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Haplogrupo G-P303

En genética humana , el haplogrupo G-P303 ( G2a2b2a , [2] anteriormente G2a3b1) es un haplogrupo del cromosoma Y. Es una rama del haplogrupo G (ADN-Y) (M201). En orden descendente, G-P303 es además una rama de G2 (P287), G2a (P15), G2a2, G2a2b, G2a2b2 y, finalmente, G2a2b2a. Este haplogrupo representa a la mayoría de los hombres del haplogrupo G en la mayor parte de las zonas de Europa al oeste de Rusia y el Mar Negro . Hacia el este, G-P303 se encuentra entre personas G en todo el Medio Oriente , Irán , el área sur del Cáucaso, China e India . G-P303 exhibe su mayor diversidad en el Levante. [3] [ verificación fallida ]

Características genéticas

Todos los hombres G-P303 son portadores de la mutación P303 o S135 SNP Y-DNA. También hay algunos hallazgos de repeticiones cortas en tándem (STR) entre los hombres G-P303 que ayudan a subgruparlos. Muchos de los hombres tienen un valor inusual de 13 para el marcador DYS388, y algunos tienen 9 en DYS568. Las rarezas de los marcadores STR suelen ser diferentes en cada subgrupo de G-P303, y los valores de los marcadores característicos pueden variar según el subgrupo. Sin embargo, a menudo los valores de los marcadores STR DYS391, DYS392 y DYS393 son respectivamente 10, 11 y 14 o alguna ligera variación para todos los hombres G-P303.

P303 estuvo disponible para pruebas públicas por primera vez en el otoño de 2008, y la designación P indica que fue identificado en la Universidad de Arizona . La mutación se encuentra en el cromosoma Y en la posición 20104736. El cebador directo es TTCTTATTTGCTTTGAAACTCAG. El cebador inverso es ATTGGCTTATCAGATTGACG. La mutación implica el reemplazo de T por C. [4] Esta mutación en realidad se identificó por primera vez como S135 en Ethnoancestry en Londres, Inglaterra, pero tomó algún tiempo darse cuenta de que P303, que se identificó de forma independiente, y S135 eran lo mismo.

Datación del origen G-P303

Yfull fecha el TMRCA de todos los P303 en su base de datos en 11.000 BP, y el TMRCA con su hermano PF3359 en 14.000. [1] Las citas completas tienden a considerarse una cuarta parte demasiado jóvenes.

Distribución geográfica del Viejo Mundo

En Europa, los subgrupos definibles G-P303 constituyen la mayoría de las personas del Haplogrupo G al oeste de Rusia y el Mar Negro , y también se encuentran pequeños números en el norte de África . Los países bálticos tienen el porcentaje de población más bajo de G-P303. Escandinavia es similar: muestra menos de la mitad de los porcentajes de personas G que se ven en los países del sur. G-P303 parece representar el mismo porcentaje de la población tanto en el centro como en el sur de Europa, y normalmente representa la mitad o más del G observado en la población de estas zonas. [5] G-P303 también se encuentra entre los caraítas de Crimea . [6]

Al este, se encuentran muestras de G-P303 en el norte de África ( Marruecos , Túnez , Libia y Egipto ), en el Medio Oriente ( Israel (se encuentra entre judíos , árabes y drusos ), Líbano , Irán (alcanzando su punto más alto a aproximadamente 15 % de árabes de Juzestán), Turquía , Jordania , Arabia Saudita , Yemen y Dubái ), la zona de las montañas del Cáucaso ( Armenia , Georgia , Azerbaiyán , Kabardinianos , Abazinia , Uzbekistán , y dispersos entre los grupos étnicos del noroeste de China y la Siberia rusa . Un distintivo Existe un tipo indio de G-P303, pero su prevalencia no está clara. Existe una muestra aislada de G-P303 de Malasia [5] [7] .

