Comprende una escuela de música, una facultad de música y un centro para la investigación y la interpretación de la música antigua.Selmar Bagge fue el primer director de la escuela (1868-1896).En 1954, la escuela incorporó la Schola Cantorum Basiliensis, una de las instituciones de música antigua más importantes del mundo.En 2001, la Academia agregó una cuarta institución, el Curso Básico de Música (Musikalischer Grundkurs).En 2008, la Academia se convirtió en una filial de la Universidad regional de Ciencias Aplicadas del Noroeste de Suiza (Fachhochschule Nordwestschweiz).
