El edificio está registrado como monumento histórico francés desde 1928.
A su muerte en 1578, su sobrino León Lescot hereda la propiedad.
Gracias a la generosidad de poderosos amigos aristocráticos, en 1626, solicitó al arquitecto Antoine Le Pautre la construcción de edificios monásticos y una iglesia que sería bendecida en 1648 bajo la advocación del Santísimo Sacramento.
Agnès Arnauld, abadesa de 1661 a 1671 y hermana de Angélique, en su obra "Constituciones del monasterio de Port Royal del Santísimo Sacramento, en París", indica cómo se eligen a las hermanas conversas: "Las hermanas conversas serán elegidas sanas de cuerpo y espíritu, dulces y dóciles acompañadas de solidez, para que las ocupaciones exteriores no les quiten el espíritu interior... Se cuidará con atención si están afectas a su condición, y que no sea solo la incapacidad de estar en el coro, sino un verdadero amor a la humildad y la abyección lo que las haga abrazar este estado, estando contentas de que la providencia de Dios haya hecho la elección por ellas al no darles los talentos necesarios para aspirar a otra cosa.
Junto a este servicio clínico se creó en 1955 el laboratorio de investigación "Biología del desarrollo fetal y neonatal", del INH/asociación Claude-Bernard, que se convertiría en 1964 en la Unidad de Investigación Inserm 29.
[12] A partir de 1960, las dos maternidades Baudelocque y Port-Royal compartieron los registros de ingreso y fueron gradualmente asociadas al hospital Cochin, formando parte del mismo grupo hospitalario.
El claustro, la capilla y la sala capitular de la antigua abadía fueron conservados e integrados en el hospital Cochin.
En 1966, Alexandre Minkowski creó en el edificio de Port-Royal el primer servicio de reanimación y neonatología, servicio que lleva su nombre en la actualidad.