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Coprinopsis cinerea

Coprinopsis cinerea es una especie de hongo de la familia Psathyrellaceae . Comúnmente conocido como hongo gris , es comestible , pero debe usarse inmediatamente después de recolectarlo. [2]

Coprinopsis cinerea es un organismo modelo importante para estudiar el sexo y los tipos de apareamiento de los hongos , el desarrollo de los hongos [3] y la evolución de la multicelularidad de los hongos . La secuencia del genoma se publicó en 2010. [4] Se considera que es un organismo especialmente adecuado para estudiar la meiosis , debido a su desarrollo meiótico sincrónico y su profase prolongada . [5]

Investigación

Antibióticos

En 2014, los investigadores descubrieron una proteína producida por Coprinopsis cinerea con propiedades antibióticas. [6] La proteína, conocida como copsina , tiene efectos similares a otros antibióticos orgánicos no proteicos. Hasta la fecha, no se ha determinado si se pueden desarrollar antibióticos para humanos y otros animales a partir de esta proteína.

Cultivo

Coprinopsis cinerea se puede cultivar en medios complejos (p. ej., YMG, YMG/T) o mínimos (p. ej., medio mKjalke), sólidos o líquidos, con o sin agitación, a 25 °C u óptimamente a 37 °C. Se puede cultivar en oscuridad o con un ciclo de 12 h de luz/12 h de oscuridad. [7] [8]

Presiones

Genoma

La cepa Okayama 7 (#130) de Coprinopsis cinerea fue secuenciada con una cobertura de 10x en 2003. Una tercera y más reciente revisión de la secuencia de la cepa Okayama 7 (#130) fue publicada en 2010. Su genoma haploide tiene aproximadamente 37,5 Mb. [10]

Clonación molecular

Coprinopsis cinerea se puede transformar con ADN exógeno por transformación cuando el hongo es un protoplasto. Se encontró que la interrupción (knockout o silenciamiento de RNAi) del homólogo ku70 puede aumentar la focalización genética a través de una mayor recombinación homóloga. Se pueden utilizar protoplastos derivados de oidios o micelio vegetativo, sin embargo, se encontró que la focalización genética es mayor en un 2% (según el fenotipado) cuando se utiliza micelio vegetativo. [7] [8] De lo contrario, se puede utilizar la inserción de vectores integrativos de forma ectópica y con pequeñas regiones homólogas, probablemente con baja eficiencia de transformación. Anteriormente, se podía utilizar REMI (integración mediada por enzimas de restricción) para insertar ADN exógeno en el cromosoma para producir cepas mutantes. Esto se basa en la inserción de ADN exógeno y enzimas de restricción en la célula del protoplasto, lo que permite que las enzimas corten el cromosoma en sitios específicos que coinciden con los sitios utilizados para producir ADN plasmídico linealizado con el gen de interés; Posteriormente, las enzimas del huésped ligan los sitios de corte y producen así ADN heterólogo exógeno integrado. Aunque es un proceso exitoso, es probable que se produzcan mutaciones indeseables. [9] También se puede realizar mutagénesis química (también aleatoria). La selección del fenotipo de la incapacidad de fructificar puede indicar que la inserción provocó la interrupción de genes vitales. En general, la recombinación homóloga proporciona más especificidad a la hora de crear una cepa mutante. Dependiendo del mutante, se pueden utilizar marcadores de auxotrofia (requiere la inserción del gen perdido) o prototrofia (cuando se produce la eliminación de un gen esencial) para la selección.

