Helen Miriam Berman es profesora de la Junta de Gobernadores de Química y Biología Química en la Universidad de Rutgers y ex directora del RCSB Protein Data Bank (una de las organizaciones miembros del Worldwide Protein Data Bank ). Bióloga estructural, su trabajo incluye el análisis estructural de complejos de proteínas y ácidos nucleicos y el papel del agua en las interacciones moleculares. También es la fundadora y directora de la Base de datos de ácidos nucleicos y dirigió la Base de conocimientos sobre genómica estructural de la Iniciativa de estructura de proteínas. [1] [2] [3]
Berman nació en Chicago, Illinois y crecí en Brooklyn, Nueva York. Su padre, David Bernstein, era médico y su madre, Dorothy Bernstein (de soltera Skupsky), dirigía el consultorio de su padre. Inspirada por su padre trabajador y erudito, cuando era niña se interesó por la ciencia y planeaba convertirse en científica o doctora. Su madre, que estaba fuertemente involucrada en la comunidad y en el trabajo voluntario, influyó en ella para que participara en actividades comunitarias a lo largo de su vida.
Durante la escuela secundaria, Berman trabajó en el laboratorio de Ingrith Deyrup en Barnard College . Deyrup animó a Berman a asistir a Barnard como estudiante universitario. Mientras estaba en la universidad, trabajó en el laboratorio del Colegio de Médicos y Cirujanos de la Universidad de Columbia con Barbara Low . Allí, Berman aprendió sobre cristalografía , lo que se convertiría en una pasión para toda la vida. Se graduó en Barnard con una licenciatura en química en 1964.
Después de la universidad, Berman asistió a la Universidad de Pittsburgh para realizar estudios de posgrado, un lugar que seleccionó porque era el único lugar en el país con un departamento de cristalografía y uno de los pocos donde se ofrecía cristalografía como materia. Allí trabajó con George A. Jeffrey sobre la estructura de los carbohidratos y recibió su doctorado. en 1967. Berman permaneció en la Universidad de Pittsburgh durante dos años más como investigador postdoctoral .
En 1969, Berman se mudó al Centro Oncológico Fox Chase en Filadelfia, donde trabajó en el laboratorio de Jenny P. Glusker antes de comenzar su propio programa de investigación independiente como miembro de la facultad en 1973. En Fox Chase, Berman se interesó en las estructuras de los ácidos nucleicos. y en bioinformática. Sabía que la organización lógica de los datos los haría útiles para una variedad de científicos.
En junio de 1971, Berman asistió a un simposio en el Laboratorio Cold Spring Harbor , donde varios científicos acordaron que los datos sobre el creciente número de estructuras de proteínas deberían archivarse en una base de datos. [4] Esa reunión condujo a la creación del Banco de datos de proteínas (PDB) en el Laboratorio Nacional Brookhaven . [5] [6]
En 1989, Berman se mudó a Rutgers y en 1992, junto con otros científicos, cofundó la Base de datos de ácidos nucleicos (NDB) para recopilar y difundir información sobre la estructura de los ácidos nucleicos. [7] En Rutgers, continuó estudiando los ácidos nucleicos, sus interacciones con las proteínas, [8] y también investigó la estructura del colágeno en colaboración con Barbara Brodsky y Jordi Bella. [9] Ella figura como depositante en 38 estructuras en el PDB de 1992 a 2011, de complejos de proteína/ácido nucleico y sus componentes (por ejemplo, 1RUN, 3SSX, 2B1B), fragmentos de colágeno (por ejemplo, 1CGD, 1EI8) y otras macromoléculas. .
En 1998, Berman y Philip Bourne compitieron juntos y ganaron el contrato para el Protein Data Bank y la base de datos se trasladó de Brookhaven a los auspicios del Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB), actualmente una colaboración entre Rutgers y la Universidad de California. San Diego. Con sus colegas, Berman rediseñó el sistema de gestión de datos, agregó nuevas herramientas de usuario y permitió realizar búsquedas en la base de datos. [10] Desde 2003, el archivo PDB ha sido gestionado por el Banco de Datos de Proteínas mundial (wwPDB), una asociación fundada por Berman que consta de organizaciones que actúan como centros de depósito, procesamiento y distribución de datos PDB: el RCSB, el PDBe. en Europa y el PDBj en Japón. [11] En 2006, el banco de datos BioMagResData (BMRB) para estructuras de resonancia magnética nuclear (RMN) [12] se convirtió en el cuarto miembro de la wwPDB. [13] En julio de 2018, el NDB posee más de 9600 estructuras de ácidos nucleicos y el PDB posee más de 142 000 estructuras macromoleculares.
También dirigida por el RCSB, la base de conocimientos sobre genómica estructural de la Iniciativa de Estructura de Proteínas (PSI) se lanzó en la primavera de 2008 para proporcionar un portal continuamente actualizado para investigar datos y otros recursos de los esfuerzos de PSI. [14]
Berman también ha participado activamente en la comunidad científica, y se desempeñó como presidente de la Asociación Estadounidense de Cristalografía en 1988, asesoró tanto a los Institutos Nacionales de Salud como a la Fundación Nacional de Ciencias y formó parte del consejo editorial de varias revistas. Su trabajo ha sido ampliamente publicado en revistas científicas revisadas por pares . [8] [9] [15] [16] [17]
Berman fue el productor ejecutivo y creador de la serie documental Target Zero, que se centra en los aspectos médicos y sociales del tratamiento y la prevención del VIH. [18] Los tres cortometrajes entrelazan historias de pacientes de la vida real, entrevistas con destacados médicos, proveedores de atención médica y científicos; y animaciones moleculares de última generación. Estos relatos iluminan la compleja historia del control de la epidemia del VIH y revelan la necesidad constante de una atención compasiva y centrada en el paciente y una verdadera comprensión a nivel celular de la ciencia detrás de los tratamientos. [19]
Berman ha estado casada dos veces, con el ingeniero Victor Berman en la década de 1960 y con el biólogo molecular Peter Young de 1976 a 1999. Del segundo matrimonio tiene un hijo, Jason Asher Young (nacido en 1979), físico.
Durante la década de 1980, a Berman le diagnosticaron cáncer de mama. La experiencia la hizo estar más enfocada en su vida y su carrera, e interesada en apoyar a otras mujeres que enfrentan el mismo diagnóstico.