El Instituto Independiente se estableció originalmente en San Francisco, California, y fue reubicado en 1989 a Oakland.
El Instituto Independiente está organizado en seis centros,[4] que abordan toda la gama de políticas públicas: Además, el instituto publica una revista trimestral, Independent Review, durante mucho tiempo fue editada por el economista e historiador Robert Higgs.
En 2006, habiendo lanzado su oficina en Washington, el instituto expandió su programa mediático incluyendo una columna semanal por el miembro sénior Álvaro Vargas Llosa en el Washington Post, con 5 millones de lectores semanales alrededor del mundo.
El Instituto Independiente fundamenta sus posiciones de políticas públicas en principios de la filosofía libertaria como libertad individual, mercado libre, no intervención internacional, y control al gobierno.
El miembro sénior Bruce Benson recibió en 2006 el Adam Smith Award, y miembro sénior Robert Higgs recibió en 1998 el Templeton Honor Rolls Award on Education in a Free Society y el Friedrich von Wieser Memorial Prize for Excellence in Economic Education en 2006.