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Enterobacterias

Enterobacterales es un orden de bacterias gramnegativas , no formadoras de esporas, anaeróbicas facultativas y con forma de bastón de la clase Gammaproteobacteria . [1] El género tipo de este orden es Enterobacter . [1]

El nombre Enterobacterales se deriva del término latino Enterobacter , que hace referencia al género tipo del orden, y del sufijo "-ales", una terminación que se utiliza para denotar un orden. En conjunto, Enterobacterales se refiere a un orden cuyo tipo nomenclatural es el género Enterobacter . [1]

Identificación histórica y sistemática

Enterobacterales fue propuesto en 2005 bajo el nombre de "Enterobacteriales". Sin embargo, el nombre "Enterobacteriales" no fue validado de acuerdo con las reglas del Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas , por lo que carecía de validez en la nomenclatura, por lo que el nombre fue escrito entre paréntesis. "Enterobacteriales" era un orden monotípico , que contenía solo la familia Enterobacteriaceae , y compartía su género tipo Escherichia . [2] [3] [4] El orden contenía un grupo grande y diverso de especies, que ocupaban nichos ecológicos distintos y poseían una variedad de características bioquímicas. [5] Muchos géneros dentro del orden tienen impactos significativos en la actividad humana, como las especies patógenas Escherichia coli , Salmonella enterica y Yersinia pestis , así como fitopatógenos perjudiciales para la agricultura como miembros de los géneros Dickeya , Pectobacterium , Brenneria , Erwinia y Pantoea . La gran cantidad de especies, así como la variedad de diferentes características bioquímicas, hicieron que la descripción del orden y sus subgrupos fuera extremadamente difícil. [6] La asignación y clasificación de este orden se basó en gran medida en secuencias del genoma del ARNr 16S, que se sabe que tienen un bajo poder discriminatorio y producen diferentes resultados según el algoritmo y la cepa del organismo utilizado. [7] Además, estos análisis han demostrado que 'Enterobacteriales' exhibió una ramificación polifilética, con subgrupos distintos.

En 2016, se propuso reclasificar "Enterobacteriales" como Enterobacterales, y el género tipo cambió a Enterobacter de acuerdo con el Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas. [1] Además, se propusieron varias familias nuevas dentro del orden Enterobacterales, que consisten en especies que anteriormente eran miembros de la familia Enterobacteriaceae según agrupaciones encontradas en árboles filogenéticos construidos en base a genomas conservados, secuencias de ARNr 16S y análisis de secuencias de múltiples locus, así como marcadores moleculares independientes ( indels de firma conservados ). [1]

A partir de 2021, el orden Enterobacterales contiene 7 familias publicadas válidamente ( Budviciaceae , Enterobacteriaceae , Erwiniaceae , Hafniaceae , Morganellaceae , Pectobacteriaceae y Yersiniaceae ). [8]

Firmas moleculares

Los análisis de secuencias del genoma de especies de Enterobacterales identificaron cinco indeles de firma conservados (CSI) para este orden en las proteínas permeasa del transportador de péptidos ABC, proteína similar al factor de elongación P YeiP, L-arabinosa isomerasa , pirofosfatasa y una proteína hipotética, que en la mayoría de los casos son compartidas exclusivamente por todos o la mayoría de los miembros de este orden. [1] Estos CSI proporcionan un medio molecular para demarcar este orden de otras Gammaproteobacteria y respaldan la naturaleza monofilética del orden Enterobacterales.

Géneros

Géneros publicados válidamente

Los siguientes géneros han sido publicados de forma válida, por lo que tienen "registro en la nomenclatura". El año en que se propuso el género se indica entre paréntesis después del nombre del género.

Candidatogéneros

Propuestos, pero no han obtenido prestigio en la nomenclatura

Referencias

  1. ^ abcdefg Adeolu, M; Alnájar, S; Naushad, S; S Gupta, R (diciembre de 2016). "Filogenia y taxonomía basada en el genoma de los 'Enterobacteriales': propuesta para Enterobacterales ord. nov. dividida en las familias Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Familia Morganellaceae nov. y familia Budviciaceae nov. Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 66 (12): 5575–5599. doi : 10.1099/ijsem.0.001485 . PMID  27620848.
  2. ^ Sitio Zipcodezoo Enterobacteriales Archivado el 27 de abril de 2014 en Wayback Machine. Consultado el 9 de marzo de 2013.
  3. ^ NCBI Enterobacterales, consultado el 9 de marzo de 2013
  4. ^ Taxonomicon Enterobacteriales consultado el 9 de marzo de 2013
  5. ^ Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T.; Garrity, George M.; Boone, David R.; De Vos, Paul; Goodfellow, Michael; Rainey, Fred A.; Schleifer, Karl-Heinz, eds. (2005). Manual de bacteriología sistemática de Bergey. doi :10.1007/0-387-28022-7. ISBN 978-0-387-24144-9.
  6. ^ Octavia, Sophie; Lan, Ruiting (2014), "La familia Enterobacteriaceae", The Prokaryotes , Berlín, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, págs. 225-286, doi :10.1007/978-3-642-38922-1_167, ISBN 978-3-642-38921-4, consultado el 2 de junio de 2021
  7. ^ Francino, M. Pilar; Santos, Scott R.; Ochman, Howard (2006), "Relaciones filogenéticas de bacterias con especial referencia a endosimbiontes y especies entéricas" (PDF) , The Prokaryotes , Nueva York, NY: Springer New York, págs. 41–59, doi :10.1007/0-387-30746-x_2, ISBN 978-0-387-25496-8, consultado el 2 de junio de 2021
  8. ^ "Orden: Enterobacterales". lpsn.dsmz.de . Consultado el 2 de junio de 2021 .