Enzimas

Se sabe que Coprinopsis cinerea produce lacasa , un tipo de fenoloxidasa. C. cinerea produce una variedad de la misma lacasa, conocida como isoenzimas. La actividad de la lacasa se puede medir mediante zimogramas (en los que hay un sustrato para la enzima en un gel separador). En condiciones de estrés, temperatura y medio, la secreción de lacasa aumentó. Aunque el cobre es un cofactor necesario para la lacasa, la mera adición de cobre no indujo la secreción de lacasa. [11] Recientemente se descubrió que se identificó un homólogo de TET (dioxigenasas de translocación diez-once), CcTET , en C. cinerea , que puede tener importantes implicaciones humanas (o mamíferas), como el cáncer. La metilación del ADN es vital en los humanos y la disfunción está asociada con el cáncer, por lo tanto, estudiar las reacciones de metilación en no mamíferos puede proporcionar una mejor comprensión de las reacciones de metilación en mamíferos. [12]

Reproducción

Coprinopsis cinerea puede percibir la luz azul. Se identificó que el gen Cc.wc-2 está involucrado en la fotorrecepción de la luz azul. [7] Los estípites etiolizados (elongación sin maduración del sombrero) se producen cuando se cultivan sin luz. [13]

Mitosis

Coprinopsis cinerea es un modelo ideal para estudiar la meiosis porque la meiosis progresa sincrónicamente en alrededor de 10 millones de células dentro de cada sombrero de hongo. [14] La meiosis es un proceso especializado de división celular, que ocurre en células diploides, en el que ocurre una sola ronda de replicación de ADN, y es seguida por dos divisiones para producir cuatro núcleos hijos haploides. Durante la meiosis, los cromosomas homólogos se aparean entre sí y experimentan un proceso de reparación del ADN en el que se elimina el daño del ADN y se recombina la información genética. [ cita requerida ] Burns et al. [14] estudiaron la expresión de genes involucrados en el proceso meiótico de 15 horas que abarca los puntos de tiempo anteriores a la fusión nuclear haploide que forma el cigoto diploide hasta la formación final de los cuatro productos haploides. Compararon la expresión de genes particulares en C. cinerea con la expresión de genes comparables (ortólogos) en otras dos especies ( Saccharomyces cerevisiae y Schizosaccharomyces pombe ) de las que C. cinerea había divergido en la evolución hace 500 a 900 millones de años. Encontraron que la expresión de genes individuales se activaba o desactivaba en la misma etapa en C. cinerea que en las otras dos especies. También encontraron que los genes considerados específicamente involucrados en el proceso meiótico estaban más conservados en su patrón de expresión que los genes no meióticos. Estos hallazgos indican una conservación antigua del proceso meiótico.

Enfermedad humana

Coprinopsis cinerea es inofensiva para la salud humana y animal en condiciones normales. Sin embargo, el organismo puede causar infecciones oportunistas ( micosis ) en pacientes inmunodeprimidos , como aquellos que se han sometido a un trasplante de células madre hematopoyéticas o que están recibiendo otro tratamiento de inmunosupresión. [15] La mayoría de los casos notificados han sido infecciones respiratorias, pero se han notificado casos que afectan al corazón, la piel, el cerebro o el intestino, y las infecciones pueden volverse sistémicas rápidamente. [16] Aunque excepcionalmente rara, la infección por Coprinopsis cinerea es difícil de tratar y a menudo mortal en este grupo de pacientes vulnerables. La infección es causada por el anamorfo asexual (que no forma hongos) de Coprinopsis cinerea, que se parecía a un moho y que solía conocerse como Hormographiella aspergillata , y puede describirse con este nombre en la literatura clínica. [17] [18]

