stringtranslate.com

Coronavirus humano HKU1

El betacoronavirus hongkonense [1] (comúnmente llamado coronavirus humano HKU1, abreviado como HCoV-HKU1 ) es una especie de coronavirus en humanos y animales. Provoca una enfermedad de las vías respiratorias superiores con síntomas de resfriado común , pero puede progresar a neumonía y bronquiolitis . [2] Se descubrió por primera vez en enero de 2004 en un hombre de Hong Kong . [3] Investigaciones posteriores revelaron que tiene una distribución global y una génesis más temprana.

El virus es un virus de ARN monocatenario , de sentido positivo y con envoltura que ingresa a su célula huésped uniéndose al receptor del ácido N-acetil-9-O-acetilneuramínico . [4] Tiene el gen de la hemaglutinina esterasa (HE), que lo distingue como miembro del género Betacoronavirus y del subgénero Embecovirus . [5]

Historia

El HCoV-HKU1 se detectó por primera vez en enero de 2004 en un hombre de 71 años que fue hospitalizado debido a un síndrome de dificultad respiratoria aguda y neumonía bilateral confirmada radiográficamente . El hombre había regresado recientemente a Hong Kong desde Shenzhen, China . [3] [6]

En 2023, según la nueva propuesta de denominación binomial de 2021, HCoV-HKU1 pasó a llamarse Betacoronavirus hongkonense.

Virología

Woo y sus colaboradores no tuvieron éxito en sus intentos de cultivar un aislado de HCoV-HKU1, pero pudieron obtener la secuencia genómica completa. El análisis filogenético mostró que HKU1 está más estrechamente relacionado con el virus de la hepatitis del ratón (MHV), y es distinto en ese sentido de otros betacoronavirus humanos conocidos , como HCoV-OC43 . [3] Pyrc y sus colaboradores han cultivado con éxito el virus en el modelo ex vivo del epitelio respiratorio humano. [7] Investigaciones adicionales han revelado que el virus se adhiere a los ácidos siálicos O-acetilados en la superficie celular, [8] lo que instiga un cambio conformacional en la proteína S, facilitando la interacción con el receptor de entrada. [9] Curiosamente, el equipo de Pyrc ha identificado la enzima calicreína 13 como un factor activador responsable del procesamiento de la proteína de pico. Esto podría especificar potencialmente la preferencia tisular y celular del virus, y también podría gobernar la regulación de la transmisión entre especies. [10]

Cuando se analizaron los genes de la ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp), de la proteína spike (S) y de la nucleocápside (N), se descubrieron relaciones filogenéticas incompatibles. La secuenciación completa del genoma de 22 cepas de HCoV-HKU1 confirmó que esto se debía a una recombinación natural . [3] Es probable que el HCoV-HKU1 se haya originado a partir de roedores . [11]

El HCoV-HKU1 es uno de los siete coronavirus conocidos que infectan a los humanos. Los otros seis son: [12]

Las estructuras de las proteínas de la espícula (S) y de la hemaglutinina esterasa (HE) de HCoV-HKU1 se han resuelto mediante crio-EM en 2016 y 2020, respectivamente. La proteína S ( PDB : 5I08 ) se ha destacado por su gran tamaño. [13] La proteína HE ( PDB : 6Y3Y ) se diferencia de las convencionales (como la de OC43) por tener un dominio de lectina vestigial mucho más pequeño . Este dominio está protegido del reconocimiento por parte del sistema inmunitario mediante cambios de tamaño y glicosilación. [14]

Epidemiología

Un análisis de rastreo de aspirados nasofaríngeos negativos al SARS de pacientes con enfermedad respiratoria durante el período del SARS en 2003, identificó la presencia de ARN de CoV-HKU1 en la muestra de una mujer de 35 años con neumonía. [6]

Tras los informes iniciales del descubrimiento del HCoV-HKU1, el virus se identificó ese mismo año en 10 pacientes en el norte de Australia . Se recogieron muestras respiratorias entre mayo y agosto (invierno en Australia). Los investigadores descubrieron que la mayoría de las muestras positivas para el HCoV-HKU1 procedían de niños en los últimos meses del invierno. [15]