Concentraciones de G-P303 en ciertos sitios

El porcentaje más alto de personas G-P303 en una población discreta descrita hasta ahora, 86%, se encuentra en el distrito de Tuapsinsky , Krai de Krasnodar , Rusia , entre los Shapsugs . [8]

En Europa occidental, uno de los porcentajes más altos se encuentra en la isla de Ibiza, frente a la costa oriental española. Todas las muestras G disponibles de Ibiza son muestras típicas de G-P303 basadas en valores de marcadores STR. En total, alrededor del 16% de su población probablemente sea G-P303 sobre la misma base. [5] [9] [10] Estas muestras incluyen muchas personas identificables del subgrupo DYS388=13, y también se ven comúnmente en muestras judías sefardíes . [9] El haplogrupo G (P303) en Ibiza es probablemente representativo de la importante población de criptojudíos que llegaron allí huyendo de la Expulsión y la Inquisición española. [11]

El porcentaje del haplogrupo G entre las muestras disponibles de Gales es abrumadoramente G-P303. Un porcentaje tan alto no se encuentra en las cercanas Inglaterra , Escocia o Irlanda .

G-P303+*

El asterisco indica negatividad para el único subgrupo de G-P303. Esta categoría se estableció en abril de 2010 debido a la determinación entonces de que las personas con la mutación del SNP L140 comprenden un subgrupo separado de G-P303. G-M278, G-Z6885, G-Z30503 y G-L140 son los subgrupos conocidos [ cita necesaria ]

G-L140

Las personas en esta categoría tienen la mutación L140 SNP. L140 se identificó en Family Tree DNA en 2009, pero la determinación de que no todas las personas G-P303 tienen esta mutación no se realizó hasta abril de 2010. Esta mutación se encuentra en la posición cromosómica 7630859 y es una deleción. [12] La mayor parte de los hombres L140+ pertenecen a subgrupos L140.

G-U1 y sus subgrupos

U1 se identificó por primera vez en la Universidad de Florida Central en 2006, pero no se describió en una publicación hasta 2009. Las especificaciones técnicas enumeradas son:....ubicación rs9785956.....el cebador directo es TTTTCTGCTCCAAATCTGCTG....cebador inverso es CACCTGTAATCGGGAGGCTA....la mutación implica un cambio de A a G. [13]

Un alto porcentaje de todas las personas europeas U1+ analizadas hasta el momento dan positivo para el subgrupo en el que está presente la mutación SNP L13 o S13. En contraste, la mayor parte de los no europeos (principalmente en las montañas del Cáucaso occidental) pertenecen al subgrupo L1266 de U1.

G-L13/S13

Casi todas las personas L13+ de ascendencia europea tienen el valor de 12 o 13 en el marcador STR DYS385a y valores de 19,20 en el marcador STR YCA. Hay algunas muestras de L13+ disponibles que carecen de estas mutaciones, y se puede presumir para estas muestras un ancestro común compartido más atrás en el tiempo que los demás.

El SNP L13/S13 se identificó por primera vez en la Universidad de Florida Central en 2006 como SNP U13, pero antes de la publicación de los detalles de esta investigación en 2009, [13] el SNP también se identificó de forma independiente en 2008 en Family Tree DNA. en Houston , Texas, como L13 y en Ethnoancestry en Inglaterra como S13 y puesto a disposición del público para pruebas. Las especificaciones técnicas se dan como.....ubicación del cromosoma Y rs9786706.....el cebador directo es GTGGTAACAGCTCCTGGTGAG.....el cebador inverso es TCGCTGCTTTGGTTAACTGTCC...la mutación implica un cambio de C a T. [13]

El subgrupo L13 es más común en el norte de Europa central y se encuentra en casi todos los lugares de Europa donde se observan otros tipos de G, pero este subgrupo parece poco común en casi todos los países fuera de Europa. Fuera de Europa, L13 se ve con mayor frecuencia en el Cercano Oriente.

El Proyecto Haplogroup G ha indicado entre su gran colección de G que las muestras STR de G-L13 probables o probadas comprenden los siguientes porcentajes de muestras de G disponibles en los siguientes países europeos [en orden descendente]:

Alemania, 16%.....Italia, 11%.....Países Bajos, 10%.....Francia, 10%.....Polonia, 9%.....España, 9%. ....Irlanda, 6%.....Inglaterra, 5%.....Suiza, 4% [14]

Existe un pequeño subgrupo, abrumadoramente inglés, de L13/S13 y está designado como L1263. Esto se identificó por primera vez en Family Tree DNA en el verano de 2012 y representa una mutación de G a A en la posición cromosómica 8111187.