Véase también

Referencias

  1. ^ "Coprinopsis cinerea (Schaeff.) Redhead, Vilgalys & Moncalvo 2001". MycoBank . Asociación Micológica Internacional . Consultado el 16 de enero de 2011 .
  2. ^ McKnight VB, McKnight KH (1987). Una guía de campo para los hongos: América del Norte. Peterson Field Guides. Boston, Massachusetts: Houghton Mifflin. pág. 277. ISBN 978-0-395-91090-0.
  3. ^ Kües, U (2000). "Historia de vida y procesos de desarrollo en el basidiomiceto Coprinus cinereus". Microbiology and Molecular Biology Reviews . 64 (2): 316–53. doi :10.1128/MMBR.64.2.316-353.2000. PMC 98996 . PMID  10839819. 
  4. ^ Stajich JE, Wilke SK, Ahren D, et al. (29 de junio de 2010). "Información sobre la evolución de los hongos multicelulares a partir de los cromosomas ensamblados del hongo Coprinopsis cinerea (Coprinus cinereus)". PNAS . 107 (26): 11889–11894. doi : 10.1073/pnas.1003391107 . PMC 2900686 . PMID  20547848. 
  5. ^ Burns C, Stajich JE, Rechtsteiner A, et al. (2010). "El análisis del basidiomiceto Coprinopsis cinerea revela la conservación del programa de expresión meiótica central a lo largo de 500 millones de años de evolución". PLOS Genetics . 6 (9): e1001135. doi : 10.1371/journal.pgen.1001135 . PMC 2944786 . PMID  20885784. 
  6. ^ "Nuevo antibiótico en un hongo que crece en el estiércol de caballo". 7 de noviembre de 2014.
  7. ^ abc Selección eficiente de genes en mutantes ΔCc.ku70 o ΔCc.lig4 del agaricomiceto Coprinopsis cinerea.
  8. ^ ab Lcc1 y Lcc5 son las principales lacasas secretadas en cultivos líquidos de cepas de Coprinopsis cinerea
  9. ^ ab Integración de ADN mediada por enzimas de restricción en Coprinus cinereus
  10. ^ "Proyecto Genoma de Coprinopsis cinerea". 15 de mayo de 2015.
  11. ^ Lcc1 y Lcc5 son las principales lacasas secretadas en cultivos líquidos de cepas de Coprinopsis cinerea
  12. ^ Una proteína homóloga de TET de Coprinopsis cinerea (CcTET) que convierte bioquímicamente la 5-metilcitosina en 5-hidroximetilcitosina, 5-formilcitosina y 5-carboxilcitosina
  13. ^ Historia de vida y procesos de desarrollo del basidiomiceto Coprinus cinereus
  14. ^ ab Burns C, Stajich JE, Rechtsteiner A, Casselton L, Hanlon SE, Wilke SK, Savytskyy OP, Gathman AC, Lilly WW, Lieb JD, Zolan ME, Pukkila PJ (septiembre de 2010). "El análisis del basidiomiceto Coprinopsis cinerea revela la conservación del programa de expresión meiótica central a lo largo de 500 millones de años de evolución". PLOS Genet . 6 (9): e1001135. doi : 10.1371/journal.pgen.1001135 . PMC 2944786 . PMID  20885784. 
  15. ^ Bojic M, Willinger B, Rath T, Tobudic S, Thalhammer F, Böhm A, Mitterbauer M, Schulenburg A, Wöhrer S, Kalhs P, Rabitsch W. Infección mortal de la piel y los pulmones causada por Hormographiella aspergillata en un paciente con leucemia: informe de caso y revisión de la literatura. Micosis. Noviembre de 2013;56(6):687-9.
  16. ^ Correa-Martinez C, Brentrup A, Hess K, Becker K, Groll AH, Schaumburg F. Primera descripción de una infección local de piel y tejidos blandos causada por Coprinopsis cinerea. Nuevos microbios y nuevas infecciones. 1 de enero de 2018;21:102-4.
  17. ^ Bojic M, Willinger B, Rath T, Tobudic S, Thalhammer F, Böhm A, Mitterbauer M, Schulenburg A, Wöhrer S, Kalhs P, Rabitsch W. Infección mortal de la piel y los pulmones causada por Hormographiella aspergillata en un paciente con leucemia: informe de caso y revisión de la literatura. Micosis. Noviembre de 2013;56(6):687-9.
  18. ^ Correa-Martinez C, Brentrup A, Hess K, Becker K, Groll AH, Schaumburg F. Primera descripción de una infección local de piel y tejidos blandos causada por Coprinopsis cinerea. Nuevos microbios y nuevas infecciones. 1 de enero de 2018;21:102-4.