En 1522 su tío murió, y Buchanan, que no podía continuar sin recursos en París, regresó a Escocia.Al año siguiente ingresó en la Universidad de Sant Andrews, en donde se graduó como Bachelor of Arts en 1525.En 1539 hubo una gran persecución contra los luteranos y arrestaron a Buchanan entre otros.Aquí, sin embargo, encontró a su enemigo, el cardenal David Beaton, que residía en la capital francesa como embajador.En 1542 o 1543 volvió a París, y en 1544 fue designado regente en la universidad de Cardinal le Moine.Buchanan se defendió con capacidad, valor y franqueza, admitiendo que algunos de los cargos eran verdaderos.En sus ratos de ocio comenzó a traducir los salmos al verso latino.Fue en este momento cuando Buchanan abrazó abiertamente el protestantismo y en 1566 fue designado como director del St Leonard's College.Su situación económica era próspera al recibir las rentas de una abadía que la reina le había otorgado como señorío.Su estilo no es comparable a la frialdad de ningún autor clásico, sino que tiene una frescura y elasticidad propias.