G-L1266

La mutación L1266 se identificó por primera vez en Family Tree DNA en julio de 2012. Los primeros indicios son que abarca un alto porcentaje de hombres U1 que no pertenecen al subgrupo L13 de U1. La mutación L1266 se encuentra en la posición 15412419 del cromosoma y representa una mutación de A a G. Algunos hombres L1266 también pertenecen a un subgrupo L1266 formado por hombres con las mutaciones L1264, L1265 y L1268. Estos fueron identificados al mismo tiempo que L1266 en Family Tree DNA. L1264 está en la posición 7704368, mutación A a G; L1265 en la posición 12741229, mutación A a G; y L1268 en la posición 20081319, T a C.

Subgrupos G-L497

El subgrupo más grande en Europa según las muestras disponibles es el de hombres que tienen la mutación L497. Este SNP se identificó por primera vez en enero de 2011, en pruebas en 23andMe y Family Tree DNA lo puso a disposición para pruebas separadas en L497 . Las ubicaciones de los cromosomas se indican como 15932714 y rs35141399, y la mutación es de C a T. El cebador directo es ATGAGTGGCCTCACCAAGGGAATC y el cebador inverso es ATGGGCAACAGGTGTCCTGAAG.

Un alto porcentaje de hombres con L497 tienen el valor de 13 en el marcador STR DYS388. Esta es una mutación rara del valor ancestral de 12. Un número muy pequeño de hombres dentro de este subgrupo DYS388=13 parece haber mutado una vez más a 12 o 14. La distribución geográfica de esta mutación 13 y otras características se describieron por primera vez en un revista de investigación en 2007. [15] Los porcentajes de hombres DYS388=13 dentro de las muestras G son particularmente altos en el noroeste de Europa. Algunos subgrupos DYS388=13 a continuación se basan en mutaciones de SNP y otros en rarezas del valor del marcador STR.

La mayoría de los hombres L497 pertenecen a su subgrupo Z725.

El Proyecto Haplogrupo G ha indicado entre su gran colección G que las muestras STR probables o probadas del tipo DYS388=13 comprenden los siguientes porcentajes de muestras G disponibles en los siguientes países [en orden descendente]:

Suiza, 74%.....España, 60%.....Francia, 58%....Alemania, 57%.....Inglaterra, 54%....Irlanda, 48%... ..Países Bajos, 45%.....Italia, 43%....Polonia, 29%....India, 0% [14]

El porcentaje polaco de hombres DYS388=13 disminuye únicamente debido al origen de un grupo significativo de hombres G2c en ese país. Sin el grupo G2c, el porcentaje DYS388=13 es del 50%. Los ejemplares G alemanes son mucho más numerosos en el suroeste del país.

Según los valores de los marcadores, la única muestra no europea DYS388=13 que ha surgido del Viejo Mundo que tiene valores de marcadores STR similares a los europeos es una única muestra de Egipto. [16] Y los únicos hombres L497+ probados con SNP fuera de Europa en el Proyecto Haplogrupo G tienen ascendencia turca.

La escasez de muestras comprobadas procedentes de fuera de Europa hasta ahora deja abierta la posibilidad de que esta mutación DYS388 se haya originado en un europeo.

G-Z725

Z725 fue identificado por primera vez por un investigador ciudadano entre los datos de una sola muestra en el Proyecto 1000 Genomas en el verano de 2011, pero no fue hasta el verano de 2012 que se confirmó en pruebas en Family Tree DNA como un subgrupo separado. Este subgrupo L497 es el subgrupo G más común en Europa porque un alto porcentaje de hombres L497 también son Z725+. Z725 se encuentra en la posición cromosómica 7957070 y es una deleción.

G-L43+/S147+, L42-/S146-

Este subgrupo es raro porque prácticamente todas las personas L43+/S147+ analizadas hasta ahora también son L42+/S146+.

