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Cofactor (bioquímica)

El complejo succinato deshidrogenasa que muestra varios cofactores, incluidos flavina , centros de hierro-azufre y hemo .

Un cofactor es un compuesto químico no proteico o un ion metálico que se requiere para que una enzima cumpla su función de catalizador (un catalizador es una sustancia que aumenta la velocidad de una reacción química ). Los cofactores pueden considerarse "moléculas auxiliares" que ayudan en las transformaciones bioquímicas . Las velocidades a las que estas ocurren se caracterizan en un área de estudio llamada cinética enzimática . Los cofactores normalmente se diferencian de los ligandos en que a menudo obtienen su función al permanecer unidos.

Los cofactores se pueden clasificar en dos tipos: iones inorgánicos y moléculas orgánicas complejas llamadas coenzimas . [1] Las coenzimas se derivan principalmente de vitaminas y otros nutrientes orgánicos esenciales en pequeñas cantidades. (Algunos científicos limitan el uso del término "cofactor" para las sustancias inorgánicas; aquí se incluyen ambos tipos. [2] [3] )

Las coenzimas se dividen en dos tipos. El primero se denomina " grupo prostético ", que consiste en una coenzima que está unida de forma estrecha (o incluso covalente) y permanente a una proteína. [4] El segundo tipo de coenzimas se denomina "cosustratos" y están unidos transitoriamente a la proteína. Los cosustratos pueden liberarse de una proteína en algún momento y volver a unirse más tarde. Tanto los grupos prostéticos como los cosustratos tienen la misma función, que es facilitar la reacción de las enzimas y las proteínas. Una enzima inactiva sin el cofactor se denomina apoenzima , mientras que la enzima completa con el cofactor se denomina holoenzima . [5] [ página necesaria ]

La Unión Internacional de Química Pura y Aplicada (IUPAC) define "coenzima" de una manera un poco diferente, es decir, como un compuesto orgánico no proteico de bajo peso molecular que está unido de forma débil y participa en reacciones enzimáticas como un portador disociable de grupos químicos o electrones; un grupo prostético se define como una unidad no polipeptídica fuertemente unida en una proteína que se regenera en cada recambio enzimático. [6]

Algunas enzimas o complejos enzimáticos requieren varios cofactores. Por ejemplo, el complejo multienzimático piruvato deshidrogenasa [7] en la unión de la glucólisis y el ciclo del ácido cítrico requiere cinco cofactores orgánicos y un ion metálico: pirofosfato de tiamina (TPP) unido de forma débil, lipoamida y dinucleótido de flavina y adenina (FAD) unidos de forma covalente, cosustratos nicotinamida y adenina dinucleótido (NAD + ) y coenzima A (CoA), y un ion metálico (Mg2 + ). [8]

Los cofactores orgánicos suelen ser vitaminas o estar hechos a partir de ellas. Muchos contienen el nucleótido adenosín monofosfato (AMP) como parte de sus estructuras, como el ATP , la coenzima A , el FAD y el NAD + . Esta estructura común puede reflejar un origen evolutivo común como parte de las ribozimas en un mundo de ARN antiguo . Se ha sugerido que la parte AMP de la molécula puede considerarse una especie de "asa" mediante la cual la enzima puede "agarrar" la coenzima para cambiarla entre diferentes centros catalíticos. [9]

Clasificación

Los cofactores se pueden dividir en dos grupos principales: cofactores orgánicos , como la flavina o el hemo ; y cofactores inorgánicos , como los iones metálicos Mg 2+ , Cu + , Mn 2+ y los grupos hierro-azufre .

Los cofactores orgánicos a veces se dividen en coenzimas y grupos prostéticos . El término coenzima se refiere específicamente a las enzimas y, como tal, a las propiedades funcionales de una proteína. Por otro lado, "grupo prostético" enfatiza la naturaleza de la unión de un cofactor a una proteína (fuerte o covalente) y, por lo tanto, se refiere a una propiedad estructural. Diferentes fuentes dan definiciones ligeramente diferentes de coenzimas, cofactores y grupos prostéticos. Algunos consideran a las moléculas orgánicas fuertemente unidas como grupos prostéticos y no como coenzimas, mientras que otros definen todas las moléculas orgánicas no proteicas necesarias para la actividad enzimática como coenzimas, y clasifican aquellas que están fuertemente unidas como grupos prostéticos de coenzimas. Estos términos a menudo se usan de manera vaga.

