Este ataque despierta su Persona interior, Orpheus, su única oportunidad para vencer a estas criaturas de la noche.
El protagonista se une al grupo "Specialized Extracurricular Execution Squad" (Unidad Extraescolar Especializada en Ejecuciones -de sus misiones-, SEES), y con sus compañeros, lucha contra la amenaza de las sombras, y a la vez que exploran el Tartarus, una extraña y gigantesca torre repleta de peligros en la que se transforma la escuela durante la Dark Hour.
Aquí la escuela toma un rol importante, donde debes acudir a eventos escolares, clubes, estudiar, atender asuntos con otros personajes; pero cuando llega la noche, se debe explorar el Tartarus (dependiendo de tu condición física).
El Tartarus, es una "torre-laberinto" infestada de monstruos llamados Shadows, en cual se transforma la escuela a la medianoche.
En pelea, los personajes son ayudados por sus Personas, seres que son llamados con la ayuda de un instrumento en forma de pistola llamada "Evoker" (Evocador), con el cual deben apuntarse a la cabeza y dispararse para invocar a su Persona.
En combate solo se controla al personaje principal, mientras que sus compañeros ejercen sus turnos mediante inteligencia artificial u ordenar a tus compañeros específicos Comandos directos, a pesar de esto se le pueden dar parámetros de estrategia a tus aliados si el jugador lo desea o no.
Igor Seiyū: Isamu Tanonaka El 19 de abril de 2007, Atlus lanzó un disco extra para el juego Persona 3, llamado Persona 3 FES (ペルソナ3フェス) una versión con extras varios al cual también se le puede catalogar como una "expansión" del título original, ya que Atlus puso a la venta el título en 2 versiones o formatos, la "Independent Starting Version" la cual no requiere de tener una copia del título original para jugar Persona 3 FES y la "Append Edition" la cual es necesario tener una copia original de Persona 3 para poder comenzar a jugar.
Respecto a la versión original existen varios cambios: se elimina "The Answer" aunque se mantienen todos las demás mejoras de FES (además de agregar otras mejoras menores al juego), y se incluye una protagonista femenina con Social Links alternativos a los del protagonista masculino.
La protagonista femenina posee una nueva banda sonora compuesta por Shoji Meguro, y se agrega una intro cinemática exclusiva de este juego llamada "Soul Phrase".
[5] La adaptación, llamada Persona 3 The Weird Masquerade, era protagonizada por ambos protagonistas del juego, aunque nunca en la misma sesión.