Los microecosistemas pueden existir en lugares definidos con precisión por factores ambientales críticos dentro de espacios pequeños o diminutos.
Dichos factores pueden incluir temperatura , pH , entorno químico , suministro de nutrientes , presencia de simbiontes o sustratos sólidos, atmósfera gaseosa (aeróbica o anaeróbica), etc.
Estos microecosistemas con un volumen de agua limitado a menudo tienen una duración temporal y, por lo tanto, están colonizados por organismos que poseen una etapa de esporas en el ciclo de vida resistente a la sequía, o por organismos que no necesitan vivir en el agua continuamente. Las condiciones del ecosistema que se aplican en el borde de un estanque típico pueden ser bastante diferentes de las que se encuentran más lejos de la costa. Se pueden encontrar ecosistemas acuáticos con un espacio extremadamente limitado, por ejemplo, en el agua recogida en las bases de las hojas de bromelia y en los "cántaros" de Nepenthes .
Estos incluyen la región bucal (especialmente las cavidades en la encía ), el rumen , el ciego , etc. de los mamíferos herbívoros o incluso el tracto digestivo de los invertebrados . En el caso de la microecología gastrointestinal de los mamíferos, microorganismos como protozoos, bacterias, así como curiosos organismos no completamente definidos (como ciertas grandes Selenomonas estructuralmente complejas , Quinella ovalis "Quin's Oval", Magnoovum eadii "Eadie's Oval", Oscillospira , etc.) existen en el rumen como poblaciones mixtas increíblemente complejas y altamente enriquecidas (ver imágenes de Moir y Masson [1] ). Este tipo de microecosistema puede adaptarse rápidamente a los cambios en la nutrición o la salud del animal huésped (normalmente un rumiante como vaca, oveja, cabra, etc.); ver Hungate "The Rumen and its microbes 1966). Incluso dentro de un sistema pequeño y cerrado como el rumen, puede existir una variedad de condiciones ecológicas: muchos organismos viven libremente en el fluido del rumen, mientras que otros requieren el sustrato y los productos metabólicos suministrados por el estómago. El tejido de la pared con sus pliegues e intersticios también se plantean preguntas interesantes sobre la transferencia de los organismos anaerobios estrictos de la microflora/microfauna intestinal a la siguiente generación de huéspedes. Sin duda, el lamido mutuo y la coprofagia juegan un papel importante.
Un microecosistema de suelo típico puede estar restringido a menos de un milímetro en su rango de profundidad total debido a una fuerte variación en la humedad y/o la composición del gas atmosférico. El tamaño de grano del suelo y las propiedades físicas y químicas del sustrato también pueden desempeñar papeles importantes. Debido a la fase sólida predominante en estos sistemas, son notoriamente difíciles de estudiar microscópicamente sin alterar simultáneamente la fina distribución espacial de sus componentes.
Estos se definen por gradientes de temperatura del agua, nutrientes, gases disueltos, concentraciones de sal , etc. A lo largo del camino del flujo de agua terrestre, el gradiente continuo de temperatura resultante por sí solo puede proporcionar muchos microecosistemas diminutos diferentes, comenzando con bacterias termófilas como Archaea "Archaebacteria" (100 °C (212 °F) o más), seguidos de los termófilos convencionales (60–100 °C (140–212 °F)), cianobacterias (algas verdiazules) como los filamentos móviles de Oscillatoria (30–60 °C (86–140 °F)), protozoos como las amebas, rotíferos , luego algas verdes (0–30 °C (32–86 °F)), etc. Por supuesto, otros factores además de la temperatura también juegan un papel importante. Las aguas termales pueden proporcionar ecosistemas clásicos y sencillos para estudios de microecología, además de proporcionar un refugio para organismos hasta ahora no descritos.
Los más conocidos contienen organismos especializados raros, que se encuentran sólo en las inmediaciones (a veces a centímetros) de respiraderos volcánicos submarinos (o "fumadores"). Estos ecosistemas requieren técnicas de buceo y recolección extremadamente avanzadas para su exploración científica.
Uno que esté sellado y completamente independiente de factores externos, excepto la temperatura y la luz. Un buen ejemplo sería una planta contenida en un frasco sellado y sumergida bajo agua. Ningún nuevo factor podría entrar en este ecosistema.
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