Alejandro Andonaegui Acuña (1840[1] - Santiago, 27 de abril de 1919) fue un profesor y político chileno.
Destacado profesor de matemáticas, cuya cátedra desempeñó en el Instituto Nacional y fue vicerrector del Instituto, cuando el director fue Diego Barros Arana.
[1] Durante la Guerra del Pacífico funcionó como oficial mayor del ministerio de Guerra y Marina.
Fue diputado suplente por Carelmapu, período 1867 a 1870.
El diputado propietario dio aviso que se ausentaría de la sede del Congreso y el 10 de octubre de 1867 se acordó llamar a su suplente, Alejandro Andonaegui, quien prestó juramento dos días después.