Los primeros casos conocidos en el hemisferio occidental fueron descubiertos en 2005 después de analizar muestras antiguas por virólogos clínicos del Hospital Yale-New Haven en New Haven, Connecticut, que tenían curiosidad por descubrir si el HCoV-HKU1 estaba en su área. Realizaron un estudio de muestras recogidas en un período de 7 semanas (diciembre de 2001 - febrero de 2002) en 851 bebés y niños. Las muestras de nueve niños tenían coronavirus humano HKU1. Estos niños tenían infecciones del tracto respiratorio en el momento en que se recogieron las muestras (en una niña tan grave que se necesitó ventilación mecánica), mientras que las pruebas dieron negativo para otras causas como el virus respiratorio sincitial humano (VSR), los virus de la parainfluenza (tipos 1-3) , los virus de la influenza A y B y el adenovirus mediante ensayo de inmunofluorescencia directa , así como el metapneumovirus humano y el HCoV-NH mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR). Los investigadores informaron que las cepas identificadas en New Haven eran similares a la cepa encontrada en Hong Kong y sugirieron una distribución mundial. [16] Estas cepas encontradas en New Haven no deben confundirse con HCoV-NH (coronavirus de New Haven), que es una cepa del coronavirus humano NL63 .

En julio de 2005 se notificaron seis casos en Francia. En esos casos, los investigadores franceses utilizaron técnicas mejoradas para recuperar el virus de aspirados nasofaríngeos y muestras de heces. [17]

