Las ramas de la ciencia conocidas informalmente como ómicas son diversas disciplinas de la biología cuyos nombres terminan en el sufijo -ómica , como la genómica , la proteómica , la metabolómica , la metagenómica , la fenómica y la transcriptómica . La ómica tiene como objetivo la caracterización y cuantificación colectiva de conjuntos de moléculas biológicas que se traducen en la estructura, función y dinámica de un organismo u organismos. [1]
El sufijo relacionado -ome se utiliza para referirse a los objetos de estudio de dichos campos, como el genoma , el proteoma o el metaboloma respectivamente. El sufijo -ome, tal como se utiliza en biología molecular, se refiere a una totalidad de algún tipo; es un ejemplo de un "neo-sufijo" formado por abstracción de varios términos griegos en -ωμα , una secuencia que no forma un sufijo identificable en griego.
La genómica funcional tiene como objetivo identificar las funciones de tantos genes como sea posible de un organismo determinado. Combina diferentes técnicas ómicas, como la transcriptómica y la proteómica, con colecciones de mutantes saturadas. [2]
El Oxford English Dictionary ( OED ) distingue tres campos diferentes de aplicación del sufijo -ome :
en medicina, formando sustantivos con el sentido "hinchazón, tumor"
en botánica o zoología, formando sustantivos en el sentido de "una parte de un animal o planta con una estructura específica"
en biología celular y molecular, formando sustantivos con el sentido de "todos los constituyentes considerados colectivamente"
El sufijo -ome se originó como una variante de -oma y se volvió productivo en el último cuarto del siglo XIX. Originalmente apareció en términos como escleroma [3] o rizoma . [4] Todos estos términos derivan de palabras griegas en -ωμα , [5] una secuencia que no es un sufijo único, pero analizable como -ω-μα , el -ω- perteneciente a la raíz de la palabra (generalmente un verbo) y siendo el -μα un sufijo griego genuino que forma sustantivos abstractos.
El OED sugiere que su tercera definición se originó como una formación posterior del mitoma , [6] Los primeros testimonios incluyen bioma (1916) [7] y genoma (acuñado por primera vez como genoma alemán en 1920 [8] ). [9]
La asociación con el cromosoma en biología molecular es por falsa etimología . La palabra cromosoma deriva de las raíces griegas χρωμ(ατ)- "color" y σωμ(ατ)- "cuerpo". [9] Si bien σωμα "cuerpo" realmente contiene el sufijo -μα , el -ω- anterior no es un sufijo que forma la raíz sino parte de la raíz de la palabra . Debido a que genoma se refiere a la composición genética completa de un organismo, se sugirió un neo-sufijo -ome para referirse a "integridad" o "completitud". [10]
Muchos "omas" más allá del " genoma " original se han vuelto útiles y han sido ampliamente adoptados por los científicos investigadores. " Proteómica " se ha consolidado como término para el estudio de proteínas a gran escala. "Omes" puede proporcionar una forma sencilla de encapsular un campo; por ejemplo, es claramente reconocible que un estudio de interactómica se relaciona con análisis a gran escala de interacciones gen-gen, proteína-proteína o proteína-ligando. Los investigadores están adoptando rápidamente omas y ómicas, como lo demuestra la explosión del uso de estos términos en PubMed desde mediados de los años noventa. [12]
Genómica comparada : estudio de la relación entre la estructura y función del genoma entre diferentes especies o cepas biológicas.
Genómica funcional : describe las funciones e interacciones de genes y proteínas (a menudo utiliza la transcriptómica).
Metagenómica : Estudio de metagenomas , es decir, material genético recuperado directamente de muestras ambientales.
Neurogenómica : Estudio de las influencias genéticas sobre el desarrollo y función del sistema nervioso.
