Las Águilas Cibaeñas tienen más exjugadores en las Grandes Ligas de Béisbol que cualquier otro equipo dominicano.

Algunos jugadores actuales de la MLB que jugaron con Águilas Cibaeñas incluyen a Edwin Encarnación, Carlos Martínez, José Reyes, Jonathan Villar, Carlos Gómez, Juan Lagares, Dellin Betances, Bartolo Colón, Wandy Rodríguez, Melky Cabrera, Danny Santana, Yoenis Céspedes, Starling Marte, Brandon Moss y el mánager, Terry Francona.

Domingo O. Bermúdez, Rafael F. Bonnelly, Augusto Vega Espaillat, doctor Manuel Grullón, Eladio Victoria Hijo, Ramón Suárez Vásquez y el licenciado Marcos A. Cabral encabezaron el grupo que le dio forma al representativo local.

Durante la presidencia de Restituyo González, en 1953, se dieron los primeros pasos para convertir al equipo en una persona jurídica.

Estos enfrentamientos entre ambos equipos son casi comparables con los de Licey y Escogido de años anteriores, aunque con un significado más emotivo debido a que pertenecen a las dos ciudades más grandes del país.

Para época el equipo contaba con un especial "trabuco" con jugadores como: Luis Polonia, Bernie Castro, Alberto Castillo, Tony Batista, Miguel Tejada, Alexis Gómez que marcaron una de las trayectorias más interesantes en la historia del equipo.

En las temporadas 2000-01 y 2002-03 la novena aguilucha logró el título nacional al vencer a los Leones del Escogido.

Pero el conjunto de Santiago logró la venganza al vencer a los Tigres del Licey en las temporadas 2004-05[3]​ y dos veces seguidas en los años 2006-07,[4]​ 2007-08.

En la temporada 2016-17 el equipo se volvió a ver la cara con los Tigres del Licey en la serie final, el equipo del licey venció a la novena aguilucha 6-2, en el noveno partido celebrado en el Estadio Cibao.

El equipo consiguió el título nacional en tras nueve años de intensa lucha, volvieron a enfrentar a los Tigres del Licey pero esta vez lograron vencerlos en siete partidos y así conseguir su título nacional 21.

[8]​ El 2021 el equipo consigue su segundo título en un lapso de tres años, esta vez venciendo a los Gigantes del Cibao en siete partidos, consiguieron el título nacional al hacer reverso a la serie final la cual dominaban los Gigantes 3-1, de esta forma logran su título 22 empatando con los Tigres del Licey como los máximos ganadores en el béisbol dominicano.