De regreso en los Estados Unidos, empezó su carrera docente en Cornell (1906-1908) y Pensilvania (1908).

Sin embargo, el gobierno le tenía reservado una tarea más ambiciosa: la reforma de los estudios universitarios.

Fue así que en 1910 el presidente Augusto B. Leguía lo nombró rector de la reabierta Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cusco, que había sido clausurada el año anterior.

El hecho que fuera extranjero y muy joven suscitó no pocas críticas.

Introdujo nuevos métodos y técnicas de enseñanza, así como las prácticas deportivas entre sus alumnos.