(3604) Berkhuijsen es un asteroide perteneciente al cinturón de asteroides, descubierto el 17 de octubre de 1960 por Cornelis Johannes van Houten en conjunto a su esposa también astrónoma Ingrid van Houten-Groeneveld y el astrónomo Tom Gehrels desde el Observatorio del Monte Palomar, Estados Unidos.
Designado provisionalmente como 5550 P-L. Fue nombrado Berkhuijsen en honor a la radioastrónoma alemana Elly M. Berkhuijsen.