Fue asimismo profesor visitante en varias universidades estadounidenses: las de California en Berkeley, Stanford, Chicago, Maryland, Columbia y Yale.
Los escritos del académico Adolfo Gilly reflejan su pensamiento político, que ha sido encuadrado como marxista con tendencias socialistas.
Debido a las violaciones constitucionales en perjuicio de Gilly, fue señalado como un preso político.
Durante los cinco primeros años en Lecumberri, entre 1966 y 1971, escribió la versión original de su libro La revolución interrumpida.
Entre sus obras más destacadas están los libros La revolución interrumpida (El Caballito, Ciudad de México, 1971) y El cardenismo: una utopía mexicana (edición original por Cal y Arena, 1994; después en Ediciones Era, 2001).