Esta lista de genomas de hongos secuenciados contiene todas las especies de hongos que se sabe que tienen secuencias genómicas completas disponibles públicamente que han sido ensambladas, anotadas y publicadas; No se incluyen borradores de genomas ni secuencias exclusivas de orgánulos.
ascomicota
Dotideomicetos
- Aureobasidium pullulans , A. melanogenum , A. subglaciale y A. namibiae , poliextremotolerantes (2014 [1] )
- Hortaea werneckii , extremadamente halotolerante (2013 [2] 2017 [3] )
- Leptosphaeria maculans , patógeno vegetal (2011 [4] )
- Macrophomina Phaseolina , patógeno vegetal (2012 [5] )
- Mycosphaerella fijiensis , patógeno vegetal (2007 [6] )
- Mycosphaerella graminicola IPO323, patógeno del trigo (2008 [7] )
- Phaeosphaeria nodorum SN15, patógeno del trigo (2005 [8] )
- Pyrenophora tritici-repentis Pt-1C-BFP, patógeno del trigo (2007 [9] )
Eurotiomicetos
- Ajellomyces capsulata varias cepas , enfermedad de Darling (2009, inédito [10] )
- Ajellomyces dermatitidis varias cepas (2009, no publicado [11] )
- Arthroderma benhamiae CBS 112371 , infección de la piel (2010, no publicado [12] )
- Arthroderma gypseum CBS 118893 , pie de atleta (2008 [13] )
- Arthroderma otae CBS 113480 , pie de atleta (2008 [13] )
- Aspergillus aculeatus ATCC16872, uso industrial (2010 [14] )
- Aspergillus carbonarius ARTÍCULO 5010, patógeno alimentario (2009 [15] )
- Cepa Aspergillus clavatus : NRRL1 (2008 [16] )
- Cepa Aspergillus fumigatus : A1163, patógeno humano (2008 [16] )
- Cepa de Aspergillus fumigatus : Af293, patógeno humano (2005 [17] )
- Aspergillus kawachii IFO 4308, industria alimentaria (2011 [18] )
- Cepa Aspergillus nidulans : FGSC A4, organismo modelo (2005 [19] )
- Cepa de Aspergillus niger : ATCC 1015 (Instituto Conjunto del Genoma del DOE)
- Cepa Aspergillus niger : CBS 513.88, uso industrial (2007 [20] )
- Cepa Aspergillus oryzae : RIB40, uso industrial (2005 [21] )
- Aspergillus terreus NIH 2624, productor de estatinas y patógeno (2005, no publicado [22] )
- Coccidioides immitis , patógeno humano, fiebre del valle (2009 [23] )
- Coccidioides posadasii C735 delta SOWgp , patógeno humano, fiebre del valle (2009 [23] )
- Cepa Neosartorya fischeri : NRRL181 (2008 [16] )
- Paracoccidioides brasiliensis , varias cepas, patógeno humano (2007 [24]
- Cepa de Penicillium chrysogenum : Wisconsin54-1255, uso industrial (2008 [25] )
- Penicillium digitatum Cepa PHI26 (2012 [26] )
- Penicillium digitatum cepa Pd1 (2012 [26]
- Talaromyces marneffei , patógeno humano (2011 [27]
- Uncinocarpus reesii (2009 [23] )
Leotiomicetos
pezizomicetos
- Cladobotryum protrusum (2019 [31] )
- Tuber melanosporum Mel28 , trufa negra del Périgord (2010 [32] )
sacaromicetos
- Cepa Ashbya gossypii : ATCC 10895, patógeno vegetal (2004 [33] )
- Cepa Candida albicans : SC5314, patógeno humano (2004 [34] )
- Cepa Candida albicans : WO-1, patógeno humano (2009 [35] )
- Candida dubliniensis CD36, patógeno humano (2009 [36] )
- Cepa Candida glabrata : CBS138, patógeno humano (2004 [37] )
- Candida guilliermondii , patógeno humano (2009 [35] )
- Candida lusitaniae , patógeno humano (2009 [35] )
- Candida parapsilosis , patógeno humano (2009 [35] )
