Las proteínas bitópicas se clasifican en 4 tipos, según su topología transmembrana y la ubicación de la hélice transmembrana en la secuencia de aminoácidos de la proteína. Según Uniprot :
Tipo II: extremo N en el lado citoplasmático de la membrana; hélice transmembrana ubicada cerca del extremo N, donde funciona como ancla [6]
Tipo III: extremo N en el lado extracelular de la membrana; sin péptido señal [7]
Tipo IV: extremo N en el lado citoplasmático de la membrana; hélice transmembrana ubicada cerca del extremo C, donde funciona como ancla [8]
Por lo tanto, las proteínas de tipo I están ancladas a la membrana lipídica con una secuencia de anclaje de parada de transferencia y tienen sus dominios N-terminales dirigidos a la luz del RE durante la síntesis. Los tipos II y III están anclados con una secuencia de anclaje de señal, con el tipo II dirigido a la luz del RE con su dominio C-terminal, mientras que el tipo III tiene sus dominios N-terminales dirigidos a la luz del RE.
Estructura
Una proteína transmembrana de paso único normalmente consta de tres dominios, el dominio extracelular , el dominio transmembrana y el dominio intracelular. El dominio transmembrana es el más pequeño con alrededor de 25 residuos de aminoácidos y forma una hélice alfa insertada en la bicapa de la membrana. El ECD suele ser mucho más grande que el ICD y, a menudo, es globular , mientras que muchos ICD tienen un desorden relativamente alto . [9] Algunas proteínas de esta clase funcionan como monómeros, pero la dimerización u oligomerización de orden superior es común. [9] [10]
Evolución
La cantidad de proteínas transmembrana de paso único en el genoma de un organismo varía significativamente. Es mayor en eucariotas que en procariotas y en organismos multicelulares que unicelulares . [11] La fracción de proteínas de esta clase es mayor en los humanos que en los organismos modelo Danio rerio (pez cebra) y Caenorhabditis elegans (gusanos nematodos), lo que sugiere que los genes que codifican estas proteínas han experimentado una expansión en los linajes de vertebrados y mamíferos . [4]
^ "Proteína de membrana de paso único". www.uniprot.org .
^ Biología estructural de membranas: con fundamentos bioquímicos y biofísicos , por Mary Luckey, 2014, Cambridge University Press , página 91.
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^ "Proteína de membrana tipo II de paso único". UniProt . Consultado el 15 de junio de 2021 .
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