Michael Christopher Wendl

Michael Christopher Wendl es un matemático e ingeniero biomédico que ha trabajado en la teoría de la secuenciación del ADN , ^[3] cubriendo y emparejando problemas de probabilidad, mecánica teórica de fluidos y coescribió Phred . ^[4] Fue científico del Proyecto Genoma Humano y ha realizado trabajos de bioinformática y bioestadística en cáncer. Wendl es de ascendencia étnica alemana y es hijo del ingeniero aeroespacial Michael J. Wendl . ^[5]

Trabajo de investigación

Mecánica de fluidos teórica

El problema del flujo con un número de Reynolds bajo en el espacio entre dos cilindros infinitos, el llamado flujo de Couette , fue resuelto en 1845 por Stokes . ^[6] Wendl informó la generalización de esta solución para cilindros de longitud finita, ^{[2] [7]} que en realidad puede construirse para trabajo experimental, en 1999, como una serie de funciones de Bessel modificadas y . También examinó una variedad de otros dispositivos rotacionales de bajo número de Reynolds y dispositivos accionados por corte, incluida una forma general del problema del flujo de disco inestable, para el cual el perfil de velocidad es: ^[8] ${\displaystyle I_{1}}$ ${\displaystyle K_{1}}$

${\displaystyle u(r,z,t)=\Re \left(e^{i\sigma t}\left[{\frac {r\cdot \sinh(1+i)\beta z}{\sinh(1+i)\beta \phi }}\right]+{\frac {2}{\phi }}\sum _{j=1}^{\infty }{\frac {(-1)^{j}\cdot \alpha _{j}^{2}\cdot \sin(\alpha _{j}z)\cdot I_{1}\left({\sqrt {iR\sigma +\alpha _{j}^{2}}}r\right)}{(iR\sigma +\alpha _{j}^{2})\cdot I_{1}\left({\sqrt {iR\sigma +\alpha _{j}^{2}}}\right)}}\right)}$

donde , , y son parámetros físicos, son valores propios y son coordenadas. Este resultado unió casos especiales publicados anteriormente para flujo estacionario, discos infinitos, etc. ^[8] ${\displaystyle \sigma }$ ${\displaystyle R}$ ${\displaystyle \beta }$ ${\displaystyle \phi }$ ${\displaystyle \alpha _{j}}$ ${\displaystyle (r,z,t)}$

Cubrir y emparejar problemas de probabilidad

Wendl examinó una serie de problemas de coincidencia y cobertura en probabilidad combinatoria, especialmente porque estos problemas se aplican a la biología molecular. Determinó la distribución de los recuentos de coincidencias de pares de conjuntos múltiples de enteros en términos de polinomios de Bell , ^[9] un problema directamente relevante para el mapeo físico del ADN . Antes de esto, los investigadores habían utilizado varios cuantificadores ad hoc, como la puntuación de Sulston , que idealizaba los ensayos de emparejamiento como independientes. Su resultado para la propuesta de cumpleaños de grupos múltiples ^[10] resuelve varios "problemas de colisión" relacionados, por ejemplo, algunos tipos de búsqueda P2P . ^[11] También ha examinado una variedad de problemas de cobertura unidimensionales (ver revisión de Cyril Domb ^[12] ), generalizando la configuración básica a formas relevantes para la biología molecular. ^{[13] [14]} Su investigación de cobertura de variantes raras de ADN con Richard K. Wilson ^[15] jugó un papel en el diseño del Proyecto 1000 Genomas . ^[dieciséis]

Bioinformática y Bioestadística

Wendl coescribió Phred , un analizador de trazas de ADN ampliamente utilizado que convertía el flujo de salida sin procesar de las primeras máquinas de secuenciación de ADN en cadenas de secuencia. ^{[17] [18]} Ha contribuido ampliamente al análisis bioestadístico de estudios sobre el cáncer ^{[19] [20]} y a la base de herramientas bioinformáticas, ^[21] colaborando frecuentemente con Li Ding , Elaine Mardis y Richard K. Wilson .

