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enterobacterias

Enterobacterales es un orden de bacterias Gram negativas , no formadoras de esporas, anaeróbicas facultativas y con forma de bastón de la clase Gammaproteobacteria . [1] El género tipo de este orden es Enterobacter . [1]

El nombre Enterobacterales se deriva del término latino Enterobacter , que hace referencia al género tipo del orden y al sufijo "-ales", una terminación utilizada para denotar un orden. En conjunto, Enterobacterales hace referencia a un orden cuyo tipo nomenclatural es el género Enterobacter . [1]

Identificación histórica y sistemática

Enterobacterales se propuso en 2005 con el nombre de "Enterobacteriales". Sin embargo, el nombre "Enterobacteriales" no fue validado según las reglas del Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas , por lo que carecía de posición en la nomenclatura, por lo que el nombre se escribió entre paréntesis. "Enterobacteriales" era un orden monotípico , que contenía únicamente la familia Enterobacteriaceae , y compartía su género tipo Escherichia . [2] [3] [4] El orden contenía un grupo grande y diverso de especies, que ocupaban nichos ecológicos distintos y poseían una variedad de características bioquímicas. [5] Muchos géneros dentro del orden tienen impactos significativos en la actividad humana, como las especies patógenas Escherichia coli , Salmonella enterica y Yersinia pestis , así como fitopatógenos que dañan la agricultura, como miembros de los géneros Dickeya , Pectobacterium , Brenneria , Erwinia . y Pantoea . La gran cantidad de especies, así como la variedad de diferentes características bioquímicas, hicieron extremadamente difícil describir el orden y sus subgrupos. [6] La asignación y clasificación de este orden se basó en gran medida en secuencias del genoma de ARNr 16S, que se sabe que tiene un bajo poder discriminatorio y produce diferentes resultados según el algoritmo y la cepa del organismo utilizado. [7] Además, estos análisis han demostrado que las 'Enterobacteriales' exhibieron ramificación polifilética, con subgrupos distintos.

En 2016, se propuso reclasificar "Enterobacteriales" como Enterobacterales, y el género tipo cambió a Enterobacter de acuerdo con el Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas. [1] Además, se propusieron varias familias nuevas dentro del orden Enterobacterales, que consisten en especies que anteriormente eran miembros de la familia Enterobacteriaceae basándose en agrupaciones encontradas en árboles filogenéticos construidos con base en genomas conservados, secuencias de ARNr 16S y análisis de secuencias de múltiples locus como así como marcadores moleculares independientes ( indeles de firma conservados ). [1]

A partir de 2021, el orden Enterobacterales contiene 7 familias válidamente publicadas ( Budviciaceae , Enterobacteriaceae , Erwiniaceae , Hafniaceae , Morganellaceae , Pectobacteriaceae y Yersiniaceae ). [8]

Firmas moleculares

Los análisis de las secuencias del genoma de las especies de Enterobacterales identificaron cinco indeles característicos conservados (CSI) para este orden en las proteínas péptido transportador ABC permeasa, factor de elongación proteína similar a P YeiP, L-arabinosa isomerasa , pirofosfatasa y una proteína hipotética, que en la mayoría de los casos son compartidos exclusivamente por todos o la mayoría de los miembros de esta orden. [1] Estos CSI proporcionan un medio molecular para demarcar este orden de otras gammaproteobacterias y respaldan la naturaleza monofilética del orden Enterobacterales.

géneros

Géneros válidamente publicados

Los siguientes géneros han sido publicados válidamente, por lo que tienen "Estado en Nomenclatura". El año en que se propuso el género aparece entre paréntesis después del nombre del género.

Géneros de Candidatus

Propuestos, pero no han obtenido estatus en la nomenclatura.

Referencias

  1. ^ abcdefg Adeolu, M; Alnájar, S; Naushad, S; S Gupta, R (diciembre de 2016). "Filogenia y taxonomía basadas en el genoma de los 'Enterobacteriales': propuesta para Enterobacterales ord. nov. dividida en las familias Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Familia Morganellaceae nov. y familia Budviciaceae nov". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 66 (12): 5575–5599. doi : 10.1099/ijsem.0.001485 . PMID  27620848.
  2. ^ Sitio Zipcodezoo Enterobacteriales Archivado el 27 de abril de 2014 en Wayback Machine , consultado el 9 de marzo de 2013.
  3. ^ NCBI Enterobacterales, consultado el 9 de marzo de 2013.
  4. ^ Taxonomicon Enterobacteriales consultado el 9 de marzo de 2013.
  5. ^ Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T.; Garrity, George M.; Boone, David R.; De Vos, Paul; Buen compañero, Michael; Rainey, Fred A.; Schleifer, Karl-Heinz, eds. (2005). Manual de Bergey® de Bacteriología Sistemática. doi :10.1007/0-387-28022-7. ISBN 978-0-387-24144-9.
  6. ^ Octavia, Sofía; Lan, Ruiting (2014), "La familia Enterobacteriaceae", Los procariotas , Berlín, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, págs. 225–286, doi :10.1007/978-3-642-38922-1_167, ISBN 978-3-642-38921-4, recuperado 2021-06-02
  7. ^ Francino, M. Pilar; Santos, Scott R.; Ochman, Howard (2006), "Relaciones filogenéticas de bacterias con especial referencia a endosimbiontes y especies entéricas" (PDF) , The Prokaryotes , Nueva York, NY: Springer New York, págs. 41–59, doi :10.1007/0-387 -30746-x_2, ISBN 978-0-387-25496-8, recuperado 2021-06-02
  8. ^ "Orden: Enterobacterales". lpsn.dsmz.de.Consultado el 2 de junio de 2021 .