- Candida ortopsilosis , patógeno humano (2012 [38] )
- Candida tropicalis , patógeno humano (2009 [35] )
- Cepa Debaryomyces hansenii : CBS767, uso industrial (2004 [37] )
- Cepa Debaryomyces hansenii : MTCC 234, tolerante a la sal (2012 [39] )
- Cepa Dekkera bruxellensis : CBS2499, levadura de vino (2012 [40] )
- Hansenula polymorpha NCYC 495 leu1.1, uso industrial (2010 [41] )
- Kluyveromyces aestuarii ATCC 18862 (2010, inédito [42] )
- Cepa Kluyveromyces lactis : CLIB210, uso industrial (2004 [37] )
- Kluyveromyces wickerhamii UCD 54-210 (2010, inédito [43] )
- Lachancea kluyveri ( Saccharomyces kluyveri ) NRRL Y-12651 , patógeno vegetal (2009 [44] )
- Lodderomyces elongisporus , patógeno humano (2009 [35] )
- Cepa Naumovozyma castellii : AS 2.2404, CBS 4309 ( Saccharomyces castellii ; 2003, [45] 2011 [46] )
- Cepa Naumovozyma dairenensis : CBS 421 (2011 [46] )
- Saccharomyces bayanus (2003, [45] [47] 2011 [48] )
- Saccharomyces arboricolus (2013, [49] )
- Cepa Saccharomyces cerevisiae : JAY291, industrial/modelo (2009 [50] )
- Cepa Saccharomyces cerevisiae : S288C, industrial/modelo (1996 [51] )
- Cepa Saccharomyces cerevisiae : Sigma1278b, industrial/modelo (2010 [52] )
- Saccharomyces kudriavzevii (2003 [45] [48] )
- Saccharomyces mikatae (2003, [45] [47] 2011 [48] )
- Saccharomyces paradoxus (2003 [47] 2009 [53] )
- Saccharomyces pastorianus Weihenstephan 34/70 , industrial, cerveza (2009 [54] )
- Scheffersomyces stipitis ( Pichia stipitis ) CBS 6054, degradador de lignina/xilosa (2007 [55] )
- Spathaspora passalidarum NRRL Y-27907, fermentador de xilosa modelo (2010 [56] )
- Tetrapisispora phaffii van der Walt Y 89, CBS 4417 (2011 [46] )
- Cepa Torulaspora delbrueckii : Wallerstein 129, CBS 1146 (2011 [46] )
- Vanderwaltozyma polispora DSM 70294 (2007 [57] )
- Cepa Yarrowia lipolytica : CLIB99, uso industrial (2004 [37] )
- Cepa CBS732 de Zygosaccharomyces rouxii , alterador de alimentos (2009 [44] )
esquizosacaromicetos
- Schizosaccharomyces japonicus yFS275, modelo de crecimiento invasivo (2006 [58] )
- Schizosaccharomyces pombe Cepa: 972h, modelo eucariota (2002 [59] )
Sordariomicetos
- Colletotrichum graminicola , patógeno del maíz (2012 [60] )
- Colletotrichum higginsianum , patógeno de Arabidopsis thaliana (2012 [60] )
- Cepa Chaetomium cochliodes : CCM F-232, hongo del suelo (2016 [61] )
- Cepa Chaetomium globosum : CBS 148.51, hongo del suelo (2005 [62] )
- Cepa Chaetomium thermophilum : CBS 144.50, hongo del suelo (2011 [63] )
- Fusarium oxysporumf . sp. lycopersici 4287, patógeno humano/planta (2010 [64] )
- Gibberella moniliformis 7600, patógeno vegetal (2010 [64] )
- Gibberella zeae PH-1, patógeno vegetal (2008 [65] )
- Gaeumannomyces graminis tritici R3-111a-1 (2010, inédito [66] )
- Grosmannia clavigera kw1407, patógeno vegetal (2011 [67] )
- Magnaporthe grisea , patógeno vegetal (20054 [68] )
- Metarhizium acridum CQMa 102, y
- Metarhizium anisopliae ARSEF 23, insectos patógenos (2011 [69] )
- Neurospora crassa , modelo eucariota (2003 [70] )
- Neurospora tetrasperma FGSC 2508 mat A, modelo (2010 [71] )
- Nectria haematococca MPVI , degradador de plástico/plagas/lignina (2009 [72] )