En una carta publicada en 1980 en Trends in Biochemistry Sciences se destacaba la confusión existente en la literatura y la distinción esencialmente arbitraria que se hacía entre grupos prostéticos y grupos de coenzimas, y se proponía el siguiente esquema. En este caso, los cofactores se definían como una sustancia adicional, aparte de la proteína y el sustrato , que es necesaria para la actividad enzimática, y un grupo prostético como una sustancia que experimenta todo su ciclo catalítico unida a una única molécula de enzima. Sin embargo, el autor no pudo llegar a una única definición que lo abarcara todo de una "coenzima" y propuso que se eliminara este término de la literatura. [10]

Cofactores inorgánicos

Iones metálicos

Los iones metálicos son cofactores comunes. [11] El estudio de estos cofactores cae dentro del área de la química bioinorgánica . En nutrición , la lista de oligoelementos esenciales refleja su papel como cofactores. En humanos, esta lista incluye comúnmente hierro , magnesio , manganeso , cobalto , cobre , zinc y molibdeno . [12] Aunque la deficiencia de cromo causa tolerancia a la glucosa alterada , no se ha identificado ninguna enzima humana que use este metal como cofactor. [13] [14] El yodo también es un oligoelemento esencial, pero este elemento se usa como parte de la estructura de las hormonas tiroideas en lugar de como cofactor enzimático. [15] El calcio es otro caso especial, ya que se requiere como componente de la dieta humana, y es necesario para la actividad completa de muchas enzimas, como la óxido nítrico sintasa , las proteínas fosfatasas y la adenilato quinasa , pero el calcio activa estas enzimas en la regulación alostérica , a menudo uniéndose a estas enzimas en un complejo con calmodulina . [16] El calcio es, por lo tanto, una molécula de señalización celular , y generalmente no se considera un cofactor de las enzimas que regula. [17]

Otros organismos requieren metales adicionales como cofactores enzimáticos, como el vanadio en la nitrogenasa de las bacterias fijadoras de nitrógeno del género Azotobacter , [18] el tungsteno en la aldehído ferredoxina oxidorreductasa de la arquea termófila Pyrococcus furiosus , [19] e incluso el cadmio en la anhidrasa carbónica de la diatomea marina Thalassiosira weissflogii . [20] [21]

En muchos casos, el cofactor incluye tanto un componente orgánico como uno inorgánico. Un conjunto diverso de ejemplos son las proteínas hemo , que consisten en un anillo de porfirina coordinado con hierro . [22]

Un grupo simple [Fe 2 S 2 ] que contiene dos átomos de hierro y dos átomos de azufre, coordinados por cuatro residuos de cisteína de proteína.

Aglomerados de hierro y azufre

Los grupos de hierro y azufre son complejos de átomos de hierro y azufre que se encuentran dentro de las proteínas mediante residuos de cisteinilo. Desempeñan funciones tanto estructurales como funcionales, como la transferencia de electrones, la detección redox y como módulos estructurales. [23]

Orgánico

Los cofactores orgánicos son pequeñas moléculas orgánicas (normalmente una masa molecular inferior a 1000 Da) que pueden estar unidas de forma débil o fuerte a la enzima y participar directamente en la reacción. [5] [24] [25] [26] En el último caso, cuando es difícil eliminarlo sin desnaturalizar la enzima, se puede llamar grupo prostético . No existe una división clara entre cofactores unidos de forma débil y fuerte. [5] Muchos, como el NAD +, pueden estar unidos de forma fuerte en algunas enzimas, mientras que en otras están unidos de forma débil. [5] Otro ejemplo es el pirofosfato de tiamina (TPP), que está unido de forma fuerte en la transcetolasa o la piruvato descarboxilasa , mientras que está unido de forma menos fuerte en la piruvato deshidrogenasa . [27] Otras coenzimas, como el dinucleótido de flavina y adenina (FAD), la biotina y la lipoamida , por ejemplo, están unidas de forma fuerte. [28] Los cofactores fuertemente ligados se regeneran, en general, durante el mismo ciclo de reacción, mientras que los cofactores débilmente ligados pueden regenerarse en una reacción posterior catalizada por una enzima diferente. En este último caso, el cofactor también puede considerarse un sustrato o cosustrato.

