Fue inaugurado en los años 20 después de que algunos aviadores consiguieran aterrizar donde hoy se sitúa el aeropuerto de Palma de Mallorca como base militar, pero algo más tarde también se habilitó para recibir vuelos comerciales.
El primer vuelo comercial que recibió fue en 1927 y fue operado por Iberia LAE.
Entre 1936 y 1939, durante la guerra civil española, Son Bonet fue una base militar cuya función era albergar los bombarderos de la Aviación Legionaria que atacaron Barcelona y Valencia, junto con las bases de Son San Juan, y Pollensa.
Tras el final de la contienda regresó a sus servicios civiles.
Hoy en día es un aeropuerto gestionado por la sociedad mercantil estatal AENA y utilizado principalmente para vuelos de recreo y escuela del Real Aeroclub de Baleares y para aviación general.