- Podospora anserina :S mat+ [73]
- Sporotrichum thermophile , degradador termófilo de celulosa (2010 [74] )
- Thielavia terrestris , modelo termófila/industrial (2010 [75] )
- Trichoderma atroviride , industrial/suelo, (2010 [76] )
- Trichoderma reesei QM6a , degradador de biomasa (2008 [77] )
- Trichoderma virens Gv29-8, industrial/patógeno (2007 [78] )
- Verticillium albo-atrum VaMs.102, patógeno vegetal (2008, no publicado [79] )
basidiomicota
Agaricomicetos
- Agaricus bisporus var. Cepa bisporus : H97, champiñón (2009 [80] )
- Agrocybe aegerita , ack Álamo o hongo cinturón de espada (2018 [81] )
- Auricularia delicada (2012 [82] )
- Auricularia heimuer , Auricularia china (2019 [83] )
- Coniophora puteana (2012 [82] )
- Coprinopsis cinerea ( Coprinus cinereus ), organismo modelo para hongos multicelulares (2010 [84] )
- Dichomitus squalens (2012 [82] )
- Cepa de Fibroporia radiculosa : TFFH 294 (2012 [85] )
- Fomitiporia mediterránea (2012 [82] )
- Fomitopsis pinicola (2012 [82] )
- Cepa de Ganoderma leucocontextum :GL72 (2023) [86]
- Gloeophyllum trabeum (2012 [82] )
- Hebeloma cylindrosporum http://genome.jgi.doe.gov/Hebcy2/Hebcy2.home.html
- Heterobasidion annosum , patógeno vegetal (2009 [87] )
- Cepa Laccaria bicolor : S238N-H82, micorrizas (2008 [88] )
- Lentinula edode s , hongo shiitake (2016 [89] )
- Moniliophthora perniciosa , Enfermedad de la escoba de bruja del cacao (2008 [90] )
- Oudemansiella raphanipes, hongo comestible " Changgengu"(2023 [91] )
- Cepa Phanerochaete chrysosporium : RP78, micomediación (2004 [92] )
- Endófito Piriformospora indica (2011 [93] )
- Pleurotus ostreatus , degradador industrial/de lignina (2010 [94] )
- Pleurotus tuber-regium , hongo de pudrición blanca (2018 [95] )
- Postia placenta , degradador de celulosa (2008 [77] [96] )
- Punctularia strigosozonata (2012 [82] )
- Comuna de Schizophyllum , hongo (2010 [97] )
- Serpula lacrymans , patógeno vegetal (2011 [98] )
- Stereum hirsutum (2012 [82] )
- Trametes versicolor (2012 [82] )
- Wolfiporia cocos (2012 [82] )
dacrimicetos
Pucciniomicetos (anteriormente Urediniomicetos )
Tremelomicetos
ustilaginomicetos
Wallemiomicetos
quitridiomicota
Chytridiomycota incluye hongos con esporas que tienen flagelos ( zoosporas ) y son un grupo hermano de hongos terrestres más avanzados que carecen de flagelos. Varias especies de quitridios son patógenos, pero aún no se han secuenciado sus genomas.
Blastocladiomicota
Neocallimastigomycota
microsporidios
mucoromycota
mucoromicotina
glomeromicotina
Mortierellomicotina
zoopagomicota
Kickxelomicotina
- Coemansia inversa
- Coemansia espiralis
- Kickxella alabastrina
- Linderina pennicpora
- Martensiomyces pterosporus
- Ramicandelaber brevisporus
- Smittium culicis
- Smittium mucronatum
- Zancudomyces culisetae
Entomoftoromicotina
zoopagomicotina
- Syncephalis fuscata
- Syncephalis plumigaleata
- Syncephalis pseudoplumileata
- Piptocephalis cilindrospora
Ver también
enlaces externos
- Iniciativa sobre el genoma de hongos (incluye borradores de genomas)
- Consulta UniProt (proteoma completo y hongos)
Referencias
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