Las vitaminas pueden servir como precursoras de muchos cofactores orgánicos (p. ej., vitaminas B 1 , B 2 , B 6 , B 12 , niacina , ácido fólico ) o como coenzimas en sí mismas (p. ej., vitamina C ). Sin embargo, las vitaminas tienen otras funciones en el cuerpo. [29] Muchos cofactores orgánicos también contienen un nucleótido , como los transportadores de electrones NAD y FAD , y la coenzima A , que transporta grupos acilo . La mayoría de estos cofactores se encuentran en una gran variedad de especies, y algunos son universales para todas las formas de vida. Una excepción a esta amplia distribución es un grupo de cofactores únicos que evolucionaron en metanógenos , que están restringidos a este grupo de arqueas . [30]

Vitaminas y derivados

No vitaminas

Cofactores como intermediarios metabólicos

Las reacciones redox del dinucleótido de nicotinamida y adenina .

El metabolismo implica una amplia gama de reacciones químicas, pero la mayoría se incluyen en unos pocos tipos básicos de reacciones que implican la transferencia de grupos funcionales . [60] Esta química común permite que las células utilicen un pequeño conjunto de intermediarios metabólicos para transportar grupos químicos entre diferentes reacciones. [61] Estos intermediarios de transferencia de grupos son los cofactores orgánicos débilmente unidos, a menudo llamados coenzimas .

Cada clase de reacción de transferencia de grupo se lleva a cabo mediante un cofactor particular, que es el sustrato para un conjunto de enzimas que lo producen y un conjunto de enzimas que lo consumen. Un ejemplo de esto son las deshidrogenasas que utilizan el dinucleótido de nicotinamida y adenina (NAD + ) como cofactor. Aquí, cientos de tipos diferentes de enzimas eliminan electrones de sus sustratos y reducen el NAD + a NADH. Este cofactor reducido es entonces un sustrato para cualquiera de las reductasas en la célula que requieren electrones para reducir sus sustratos. [32]

Por lo tanto, estos cofactores se reciclan continuamente como parte del metabolismo . A modo de ejemplo, la cantidad total de ATP en el cuerpo humano es de aproximadamente 0,1  mol . Este ATP se descompone constantemente en ADP y luego se convierte nuevamente en ATP. Por lo tanto, en un momento dado, la cantidad total de ATP + ADP permanece bastante constante. La energía utilizada por las células humanas requiere la hidrólisis de 100 a 150 moles de ATP diariamente, lo que equivale a alrededor de 50 a 75 kg. En situaciones típicas, los humanos utilizan su peso corporal de ATP a lo largo del día. [62] Esto significa que cada molécula de ATP se recicla de 1000 a 1500 veces al día.

Evolución

Los cofactores orgánicos, como el ATP y el NADH , están presentes en todas las formas de vida conocidas y forman una parte fundamental del metabolismo . Esta conservación universal indica que estas moléculas evolucionaron muy temprano en el desarrollo de los seres vivos. [63] Por lo tanto, al menos algunos de los cofactores actuales pueden haber estado presentes en el último ancestro universal , que vivió hace unos 4 mil millones de años. [64] [65]

Los cofactores orgánicos pueden haber estado presentes incluso antes en la historia de la vida en la Tierra. [66] El nucleótido adenosina es un cofactor para muchas enzimas metabólicas básicas como las transferasas. Puede ser un remanente del mundo del ARN . [67] [68] Los cofactores basados ​​en adenosina pueden haber actuado como adaptadores que permitieron a las enzimas y ribozimas unirse a nuevos cofactores a través de pequeñas modificaciones en los dominios de unión de adenosina existentes , que originalmente habían evolucionado para unirse a un cofactor diferente. [9] Este proceso de adaptación de una estructura preevolucionada para un uso novedoso se conoce como exaptación .