Pangenómica : Estudio de toda la colección de genes o genomas que se encuentran dentro de una especie determinada. [13]
Genómica personal : Rama de la genómica que se ocupa de la secuenciación y análisis del genoma de un individuo. Una vez que se conocen los genotipos, el genotipo del individuo se puede comparar con la literatura publicada para determinar la probabilidad de expresión del rasgo y el riesgo de enfermedad. Ayudas en Medicina Personalizada
Electrónica: Rama de la genómica que se ocupa del papel de los campos eléctricos exógenos en la potenciación de los perfiles de expresión génica de células, tejidos y organoides. [14]
Epigenómica
El epigenoma es la estructura de soporte del genoma, que incluye aglutinantes de proteínas y ARN, estructuras alternativas de ADN y modificaciones químicas en el ADN.
Epigenómica : las tecnologías modernas incluyen la conformación de cromosomas mediante Hi-C , varios ChIP-seq y otros métodos de secuenciación combinados con fraccionamientos proteómicos, y métodos de secuenciación que encuentran modificaciones químicas de las citosinas, como la secuenciación con bisulfito.
Nucleómica: Estudio del conjunto completo de componentes genómicos que forman "el núcleo celular como un sistema biológico complejo y dinámico, denominado nucleoma". [15] [16] El 4D Nucleome Consortium se unió oficialmente al IHEC ( Consorcio Internacional del Epigenoma Humano ) en 2017.
Microbiómica
El microbioma se define como una comunidad microbiana característica que ocupa un hábitat razonablemente bien definido y que tiene propiedades fisicoquímicas distintas. El microbioma no sólo se refiere a los microorganismos involucrados sino que también abarca su teatro de actividad, lo que resulta en la formación de nichos ecológicos específicos . El microbioma, que forma un microecosistema dinámico e interactivo propenso a cambios en el tiempo y la escala, está integrado en macroecosistemas que incluyen huéspedes eucariotas, y aquí es crucial para su funcionamiento y salud. [17]
El lipidoma es el complemento completo de lípidos celulares , incluidas las modificaciones realizadas en un conjunto particular de lípidos, producidos por un organismo o sistema.
Lipidómica : estudio a gran escala de vías y redes de lípidos. Se utilizan técnicas de espectrometría de masas.
proteómica
El proteoma es el complemento completo de proteínas , incluidas las modificaciones realizadas en un conjunto particular de proteínas, producidas por un organismo o sistema.
Proteómica : estudio a gran escala de las proteínas, particularmente de sus estructuras y funciones. Se utilizan técnicas de espectrometría de masas.
Quimioproteómica : una variedad de técnicas utilizadas para estudiar las interacciones entre proteínas y moléculas pequeñas.
Inmunoproteómica : Estudio de grandes conjuntos de proteínas (proteómicas) implicadas en la respuesta inmune.
Nutriproteómica: identificación de los objetivos moleculares de los componentes nutritivos y no nutritivos de la dieta. Utiliza datos de espectrometría de masas proteómica para estudios de expresión de proteínas
Proteogenómica : un campo emergente de investigación biológica en la intersección de la proteómica y la genómica. Datos proteómicos utilizados para anotaciones genéticas.
Genómica estructural : estudio de la estructura tridimensional de cada proteína codificada por un genoma determinado utilizando una combinación de enfoques experimentales y de modelado.
Glicómicos
La glicómica es el estudio exhaustivo del glicoma , es decir, de los azúcares y los carbohidratos.
Foodómica
La foodómica fue definida por Alejandro Cifuentes en 2009 como "una disciplina que estudia los dominios de la alimentación y la nutrición mediante la aplicación e integración de tecnologías ómicas avanzadas para mejorar el bienestar, la salud y el conocimiento del consumidor". [21] [22]
Transcriptómica
El transcriptoma es el conjunto de todas las moléculas de ARN , incluidos ARNm, ARNr, ARNt y otros ARN no codificantes, producidos en una o una población de células.
Transcriptómica : Estudio de los transcriptomas, sus estructuras y funciones.
Metabolómica
El metaboloma es el conjunto de moléculas pequeñas que se encuentran dentro de una matriz biológica.
Metabolómica : Estudio científico de los procesos químicos que involucran metabolitos. Es un "estudio sistemático de las huellas químicas únicas que dejan procesos celulares específicos", el estudio de sus perfiles de metabolitos de moléculas pequeñas.
Metabonómica : la medición cuantitativa de la respuesta metabólica multiparamétrica dinámica de los sistemas vivos a estímulos fisiopatológicos o modificaciones genéticas.
