El equipo debutó en el Super Rugby con dos partidos en Sudáfrica, obteniendo una victoria ante los Cheetahs y una derrota ante Sharks.El debut en Port Elizabeth una ciudad conocida para los Jaguares, que no traía los mejores recuerdos.Fue victoria por 39-26 ante Kings y se tomaron revancha de lo vivido un año atrás.Ante el cambio de formato del Super Rugby, el equipo argentino integrará la única conferencia africana.En la postemporada, los Jaguares perdieron en cuartos de final contra los Lions, eventuales subcampeones del certamen.Para la temporada 2019, Bautista Ezcurra y Nicolás Sánchez se fueron a clubes europeos, en tanto que Santiago Socino retornó del Viejo Continente.Al finalizar la temporada 2019, seis jugadores de los Jaguares ficharon por clubes europeos: Santiago García Botta, Martín Landajo, Tomás Lavanini, Pablo Matera, Ramiro Moyano y Enrique Pieretto.[7] Al ingresar la UAR al Super Rugby, se le pidió que fuese local en la Ciudad de Buenos Aires en lo que fue una medida para disminuir los traslados desde el aeropuerto internacional de Buenos Aires hacia el interior del país.En noviembre del 2015, el CASI llegó a un arreglo con la Unión Argentina para que la franquicia sea local allí.La cancha principal debía ser ensanchada y se le adaptaría la iluminación para poder cumplir con las necesidades de la organización.La capacidad del estadio se hubiese aumentado con el uso de una tribuna tubular, llegando a los 10000 espectadores.
Estadio José Amalfitani en el debut como local de los Jaguares ante
Chiefs
en el Super Rugby 2016
Video de la hinchada de Jaguares en el estadio Amalfitani en el partido semifinal contra Brumbies.