Origen prebiótico de las coenzimas . Al igual que los aminoácidos y los nucleótidos , ciertas vitaminas y, por lo tanto, coenzimas se pueden crear en condiciones terrestres primitivas. Por ejemplo, la vitamina B3 se puede sintetizar con descargas eléctricas aplicadas al etileno y al amoníaco . [69] De manera similar, la panteteína (un derivado de la vitamina B5 ), un precursor de la coenzima A y la síntesis dependiente de tioésteres, se puede formar espontáneamente en condiciones de evaporación. [70] Es posible que otras coenzimas hayan existido primitivamente en la Tierra, como las pterinas (un derivado de la vitamina B9 ), las flavinas ( FAD , mononucleótido de flavina = FMN) y la riboflavina (vitamina B2). [71]

Cambios en las coenzimas . Un método computacional, IPRO, predijo recientemente mutaciones que cambiaron experimentalmente la especificidad del cofactor de la xilosa reductasa de Candida boidinii de NADPH a NADH. [72]

Evolución de enzimas sin coenzimas . Si las enzimas requieren una coenzima, ¿cómo evoluciona la coenzima? El escenario más probable es que las enzimas puedan funcionar inicialmente sin sus coenzimas y luego reclutar la coenzima, incluso si la reacción catalizada puede no ser tan eficiente o tan rápida. Algunos ejemplos son la alcohol deshidrogenasa (coenzima: NAD⁺ ), [73] lactato deshidrogenasa (NAD⁺), [74] glutatión reductasa ( NADPH ). [75]

Historia

El primer cofactor orgánico que se descubrió fue el NAD + , que fue identificado por Arthur Harden y William Young en 1906. [76] Observaron que añadir extracto de levadura hervido y filtrado aceleraba en gran medida la fermentación alcohólica en extractos de levadura sin hervir. Llamaron al factor no identificado responsable de este efecto cofermento . A través de una purificación larga y difícil a partir de extractos de levadura, este factor termoestable fue identificado como un fosfato de azúcar nucleótido por Hans von Euler-Chelpin . [77] Se identificaron otros cofactores a lo largo de principios del siglo XX, con el ATP aislado en 1929 por Karl Lohmann, [78] y la coenzima A descubierta en 1945 por Fritz Albert Lipmann . [79]

Las funciones de estas moléculas fueron al principio misteriosas, pero, en 1936, Otto Heinrich Warburg identificó la función del NAD + en la transferencia de hidruros. [80] Este descubrimiento fue seguido a principios de la década de 1940 por el trabajo de Herman Kalckar , quien estableció el vínculo entre la oxidación de azúcares y la generación de ATP. [81] Esto confirmó el papel central del ATP en la transferencia de energía que había sido propuesto por Fritz Albert Lipmann en 1941. [82] Más tarde, en 1949, Morris Friedkin y Albert L. Lehninger demostraron que el NAD + vinculaba vías metabólicas como el ciclo del ácido cítrico y la síntesis de ATP. [83]

Cofactores derivados de proteínas

En varias enzimas, la fracción que actúa como cofactor se forma mediante la modificación postraduccional de una parte de la secuencia de la proteína. Esto a menudo reemplaza la necesidad de un factor de unión externo, como un ion metálico, para la función de la proteína. Las modificaciones potenciales podrían ser la oxidación de residuos aromáticos, la unión entre residuos, la escisión o la formación de anillos. [84] Estas alteraciones se distinguen de otras modificaciones postraduccionales de las proteínas, como la fosforilación , la metilación o la glicosilación, en que los aminoácidos normalmente adquieren nuevas funciones. Esto aumenta la funcionalidad de la proteína; los aminoácidos no modificados normalmente se limitan a reacciones ácido-base, y la alteración de los residuos puede dar a la proteína sitios electrofílicos o la capacidad de estabilizar los radicales libres. [84] Los ejemplos de producción de cofactores incluyen triptófano triptofilquinona (TTQ), derivada de dos cadenas laterales de triptófano, [85] y 4-metilideno-imidazol-5-ona (MIO), derivada de un motivo Ala-Ser-Gly. [86] La caracterización de los cofactores derivados de proteínas se realiza mediante cristalografía de rayos X y espectroscopia de masas ; los datos estructurales son necesarios porque la secuenciación no identifica fácilmente los sitios alterados.

