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Recombinasa

Las recombinasas son enzimas de recombinación genética .

Recombinasas específicas del sitio

Las recombinasas de ADN se utilizan ampliamente en organismos multicelulares para manipular la estructura de los genomas y controlar la expresión génica . Estas enzimas, derivadas de bacterias ( bacteriófagos ) y hongos , catalizan reacciones de intercambio de ADN sensibles a la dirección entre secuencias de sitios diana cortas (30-40 nucleótidos ) que son específicas de cada recombinasa . Estas reacciones permiten cuatro módulos funcionales básicos: escisión/inserción, inversión, translocación e intercambio de casetes , que se han utilizado individualmente o combinados en una amplia gama de configuraciones para controlar la expresión génica. [1] [2] [3] [4] [5]

Los tipos incluyen:

Recombinación homóloga

Las recombinasas desempeñan un papel central en la recombinación homóloga en una amplia gama de organismos. Dichas recombinasas se han descrito en arqueas , bacterias , eucariotas y virus .

Arqueas

La recombinasa RadA del arqueón Sulfolobus solfataricus cataliza el apareamiento de ADN y el intercambio de cadenas, pasos centrales en la reparación recombinacional. [6] La recombinasa RadA tiene mayor similitud con la recombinasa eucariota Rad51 que con la recombinasa bacteriana RecA. [6]

Bacteria

La recombinasa RecA parece estar presente en todas las bacterias. RecA tiene múltiples funciones, todas relacionadas con la reparación del ADN . RecA tiene un papel central en la reparación de las horquillas de replicación bloqueadas por el daño del ADN y en el proceso sexual bacteriano de transformación genética natural . [7] [8]

Eucariotas

La Rad51 eucariota y los miembros de su familia relacionados son homólogos de las recombinasas RadA arqueal y RecA bacteriana. La Rad51 está altamente conservada desde la levadura hasta los humanos. Tiene una función clave en la reparación recombinacional de los daños en el ADN, en particular los daños en la doble cadena, como las roturas de la doble cadena. En los humanos, la sobreexpresión o subexpresión de la Rad51 se produce en una amplia variedad de cánceres .

Durante la meiosis, Rad51 interactúa con otra recombinasa, Dmc1 , para formar un filamento presináptico que es un intermediario en la recombinación homóloga . [9] La función de Dmc1 parece estar limitada a la recombinación meiótica. Al igual que Rad51, Dmc1 es homóloga de RecA bacteriana.

Virus

Algunos virus de ADN codifican una recombinasa que facilita la recombinación homóloga. Un ejemplo bien estudiado es la recombinasa UvsX codificada por el bacteriófago T4 . [10] UvsX es homóloga a RecA bacteriana. UvsX, como RecA, puede facilitar la asimilación de ADN monocatenario lineal en un dúplex de ADN homólogo para producir un bucle D.

Referencias

  1. ^ Nern, A; Pfeiffer, BD; Svoboda, K ; Rubin, GM (23 de agosto de 2011). "Múltiples nuevas recombinasas específicas de sitio para su uso en la manipulación de genomas animales". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 108 (34): 14198–203. Bibcode :2011PNAS..10814198N. doi : 10.1073/pnas.1111704108 . PMC  3161616 . PMID  21831835.
  2. ^ García-Otín, AL; Guillou, F (1 de enero de 2006). "Objetivo del genoma de mamíferos mediante recombinasas específicas de sitio". Frontiers in Bioscience . 11 : 1108–36. doi : 10.2741/1867 . PMID  16146801.
  3. ^ Dymecki, SM; Kim, JC (5 de abril de 2007). "Las "tres G" de la neuroanatomía molecular: una introducción". Neuron . 54 (1): 17–34. doi :10.1016/j.neuron.2007.03.009. PMC 2897592 . PMID  17408575. 
  4. ^ Luan, H; White, BH (octubre de 2007). "Métodos combinatorios para la focalización refinada de genes neuronales". Current Opinion in Neurobiology . 17 (5): 572–80. doi :10.1016/j.conb.2007.10.001. PMID  18024005. S2CID  36457021.
  5. ^ Fenno, LE; Mattis, J; Ramakrishnan, C; Hyun, M; Lee, SY; He, M; Tucciarone, J; Selimbeyoglu, A; Berndt, A; Grosenick, L; Zalocusky, KA; Bernstein, H; Swanson, H; Perry, C; Diester, I; Boyce, FM; Bass, CE; Neve, R; Huang, ZJ; Deisseroth, K (julio de 2014). "Dirigir células con vectores únicos utilizando lógica booleana de múltiples características". Nature Methods . 11 (7): 763–72. doi :10.1038/nmeth.2996. PMC 4085277 . PMID  24908100. 
  6. ^ ab Seitz EM, Brockman JP, Sandler SJ, Clark AJ, Kowalczykowski SC (1998). "La proteína RadA es un homólogo de la proteína RecA arqueal que cataliza el intercambio de cadenas de ADN". Genes Dev . 12 (9): 1248–53. doi :10.1101/gad.12.9.1248. PMC 316774 . PMID  9573041. 
  7. ^ Cox MM, Goodman MF, Kreuzer KN, Sherratt DJ, Sandler SJ, Marians KJ (2000). "La importancia de reparar las horquillas de replicación estancadas". Nature . 404 (6773): 37–41. Bibcode :2000Natur.404...37C. doi :10.1038/35003501. PMID  10716434. S2CID  4427794.
  8. ^ Michod RE, Bernstein H, Nedelcu AM (2008). "Valor adaptativo del sexo en patógenos microbianos". Infect. Genet. Evol . 8 (3): 267–85. Bibcode :2008InfGE...8..267M. doi :10.1016/j.meegid.2008.01.002. PMID  18295550.
  9. ^ Crickard JB, Kaniecki K, Kwon Y, Sung P, Greene EC (2018). "Autosegregación espontánea de las recombinasas de ADN Rad51 y Dmc1 dentro de filamentos de recombinasa mixta". J. Biol. Chem . 293 (11): 4191–4200. doi : 10.1074/jbc.RA117.001143 . PMC 5858004. PMID  29382724 . 
  10. ^ Bernstein C, Bernstein H (2001). Reparación del ADN en bacteriófagos. En: Nickoloff JA, Hoekstra MF (Eds.) DNA Damage and Repair, Vol. 3. Advances from Phage to Humans. Humana Press, Totowa, NJ, págs. 1–19. ISBN 978-0896038035 

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