Era hijo de Alexandr Grigorievich Fischer von Waldheim (1803-1884) y nieto de Johann Gotthelf Fischer von Waldheim (1771-1853).
Completó sus estudios en la Universidad Imperial de Moscú.
Al año siguiente, consiguió el título de doctor en biología por la Universidad de Bonn con una tesis sobre la historia del desarrollo de esporas en Filicophyta; en 1867 doctor en botánica con una tesis acerca de la historia de Ustilaginales, champiñones parásitos pertenecientes a la familia Teliosporomycetidae, publicada en 1869, en Jahrbücher für wissenschaftliche Botanik de Pringsheim y traducida al inglés en Trans.
of the New York State Agric.
Como parte de sus investigaciones, emprendió varios viajes al extranjero.