Allí conoció a Vincent d'Indy, con quien estudió fuga y orquestación durante cuatro años, escribiendo sus primeras dos sinfonías bajo su tutela.
La Ópera de París programó el tardío estreno mundial en 1931.
Cuenta con Hildegard Behrens, Nadine Denize, José van Dam y Gary Lakes, con la Orchestre du Capitole de Toulouse, dirigida por Michel Plasson.)
Aunque Bruckner utilizó formas cíclicas mucho antes de que d'Indy hiciese suya casi como "marca registrada" el concepto al que dio nombre César Franck, el manejo de Magnard de la forma cíclica es más franckiano que bruckneriano.
En sus óperas, Magnard utiliza la técnica del leitmotiv de Richard Wagner.
Algunas obras más fueron publicadas póstumamente, como los Quatre Poèmes en musique, cuatro canciones para barítono y piano.
Su Hymne à la justice fue dedicado realmente al capitán Dreyfus.