También jugó en la tercera categoría, Segunda División B del fútbol de Costa Rica.
Siendo este un incentivo para jugar la final contra el Deportivo Asís de Cartago y obtener un subtítulo nacional.
Fraternidad (A.D.F) estuvo participando en aquellos torneos distritales, junto al Machado C.F de Santa Bárbara y Deportivo Mac Donald, del mismo cantón.
Sin embargo los machadenses se coronan campeones vecinales y distritales de terceras divisiones.
Pero en la siguiente temporada Fraternidad retoma su liderazgo a nivel cantonal, pero pierde ante Barrio Jesús que campeoniza.
Son campeones por Heredia en el campeonato regional organizado por COFA siendo la A.D Belén Calle Flores Segundo lugar.
Luego logran el título nacional; ganándole la final a la escuadra del Estrella Roja de Golfito, 2-1.
En ese mismo año Fraternidad también logra un campeonato provincial de Cuarta División; ganándole al representativo alajuelense en la ronda nacional.