Vida personal

La herencia de Wendl es étnica alemana, originaria de la región de Banat del antiguo Imperio austrohúngaro y es hijo del ingeniero aeroespacial Michael J. Wendl . ^[5] Está casado con la ex Pamela Bjerkness de Chicago ^[22]

enlaces externos

• Michael Christopher Wendl en el Proyecto de Genealogía de Matemáticas
• Publicaciones de Michael Christopher Wendl indexadas por Google Scholar
• Michael Wendl en la base de datos de Engineering Tree

Referencias

1. "Michael Wendl: el proyecto de genealogía de las matemáticas".
2. Bordag LA et al. (2005) Interacción de un movimiento de rotación y un flujo axial en geometrías pequeñas para un problema de Taylor-Couette , J. Fluids and Structures 20 (5), 621–641. Los autores comentan directamente sobre la solución de Wendl que apareció mucho tiempo después del problema clásico discutido por Stokes en 1845: "También es un poco sorprendente que la solución analítica exacta para el componente azimutal del perfil de flujo de Taylor-Couette con condiciones de contorno en las tapas de los cilindros fuera obtenido recientemente en el trabajo de Wendl (1999). Sus resultados exponen la fuerte influencia de los límites en los perfiles de flujo".
3. Dorman, N (2006) En resumen , BioTechniques 41 (4), págs.367.
4. Ewing, B., Hillier, L. , Wendl, MC y Green, P. (1998) Llamada base de trazas de secuenciador automatizado utilizando phred. I. Evaluación de la precisión. Investigación del genoma 8 (3), 175–185. PMID  9521921 artículo completo
5. P Hummel y N Fuhry: "Sackelhausen im Banat" Volumen 3, publicado por Heimatsortsgemeinschaft Sackelhausen, Reutlingen FRG, 2007, páginas 2236-2237.
6. GG Stokes (1845) ``Sobre las teorías de la fricción interna de fluidos en movimiento y del equilibrio y movimiento de sólidos elásticos, en Mathematical and Physical Papers, págs. 102-104, Cambridge, Reino Unido: Cambridge University Press, 1880 .
7. Wendl MC (1999) Solución general para el perfil de flujo de Couette , Revisión física E 60 (5), 6192–6194.
8. Wendl MC (2001) Análisis matemático de dispositivos de carga de corte celular de disco coaxial, Review of Scientific Instruments 72(11), 4212-4217.
9. Wendl MC (2005) Evaluación probabilística de superposiciones de clones en el mapeo de huellas dactilares de ADN mediante modelos a priori, J. Comp. Biol. 12(3), 283-297.
10. Wendl MC (2003) Probabilidad de colisión entre conjuntos de variables aleatorias , Stat. Prob. Letón. 64 (3), 249–254.
11. Hautakorpi, J y Schultz, G (2010) Un estudio de viabilidad de una búsqueda arbitraria en redes estructuradas punto a punto , IEEE Computer Communications and Networks, Proc ICCCN, págs. 1–8.
12. Cyril Domb (1989) Cobertura mediante intervalos aleatorios y percolación continua unidimensional , J. Stat. Física. 55, 441-460.
13. Wendl MC (2008) Cobertura aleatoria de múltiples dominios finitos unidimensionales con una aplicación a la secuenciación de ADN, SIAM J. Appl. Matemáticas. 68(3), 890-905.
14. Wendl MC, Kota K, Weinstock GM y Mitreva M (2013) Teorías de cobertura para la secuenciación metagenómica del ADN basadas en una generalización del teorema de Stevens, J. Math. Biol. 67(5), 1141-1161.
15. Wendl MC y Wilson RK (2009) La teoría del descubrimiento de variantes raras mediante la secuenciación del ADN, BMC Genomics 10 art. 485.
16. Altshuler DM y col. (2010) Un mapa de la variación del genoma humano a partir de la secuenciación a escala poblacional, Nature 467(7319), 1061-1073.
17. Koboldt, DC y Miller, RD (2011) Identificación de marcadores polimórficos para mapeo genético , capítulo 2 de "Genómica: métodos esenciales", John Wiley and Sons.
18. Highsmith, WE (2006) Métodos electroforéticos para la detección de mutaciones y secuenciación de ADN , capítulo 9 de "Diagnóstico molecular para el laboratorio clínico", Humana Press
19. Lu C, Xie M, Wendl MC y col. (2015) Patrones e implicaciones funcionales de variantes raras de la línea germinal en 12 tipos de cáncer, Nature Comm. 6 arte. 10086.
20. Chen, F, Wendl MC, Wyczalkowski MA, Bailey MH, Li Y y Ding, L (2015) Traslado de los estudios pan-cáncer de la investigación básica a la clínica, Nature Cancer 2(9), 879-890.
21. Wendl MC y col. (2011) PathScan: una herramienta para discernir el significado mutacional en grupos de genes putativos de cáncer, Bioinformatics 27(12), 1595-1602.
22. Hochzeitsglocken lauteten fur Pamela Marie y Michael Christopher Wendl, Eintracht 74 (13), página 6.