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Isopenicilina N sintasa

Diagrama de cintas de la isopenicilina N sintasa. El hierro del sitio activo se ve en el centro en gris. De PDB 1BK0

La isopenicilina N sintasa ( IPNS ) es una proteína de hierro no hemo que pertenece a la familia de las dioxigenasas oxidorreductasas dependientes del 2-oxoglutarato (2OG) . Esta enzima cataliza la formación de isopenicilina N a partir de δ-( L -α-aminoadipoil) -L -cisteinil- D -valina ( LLD -ACV).

N -[(5 S )-5-amino-5-carboxipentanoil]- L -cisteinil- D -valina + O 2 isopenicilina N + 2 H 2 O

Esta reacción es un paso clave en la biosíntesis de los antibióticos de penicilina y cefalosporina . [1]

Los sitios activos de la mayoría de las isopenicilina N sintasas contienen un ion de hierro . [2]

Esta enzima también se llama isopenicilina N sintetasa .

Mecanismo

Representación en primer plano del sitio activo de la isopenicilina N sintasa, que muestra His270, His214, Asp216 (arriba, de izquierda a derecha, en el sentido de las agujas del reloj) y una molécula de agua que coordina el sitio activo ferroso, mientras se une el ACV (abajo, a la derecha). De PDB 1BK0

Un ion metálico Fe(II) en el sitio activo de la enzima está coordinado por al menos dos residuos de histidina , un residuo de aspartato , un residuo de glutamina y dos moléculas de agua en ausencia de un sustrato unido . [2] Solo dos residuos de histidina y un residuo de ácido aspártico se conservan por completo. Por lo tanto, es muy significativo que estos dos residuos de histidina, His214 y His270, y un residuo de ácido aspártico, Asp216, sean precisamente los esenciales para la actividad. [3] Cuando el ACV se une al sitio activo, Gln330 y una molécula de agua son reemplazadas por el tiolato de ACV . [2]

El tripéptido lineal δ-( L -α-aminoadipoil) -L -cisteinil- D -valina ( LLD -ACV) debe ser ensamblado primero a partir de sus aminoácidos componentes por la N-(5-amino-5-carboxipentanoil)-L-cisteinil-D-valina sintasa (ACV sintasa). [4] Esto permite la unión del sustrato ACV al grupo tiol desprotonado del residuo de cisteína . Esta ligadura del tiolato al centro de hierro ancla el ACV dentro del sitio activo. [2]

La ligación del ACV produce una disminución del potencial redox FeII/FeIII , lo que facilita la reducción del dioxígeno a superóxido. La formación de un enlace RS-FeIII altamente covalente [5] [6] reduce la barrera de activación para la unión del dioxígeno, iniciando así el ciclo de reacción. [2] Se produce una transferencia intramolecular de un átomo de hidrógeno desde el C-3 del residuo de cisteína (BDE= 93 kcal/mol) al oxígeno superoxo distal, convirtiendo así el FeIII de nuevo al estado de oxidación de FeII. En este proceso se producen un tioaldehído y un ligando hidroperoxi (OOH). El ligando hidroperoxi desprotona la amida que luego cierra el anillo de β-lactama mediante un ataque nucleofílico en el carbono del tioaldehído. [4]

Esto hace que el átomo de hidrógeno en el C-3 del residuo de valina se acerque al ligando oxo de hierro(IV), que es altamente electrofílico. Se produce una segunda transferencia de hidrógeno, que probablemente produce un radical isopropilo que cierra el anillo de tiazolidina al atacar el átomo de azufre del tiolato . [4]

Papel en la formación de antibióticos

Vía de biosíntesis de penicilina y cefalosporina, que ilustra el papel de la isopenicilina N sintasa en la formación de antibióticos betalactámicos

Siguiendo la vía IPNS, otras enzimas son responsables de la epimerización de la isopenicilina N a penicilina N, la derivatización a otras penicilinas y la expansión del anillo que finalmente conduce a las diversas cefalosporinas. [1]

Esto demuestra cómo el IPNS ocupa un papel temprano y clave en la vía biosintética de todas las penicilinas y cefalosporinas, que son diferentes tipos de antibióticos β-lactámicos . Esta clase de antibióticos es la más utilizada. Actúan inhibiendo la síntesis de la capa de peptidoglicano de las paredes celulares bacterianas , lo que es especialmente importante en los organismos Gram-positivos.

Existen varios tipos de penicilinas que se pueden utilizar para tratar diferentes tipos de infecciones bacterianas . [7] No funcionarán para infecciones causadas por virus , como resfriados o gripe . [8]

Estudios estructurales

A finales de 2007, se habían resuelto 26 estructuras para esta clase de enzimas, con códigos de acceso PDB 1ODM, 1UZW, 1W03, 1W04, 1W05, 1W06, 1W3V, 1W3X, 2BJS, 2BU9, 2IVI, 2IVJ, 2JB4, 1QJE, 1ODN, 1HB1, 1HB2, 1HB3, 1HB4, 1QIQ, 1QJF, 1BK0, 1BLZ, 1OBN, 1OC1, 1IPS.

Referencias

  1. ^ ab Cohen G, Shiffman D, Mevarech M, Aharonowitz Y (abril de 1990). "Genes de isopenicilina N sintasa microbiana: estructura, función, diversidad y evolución". Trends Biotechnol . 8 (4): 105–11. doi :10.1016/0167-7799(90)90148-Q. PMID  1366527.
  2. ^ abcde Roach PL, Clifton IJ, Hensgens CM, Shibata N, Schofield CJ, Hajdu J, Baldwin JE (junio de 1997). "Estructura de la isopenicilina N sintasa complejada con sustrato y el mecanismo de formación de penicilina". Nature . 387 (6635): 827–30. doi : 10.1038/42990 . PMID  9194566. S2CID  205032251.
  3. ^ Borovok I, Landman O, Kreisberg-Zakarin R, Aharonowitz Y, Cohen G (febrero de 1996). "Sitio activo ferroso de la isopenicilina N sintasa: análisis genético y de secuencia de los ligandos endógenos". Bioquímica . 35 (6): 1981–7. doi :10.1021/bi951534t. PMID  8639682.
  4. ^ abc Schenk WA (octubre de 2000). "Isopenicilina N sintasa: una enzima en acción". Angew. Chem. Int. Ed. Engl . 39 (19): 3409–3411. doi : 10.1002/1521-3773(20001002)39:19<3409::AID-ANIE3409>3.0.CO;2-T . PMID  11091371.
  5. ^ Kovacs JA, Brines, LM (julio de 2007). "Comprensión de cómo el azufre tiolato contribuye a la función de la enzima superóxido reductasa de hierro no hemo". Acc. Chem. Res . 40 (7): 501–509. doi :10.1021/ar600059h. PMC 3703784. PMID  17536780 . 
  6. ^ Kovacs JA, Brines, LM (mayo de 2007). "Estudios VTVH-MCD y DFT de la unión de tiolatos a complejos {FeNO}7/{FeO2}8 de la isopenicilina N sintasa: determinación del sustrato de la actividad oxidasa frente a la oxigenasa en enzimas Fe no hemo". J. Am. Chem. Soc . 129 (23): 7427–7438. doi :10.1021/ja071364v. PMC 2536647. PMID  17506560 . 
  7. ^ Geddes AM, Williams JD (1976). Farmacología de los antibióticos . Boston, MA: Springer US. ISBN 978-1-4684-3123-0.
  8. ^ Anderson L. "¿Por qué los antibióticos no matan los virus?". Drugs.com .

Lectura adicional