Cofactores no enzimáticos

El término se utiliza en otras áreas de la biología para referirse de manera más amplia a moléculas no proteicas (o incluso proteicas) que activan, inhiben o son necesarias para que la proteína funcione. Por ejemplo, los ligandos como las hormonas que se unen a las proteínas receptoras y las activan se denominan cofactores o coactivadores, mientras que las moléculas que inhiben las proteínas receptoras se denominan correpresores. Un ejemplo de ello es la familia de receptores acoplados a la proteína G, que se encuentran con frecuencia en las neuronas sensoriales. La unión del ligando a los receptores activa la proteína G, que a su vez activa una enzima para activar el efector. [87] Para evitar confusiones, se ha sugerido que dichas proteínas que tienen activación o represión mediada por la unión del ligando se denominen correguladores. [88]

Véase también

Referencias

  1. ^ Hasim, Onn H.; Adnan, Nor Azila (2010). "Grupo de coenzimas, cofactores y prótesis: jerga bioquímica ambigua" (PDF) . Educación Bioquímica . 22 (2): 93–94. doi :10.1016/0307-4412(94)90088-4.
  2. ^ "Coenzimas y cofactores". Archivado desde el original el 26 de agosto de 1999. Consultado el 17 de noviembre de 2007 .
  3. ^ "Cofactores enzimáticos". Archivado desde el original el 5 de mayo de 2003. Consultado el 17 de noviembre de 2007 .
  4. ^ Nelson DL, Cox MM (2008). Principios de bioquímica de Lehninger (quinta edición). Nueva York: WH Freeman and Company. pág. 184. ISBN 978-1429224161.
  5. ^ abcdef Sauke DJ, Metzler DE, Metzler CM (2001). Bioquímica: las reacciones químicas de las células vivas (2.ª ed.). San Diego: Harcourt/Academic Press. ISBN 978-0-12-492540-3.
  6. ^ de Bolster, MWG (1997). Glosario de términos utilizados en química bioinorgánica (PDF) . Química pura y aplicada.
  7. ^ Jordan F, Patel MS (2004). Tiamina: mecanismos catalíticos en estados normales y patológicos . Nueva York, NY: Marcel Dekker. p. 588. ISBN 978-0-8247-4062-7.
  8. ^ "Complejo de piruvato deshidrogenasa". Chemistry LibreTexts . 2013-10-02 . Consultado el 2017-05-10 .
  9. ^ ab Denessiouk KA, Rantanen VV, Johnson MS (agosto de 2001). "Reconocimiento de adenina: un motivo presente en proteínas dependientes de ATP, CoA, NAD, NADP y FAD". Proteins . 44 (3): 282–91. doi :10.1002/prot.1093. PMID  11455601. S2CID  10848692.
  10. ^ Bryce (marzo de 1979). "SAM – semántica y malentendidos". Trends Biochem. Sci . 4 (3): N62–N63. doi :10.1016/0968-0004(79)90255-X.
  11. ^ "Bioquímica: Enzimas: Clasificación y catálisis (Cofactores)". vle.du.ac.in . Consultado el 7 de febrero de 2018 .[ enlace muerto permanente ]
  12. ^ Aggett PJ (agosto de 1985). "Fisiología y metabolismo de los oligoelementos esenciales: un resumen". Clinics in Endocrinology and Metabolism . 14 (3): 513–43. doi :10.1016/S0300-595X(85)80005-0. PMID  3905079.
  13. ^ Stearns DM (2000). "¿Es el cromo un metal esencial en trazas?". BioFactors . 11 (3): 149–62. doi :10.1002/biof.5520110301. PMID  10875302. S2CID  19417496.
  14. ^ Vincent JB (abril de 2000). "La bioquímica del cromo". The Journal of Nutrition . 130 (4): 715–8. doi : 10.1093/jn/130.4.715 . PMID  10736319.
  15. ^ Cavalieri RR (abril de 1997). "Metabolismo del yodo y fisiología tiroidea: conceptos actuales". Tiroides . 7 (2): 177–81. doi :10.1089/thy.1997.7.177. PMID  9133680.
