que estaban convencidos de que la ya previsible consecuencia de la guerra para Alemania sería la ruina, y únicamente podría ser evitada con el asesinato de Hitler o con la victoria aliada.
Fue detenido inmediatamente después del 20 de julio y a continuación interrogado por primera vez.
Dos semanas más tarde, fue detenido de nuevo y, aunque se le ofreció antes de su detención la oportunidad de infiltrarse en la resistencia francesa, lo rechazó con estas palabras: «Un oficial prusiano no rompe un juramento», sabiendo que esta decisión significaría su muerte, habida cuenta de que él había conocido durante su servicio en inteligencia militar innumerables crímenes secretos del régimen nazi.
En su interrogatorio por la Gestapo, afirmó que las políticas raciales del estado nazi eran incompatibles con sus valores cristianos.