El SNP se identificó por primera vez en una lista de resultados de SNP de pruebas en 23andMe . Fue desarrollado de forma independiente como una prueba separada tanto por Family Tree DNA como L43 como por Ethnoancestry como S147. En otoño de 2009, una prueba realizada nuevamente en 23andMe proporcionó información por primera vez de que una persona que tenía la mutación L43 carecía simultáneamente de la mutación L42 que normalmente ocurre con L43. Esta anomalía se verificó realizando pruebas a la misma persona en Family Tree DNA. Por lo tanto, L43+/S147+ es ahora una categoría separada. Las especificaciones técnicas para L43 son las siguientes: Ubicación del cromosoma Y 16446759....el cebador directo es GAGGTTTTCGGAGCTTACCTATAC....el cebador inverso es CACTGCTTGTAGATAGTAAAGTTTG.....la mutación implica un cambio de A a G. [17]

G-L43+/S147+, L42+/S146+

Aproximadamente una cuarta parte de los hombres DYS388=13 tienen esta mutación L42/S146. Los hombres suizos tienen más probabilidades que la media de pertenecer a este subgrupo. L42/S146 podría ser casi tan antigua como la mutación DYS388=13 según la cantidad de diferencias de valores observadas en muestras STR de 67 marcadores.

El SNP se identificó por primera vez en una lista de resultados de SNP de pruebas en 23andMe . Fue desarrollado de forma independiente como una prueba separada tanto por Family Tree DNA como L42 como por Ethnoancestry como S146. Las especificaciones técnicas para este SNP son las siguientes:....la posición en el cromosoma Y es 15170153.....el cebador directo es CTCACAATAGGCAGCATCCCCTCAG.....el cebador inverso es CAGAAAAAGGGAGCATATGACCAAGG.....la mutación implica un cambio de C a A. [18]

DYS391=7

Esta mutación de múltiples valores (varios pasos) en el marcador STR DYS391 al valor de 7 del 10 original se encuentra en un grupo de hombres hispanos .

DYS464a=9

Esta mutación de múltiples valores (multipasos) en el marcador STR DYS464a al valor 9 se ha encontrado hasta ahora sólo en hombres suizos y alemanes.

DYS388=15

Este pequeño subgrupo está compuesto por hombres cuyo antepasado mutó dos valores en el marcador STR DYS388 a 15. Los miembros de este subgrupo deben tener otros valores de marcador similares a las personas en el subgrupo general DYS388=13. Hasta ahora sólo las personas de ascendencia inglesa pertenecen a este subgrupo DYS388=15. El marcador DYS388 rara vez muta y una mutación de dos pasos (dos valores) es casi tan valiosa como una mutación SNP para identificar personas dentro de este subgrupo distintivo.

DYS393=12 con cercanía genética

Este pequeño subgrupo está compuesto por hombres cuyo antepasado mutó en el marcador STR DYS393 a 12. Este valor del marcador es inusualmente bajo para las personas G. Las personas con este hallazgo parecen informar orígenes ancestrales principalmente en Chipre según el conocimiento actual.

DYS594=12 con cercanía genética

Si bien en este grupo se observa principalmente una mutación a un valor de 12 de 10 u 11, existen algunos hombres DYS594=12 que no pertenecen al grupo. Los hombres de este grupo forman un grupo distintivo de personas con valores de marcadores STR estrechamente relacionados además de la rareza DYS594. Este subgrupo DYS594=12 tiene un porcentaje inusualmente alto de apellidos galeses y el resto es principalmente de ascendencia inglesa según las muestras disponibles.

Subgrupo G-Z1903

Hasta ahora, todos los hombres Z1903 tienen el valor de 9 en el marcador STR DYS568 y, de manera menos confiable, 20,21 en el marcador YCA junto con una estrecha relación basada en los valores del marcador STR. La razón por la que DYS568=9 puede usarse como un valor de categorización generalmente confiable se debe al hecho de que representa una mutación de varios pasos en un marcador que muta muy lentamente. Aunque no es objeto de un estudio de investigación, la edad de la mutación a 9 años en DYS568 puede haber sido de unos 3000 años. hace según el número de diferencias de valores de marcadores de muestras STR de 67 marcadores. Y la mutación a 20,21 en YCA habría surgido en este mismo período de tiempo general. Las personas dentro del grupo DYS568=9 a las que se les hizo la prueba del marcador GATA-A10 tuvieron valores uno o más superiores a los encontrados en otros subgrupos del haplogrupo G. Los del grupo Ashkenazi tuvieron los valores más altos de 14. Se necesitarían resultados adicionales para determinar si estos hallazgos son consistentes dentro del grupo DYS568=9.