  16. ^ Clapham DE (2007). "Señalización de calcio". Cell . 131 (6): 1047–58. doi : 10.1016/j.cell.2007.11.028 . PMID  18083096. S2CID  15087548.
  17. ^ Niki I, Yokokura H, Sudo T, Kato M, Hidaka H (octubre de 1996). "Señalización de Ca2+ y proteínas de unión intracelulares de Ca2+". Journal of Biochemistry . 120 (4): 685–98. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021466. PMID  8947828.
  18. ^ Eady RR (julio de 1988). "La nitrogenasa que contiene vanadio de Azotobacter". BioFactors . 1 (2): 111–6. PMID  3076437.
  19. ^ Chan MK, Mukund S, Kletzin A, Adams MW, Rees DC (marzo de 1995). "Estructura de una enzima hipertermófila de tungstopterina, aldehído ferredoxina oxidorreductasa". Science . 267 (5203): 1463–9. Bibcode :1995Sci...267.1463C. doi :10.1126/science.7878465. PMID  7878465. S2CID  20868012.
  20. ^ Lane TW, Morel FM (abril de 2000). "Una función biológica del cadmio en diatomeas marinas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 97 (9): 4627–31. Bibcode :2000PNAS...97.4627L. doi : 10.1073/pnas.090091397 . PMC 18283 . PMID  10781068. 
  21. ^ Lane TW, Saito MA, George GN, Pickering IJ, Prince RC, Morel FM (2005). "Bioquímica: una enzima de cadmio de una diatomea marina". Nature . 435 (7038): 42. Bibcode :2005Natur.435...42L. doi : 10.1038/435042a . PMID  15875011. S2CID  52819760.
  22. ^ Li T, Bonkovsky HL, Guo JT (marzo de 2011). "Análisis estructural de las proteínas hemo: implicaciones para el diseño y la predicción". BMC Structural Biology . 11 : 13. doi : 10.1186/1472-6807-11-13 . PMC 3059290 . PMID  21371326. 
  23. ^ Meyer J (febrero de 2008). "Pliegues de proteínas de hierro-azufre, química de hierro-azufre y evolución". J. Biol. Inorg. Chem . 13 (2): 157–70. doi :10.1007/s00775-007-0318-7. PMID  17992543. S2CID  21961142.
  24. ^ Palmer T (1981). Entendiendo las enzimas . Nueva York: Horwood. ISBN 978-0-85312-307-1.
  25. ^ Cox M, Lehninger AL, Nelson DR (2000). Principios de bioquímica de Lehninger (3.ª ed.). Nueva York: Worth Publishers. ISBN 978-1-57259-153-0.
  26. ^ Farrell SO, Campbell MK (2009). Bioquímica (sexta edición). Pacific Grove: Brooks Cole. ISBN 978-0-495-39041-1.
  27. ^ Morey AV, Juni E (junio de 1968). "Estudios sobre la naturaleza de la unión del pirofosfato de tiamina a las enzimas". The Journal of Biological Chemistry . 243 (11): 3009–19. doi : 10.1016/S0021-9258(18)93372-7 . PMID  4968184.
  28. ^ Hanukoglu I (diciembre de 2017). "Conservación de las interfaces enzima-coenzima en la enzima ubicua adrenodoxina reductasa-A que se une a FAD y NADP". Journal of Molecular Evolution . 85 (5–6): 205–218. Bibcode :2017JMolE..85..205H. doi :10.1007/s00239-017-9821-9. PMID  29177972. S2CID  7120148.
  29. ^ Bolander FF (2006). "Vitaminas: no sólo para enzimas". Curr Opin Investig Drugs . 7 (10): 912–5. PMID  17086936.
  30. ^ Rouvière PE, Wolfe RS (junio de 1988). "Nueva bioquímica de la metanogénesis". The Journal of Biological Chemistry . 263 (17): 7913–6. doi : 10.1016/S0021-9258(18)68417-0 . PMID  3131330.
  31. ^ Frank RA, Leeper FJ, Luisi BF (2007). "Estructura, mecanismo y dualidad catalítica de enzimas dependientes de tiamina". Cell. Mol. Life Sci . 64 (7–8): 892–905. doi :10.1007/s00018-007-6423-5. PMC 11136255. PMID 17429582.  S2CID 20415735  . 