Véase también

Referencias

  1. ^ "Detalles del taxón | ICTV". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Consultado el 25 de julio de 2024 .
  2. ^ Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P.; Liu, Ding Xiang (25 de julio de 2016). "Coronavirus humanos: una revisión de las interacciones virus-huésped". Enfermedades . 4 (3): 26. doi : 10.3390/diseases4030026 . ISSN  2079-9721. PMC 5456285 . PMID  28933406. Véase la Tabla 1. 
  3. ^ abcd Woo, PCY; Lau, SKP; Chu, C.-m.; Chan, K.-h.; Tsoi, H.-w.; Huang, Y.; Wong, BHL; Poon, RWS; Cai, JJ; Luk, W.-k.; Poon, LLM; Wong, SSY; Guan, Y.; Peiris, JSM; Yuen, K.-y. (2004). "Caracterización y secuenciación completa del genoma de un nuevo coronavirus, Coronavirus HKU1, de pacientes con neumonía". Revista de Virología . 79 (2): 884–95. doi :10.1128/JVI.79.2.884-895.2005. PMC 538593 . PMID  15613317. 
  4. ^ Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P.; Liu, Ding Xiang (25 de julio de 2016). "Coronavirus humanos: una revisión de las interacciones virus-huésped". Enfermedades . 4 (3): 26. doi : 10.3390/diseases4030026 . ISSN  2079-9721. PMC 5456285 . PMID  28933406. Véase la Tabla 1. 
  5. ^ Woo, Patrick CY; Huang, Yi; Lau, Susanna KP; Yuen, Kwok-Yung (2010-08-24). "Análisis de bioinformática y genómica del coronavirus". Viruses . 2 (8): 1804–1820. doi : 10.3390/v2081803 . ISSN  1999-4915. PMC 3185738 . PMID  21994708. En todos los miembros del subgrupo A de Betacoronavirus, un gen de hemaglutinina esterasa (HE), que codifica una glicoproteína con actividad de O-acetil-esterasa neuraminato y el sitio activo FGDS, está presente corriente abajo de ORF1ab y corriente arriba del gen S (Figura 1). 
  6. ^ ab Lau, SKP; Woo, PCY; Sí, CCY; Tse, H.; Tsoi, H.-w.; Cheng, VCC; Lee, P.; Tang, BSF; Cheung, CHY; Lee, RA; Entonces, L.-y.; Lau, Y.-l.; Chan, K.-h.; Yuen, K.-y. (2006). "Coronavirus HKU1 y otras infecciones por coronavirus en Hong Kong". Revista de Microbiología Clínica . 44 (6): 2063–71. doi :10.1128/JCM.02614-05. PMC 1489438 . PMID  16757599. 
  7. ^ Pyrc, Krzysztof; Sims, Amy C.; Dijkman, Ronald; Jebbink, Maarten; Long, Casey; Deming, Damon; Donaldson, Eric; Vabret, Astrid; Baric, Ralph; van der Hoek, Lia; Pickles, Raymond (noviembre de 2010). "Cultivando lo incultivable: el coronavirus humano HKU1 infecta, replica y produce viriones progenie en cultivos de células epiteliales de las vías respiratorias humanas ciliadas". Journal of Virology . 84 (21): 11255–11263. doi :10.1128/JVI.00947-10. ISSN  0022-538X. PMC 2953148 . PMID  20719951. 
  8. ^ Huang, Xingchuan; Dong, Wenjuan; Milewska, Aleksandra; Golda, Anna; Qi, Yonghe; Zhu, Quan K.; Marasco, Wayne A.; Baric, Ralph S.; Sims, Amy C.; Pyrc, Krzysztof; Li, Wenhui; Sui, Jianhua (15 de julio de 2015). Perlman, S. (ed.). "La proteína Spike del coronavirus humano HKU1 utiliza ácido siálico O-acetilado como determinante del receptor de unión y emplea la proteína hemaglutinina-esterasa como enzima destructora del receptor". Revista de Virología . 89 (14): 7202–7213. doi :10.1128/JVI.00854-15. ISSN  0022-538X. PMC 4473545 . Número de modelo:  PMID25926653. 
  9. ^ Pronker, Matti F.; Creutznacher, Robert; Drulyte, Ieva; Hulswit, Rubén JG; Li, Zeshi; Van Kuppeveld, Frank JM; Snijder, Joost; Lang, Yifei; Bosch, Berend-Jan; Bendiciones, Geert-Jan; Frank, Martín; Groot, Raoul J. de; Hurdiss, Daniel L. (2023). "La unión de sialoglicano desencadena la apertura de picos en un coronavirus humano". bioRxiv 10.1101/2023.04.20.536837 . 
  10. ^ Milewska, Aleksandra; Falkowski, Katherine; Kulczycka, Magdalena; Bielecka, Ewa; Naskalska, Antonina; Mak, Pawel; Lesner, Adán; Ochman, Marek; Urlik, Maciej; Diamandis, Elftherios; Prassas, Ioannis; Potempa, enero; Kantyka, Tomasz; Pyrc, Krzysztof (24 de noviembre de 2020). "La calicreína 13 sirve como proteasa cebadora durante la infección por el coronavirus humano HKU1". Señalización científica . 13 (659). doi : 10.1126/scisignal.aba9902. ISSN  1945-0877. PMC 7857416 . PMID  33234691. 
  11. ^ Fung, To Sing; Liu, Ding Xiang (2019). "Coronavirus humano: interacción huésped-patógeno". Revisión anual de microbiología . 73 : 529–557. doi : 10.1146/annurev-micro-020518-115759 . PMID  31226023.
  12. ^ Leung, Daniel (20 de enero de 2019). «Coronavirus (incluido el SARS)». Asesor de enfermedades infecciosas . Decision Support in Medicine, LLC. Archivado desde el original el 16 de abril de 2021. Consultado el 1 de agosto de 2020 .
  13. ^ Kirchdoerfer, Robert N.; Cottrell, Christopher A.; Wang, Nianshuang; Pallesen, Jesper; Yassine, Hadi M.; Turner, Hannah L.; Corbett, Kizzmekia S.; Graham, Barney S.; McLellan, Jason S.; Ward, Andrew B. (marzo de 2016). "Estructura de prefusión de una proteína de la espícula del coronavirus humano". Nature . 531 (7592): 118–121. Bibcode :2016Natur.531..118K. doi : 10.1038/nature17200 . PMC 4860016 . PMID  26935699. 
  14. ^ Hurdiss DL, Drulyte I, Lang Y, Shamorkina TM, Pronker MF, van Kuppeveld FJ, Snijder J, de Groot RJ (16 de noviembre de 2020). "La estructura crio-EM de la esterasa de hemaglutinina del coronavirus-HKU1 revela cambios arquitectónicos derivados de la circulación prolongada en humanos". Nature Communications . 11 (1): 4646. Bibcode :2020NatCo..11.4646H. doi : 10.1038/s41467-020-18440-6 . PMC 7495468 . PMID  32938911. 
  15. ^ Sloots, T; McErlean, P; Speicher, D; Arden, K; Nissen, M; MacKay, I (2006). "Evidencia de coronavirus humano HKU1 y bocavirus humano en niños australianos". Revista de Virología Clínica . 35 (1): 99–102. doi : 10.1016/j.jcv.2005.09.008 . PMC 7108338 . PMID  16257260. 
  16. ^ Esper, Frank; Weibel, Carla; Ferguson, David; Landry, Marie L.; Kahn, Jeffrey S. (2006). "Infección por coronavirus HKU1 en los Estados Unidos". Enfermedades infecciosas emergentes . 12 (5): 775–9. doi :10.3201/eid1205.051316. PMC 3374449 . PMID  16704837. 
  17. ^ Vabret, A.; Dina, J.; Gouarin, S.; Petitjean, J.; Corbet, S.; Freymuth, F. (2006). "Detección del nuevo coronavirus humano HKU1: un informe de 6 casos". Enfermedades infecciosas clínicas . 42 (5): 634–9. doi : 10.1086/500136 . PMC 7107802 . PMID  16447108. 

Enlaces externos