Casi todos los hombres Z1903+ tienen la mutación Z724 adicional. Los hombres Z1903+ y Z724- constituyen solo un pequeño grupo dentro de Z1903 y hasta ahora son solo hombres hispanos. Z1903 y Z724 fueron identificados en 2011 en dos muestras del Proyecto 1000 Genomas , una de Utah en Estados Unidos y otra de Beijing , China. Z1903 se encuentra en la posición cromosómica 15106340 y representa una mutación de A a G. Z724 se encuentra en la posición 6895545 y representa una mutación de C a T [19] Los SNP de la serie Z fueron identificados por investigadores voluntarios.

Hasta ahora no se ha localizado ninguna persona Z1903 en la región de Medio Oriente o Anatolia, donde el haplogrupo G puede ser inusualmente común. Sin embargo, se han encontrado varias muestras entre osetios en las montañas del Cáucaso central y en una muestra de Beijing , China. Aunque se encuentran en toda Europa, hasta el momento los hombres Z1903 no se encuentran en muestras escandinavas al norte de Dinamarca.

Este subgrupo Z1903/Z724 contiene otro subgrupo grande formado por judíos asquenazíes que están relativamente estrechamente relacionados según los valores del marcador STR y normalmente tienen un valor de 16 para el marcador DYS385b. El grupo judío no parece compartir un ancestro común con los hombres no judíos dentro de la Era Actual . Y el ancestro común de los hombres Ashkenazi Z1903 probablemente vivió en la Edad Media basándose en la pequeña diferencia de valor del marcador STR observada entre ellos. Consulte también la página que cubre judíos con haplogrupo G (ADN-Y) .

Hay otro subgrupo más pequeño de personas Z1903 que tienen el valor 9 en el marcador STR DYS439. El valor ancestral de este marcador es 12 dentro del grupo DYS568=9, y este 9 representa una rara mutación de varios pasos. Este subgrupo DYS439=9 es predominantemente alemán y la mutación probablemente tenga más de 2000 años según el número de diferencias en los valores de los marcadores en muestras STR de 67 marcadores.

El Proyecto Haplogrupo G ha indicado entre su gran colección G que las muestras DYS568=9 probables o probadas comprenden los siguientes porcentajes de muestras G disponibles en los siguientes países [en orden descendente]:

Irlanda, 12%.....Inglaterra, 9%.....Países Bajos, 5%.....Polonia, 5%.....Italia, 4%.....Alemania, 3%. ....España, 3%.....Francia, 2% [14]

Dentro del subgrupo Z724 hay un subgrupo de G-L640+. Este es un pequeño grupo de hombres que actualmente son todos de las Islas Británicas. Este SNP fue identificado en el verano de 2011 en Family Tree DNA. Representa una mutación de A a G y se encuentra en la posición 16903082 del cromosoma Y. La mayoría, si no todos, estos hombres L640+ también tienen el valor de 8 en el marcador DY533, lo cual es raro entre los hombres Z724.

G-L660+, L662+

Este subgrupo es pequeño y hasta ahora sólo se encuentra en europeos. Ambos SNP involucrados se identificaron por primera vez en Family Tree DNA en el verano de 2011. L660 se encuentra en la posición 12511525 en el cromosoma Y y es un cambio de C a A. L662 se encuentra en la posición 16446702 y es un cambio de C a T.

G-L694+

Las personas de este subgrupo tienen la mutación L694, que fue descubierta en Family Tree DNA en el verano de 2011. Hasta ahora, esta mutación se ha encontrado principalmente en hombres polacos. Se encuentra en la posición 5734987 del cromosoma Y y es una mutación de inserción.

Ver también

Referencias

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  2. ^ Haplogrupo G de ADN-Y y sus subclados - 2018, ISOGG
  3. ^ Siiri Rootsi; Natalie M. Myres; Alicia A Lin; Mari Jarvé; Roy J Rey; et al. (2012). "Distinguir las coascendencias de los cromosomas Y del haplogrupo GY en las poblaciones de Europa y el Cáucaso". Revista europea de genética humana . 20 (12): 1275–82. doi :10.1038/ejhg.2012.86. PMC 3499744 . PMID  22588667. 
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enlaces externos