Nutrición, farmacología y toxicología.
Genómica nutricional : ciencia que estudia la relación entre el genoma humano, la nutrición y la salud.
La nutrigenética estudia el efecto de las variaciones genéticas en la interacción entre dieta y salud con implicaciones para subgrupos susceptibles
Nutrigenómica : Estudio de los efectos de los alimentos y sus constituyentes sobre la expresión genética. Estudia el efecto de los nutrientes sobre el genoma, proteoma y metaboloma.
La farmacogenómica investiga el efecto de la suma de variaciones dentro del genoma humano sobre los fármacos;
La farmacomicrobiómica investiga el efecto de las variaciones dentro del microbioma humano sobre los fármacos y viceversa.
Toxicogenómica : campo de la ciencia que se ocupa de la recopilación, interpretación y almacenamiento de información sobre la actividad de genes y proteínas dentro de una célula o tejido particular de un organismo en respuesta a sustancias tóxicas.
Cultura
Inspirándose en cuestiones fundamentales de la biología evolutiva, un equipo de Harvard formado por Jean-Baptiste Michel y Erez Lieberman Aiden creó el neologismo estadounidense culturómica para la aplicación de la recopilación y el análisis de big data a los estudios culturales . [23]
Psicogenómica : Proceso de aplicación de las poderosas herramientas de la genómica y la proteómica para lograr una mejor comprensión de los sustratos biológicos del comportamiento normal y de las enfermedades del cerebro que se manifiestan como anomalías del comportamiento. Al aplicar la psicogenómica al estudio de la drogadicción, el objetivo final es desarrollar tratamientos más eficaces para estos trastornos, así como herramientas de diagnóstico objetivas, medidas preventivas y, en última instancia, curas.
Genómica de células madre : ayuda en la biología de las células madre. El objetivo es establecer las células madre como un sistema modelo líder para comprender la biología humana y los estados patológicos y, en última instancia, acelerar el progreso hacia la traducción clínica.
Conectómica : El estudio del conectoma, la totalidad de las conexiones neuronales en el cerebro.
Microbiómica : El estudio de los genomas de las comunidades de microorganismos que viven en un nicho ambiental específico.
Celómica : análisis y estudio cuantitativo de células mediante métodos de bioimagen y bioinformática.
Tomómica: una combinación de métodos tomográficos y ómicos para comprender la bioquímica de tejidos o células con alta resolución espacial, generalmente utilizando datos de espectrometría de masas de imágenes. [24]
Ethomics: La máquina de alto rendimiento que mide el comportamiento animal. [25]
Videomics (o videoómica): Un paradigma de análisis de video inspirado en los principios de la genómica, donde una secuencia de imágenes continua (o video) puede interpretarse como la captura de una sola imagen que evoluciona a través del tiempo a través de mutaciones que revelan "una escena".
Multiómica : Integración de diferentes ómicas en un único estudio o línea de análisis. [26]
Palabras no relacionadas en -ómicas
La palabra "cómic" no utiliza el sufijo "ómicos"; deriva del griego "κωμ(ο)-" ( alegría ) + "-ικ(ο)-" (un sufijo adjetivo), en lugar de presentar un truncamiento de "σωμ(ατ)-".
De manera similar, la palabra "economía" se deriva del griego "οικ(ο)-" ( hogar ) + "νομ(ο)-" ( ley o costumbre ), y "económico(s)" de "οικ(ο)-". + "νομ(ο)-" + "-ικ(ο)-". El sufijo -ómica se utiliza a veces para crear nombres para escuelas de economía , como Reaganomics .
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Otras lecturas
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Hotz, Robert Lee (13 de agosto de 2012). "Aquí hay una historia ómica: los científicos descubren un sufijo en expansión". El periodico de Wall Street .
enlaces externos
Busque -ómicas en Wikcionario, el diccionario gratuito.
Omics.org Página de inicio de términos y conceptos de Omics. Probablemente la primera página web ómica creada.
Lista de ómicas, incluidas referencias/orígenes. Mantenido por el (CHI) Cambridge Health Institute.
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