Llegó a la Primera División de México en la Invierno 1999, debutando para Monarcas Morelia.
Permaneció con Monarcas Morelia hasta la temporada Apertura 2002, cuando fue transferido a CF Monterrey.
Fernandes tuvo un gran debut en México, anotando 7 goles en 19 partidos en la temporada invierno 1999 y otros 9 goles en la temporada verano 1999, obteniendo su primer título en el balompié mexicano en el invierno 2000, derrotando al Toluca en serie de penaltis, Alex tiro el quinto penalti para Monarcas Morelia fallándolo.
En total, él anotó 72 goles para Monarcas Morelia in sus 4 años allí, incluyendo 15 en la temporada Apertura 2002 antes de su transferencia a CF Monterrey.
Sin embargo, cuando la temporada terminó, en diciembre del 2007, él decidió retirarse de las canchas definitivamente.