  32. ^ ab Pollak N, Dölle C, Ziegler M (2007). "El poder de reducir: nucleótidos de piridina: pequeñas moléculas con una multitud de funciones". Biochem. J . 402 (2): 205–18. doi :10.1042/BJ20061638. PMC 1798440 . PMID  17295611. 
  33. ^ Eliot AC, Kirsch JF (2004). "Enzimas de fosfato de piridoxal: consideraciones mecanicistas, estructurales y evolutivas". Annu. Rev. Biochem. 73 : 383–415. doi :10.1146/annurev.biochem.73.011303.074021. PMID  15189147.
  34. ^ Banerjee R, Ragsdale SW (2003). "Las múltiples caras de la vitamina B12: catálisis por enzimas dependientes de la cobalamina". Annu. Rev. Biochem. 72 : 209–47. doi :10.1146/annurev.biochem.72.121801.161828. PMID  14527323. S2CID  37393683.
  35. ^ Jitrapakdee S, Wallace JC (2003). "La familia de enzimas de la biotina: motivos estructurales conservados y reordenamientos de dominios". Curr. Protein Pept. Sci . 4 (3): 217–29. doi :10.2174/1389203033487199. PMID  12769720.
  36. ^ Leonardi R, Zhang YM, Rock CO, Jackowski S (2005). "Coenzima A: de nuevo en acción". Prog. Res lípidos . 44 (2–3): 125–53. doi :10.1016/j.plipres.2005.04.001. PMID  15893380.
  37. ^ Donnelly JG (junio de 2001). "Ácido fólico". Critical Reviews in Clinical Laboratory Sciences . 38 (3): 183–223. doi :10.1080/20014091084209. PMID  11451208. S2CID  218866247.
  38. ^ Søballe B, Poole RK (agosto de 1999). "Ubiquinonas microbianas: múltiples funciones en la respiración, la regulación genética y el manejo del estrés oxidativo" (PDF) . Microbiología . 145 (8): 1817–30. doi : 10.1099/13500872-145-8-1817 . PMID  10463148.
  39. ^ Linster CL, Van Schaftingen E (2007). "Vitamina C. Biosíntesis, reciclaje y degradación en mamíferos". FEBS J. 274 (1): 1–22. doi : 10.1111/j.1742-4658.2006.05607.x . PMID  17222174.
  40. ^ ab Joosten V, van Berkel WJ (2007). "Flavoenzimas". Opinión actual Chem Biol . 11 (2): 195–202. doi :10.1016/j.cbpa.2007.01.010. PMID  17275397.
  41. ^ Mack M, Grill S (2006). "Análogos de riboflavina e inhibidores de la biosíntesis de riboflavina". Appl. Microbiol. Biotechnol . 71 (3): 265–75. doi :10.1007/s00253-006-0421-7. PMID  16607521. S2CID  12634062.
  42. ^ Bugg T (1997). Introducción a la química de enzimas y coenzimas. Oxford: Blackwell Science. pp. 95. ISBN. 978-0-86542-793-8.
  43. ^ Chiang PK, Gordon RK, Tal J, Zeng GC, Doctor BP, Pardhasaradhi K, McCann PP (marzo de 1996). "S-adenosilmetionina y metilación". FASEB Journal . 10 (4): 471–80. doi : 10.1096/fasebj.10.4.8647346 . PMID  8647346. S2CID  11214528.
  44. ^ Noll KM, Rinehart KL, Tanner RS, Wolfe RS (junio de 1986). "Estructura del componente B (fosfato de 7-mercaptoheptanoiltreonina) del sistema de metilcoenzima M metilreductasa de Methanobacterium thermoautotrophicum". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 83 (12): 4238–42. Bibcode :1986PNAS...83.4238N. doi : 10.1073/pnas.83.12.4238 . PMC 323707 . PMID  3086878. 
  45. ^ Taylor CD, Wolfe RS (agosto de 1974). "Estructura y metilación de la coenzima M(HSCH2CH2SO3)". The Journal of Biological Chemistry . 249 (15): 4879–85. doi : 10.1016/S0021-9258(19)42403-4 . PMID  4367810.
  46. ^ Balch WE, Wolfe RS (enero de 1979). "Especificidad y distribución biológica de la coenzima M (ácido 2-mercaptoetanosulfónico)". Journal of Bacteriology . 137 (1): 256–63. doi :10.1128/JB.137.1.256-263.1979. PMC 218444 . PMID  104960. 
  47. ^ Crane FL (diciembre de 2001). "Funciones bioquímicas de la coenzima Q10". Journal of the American College of Nutrition . 20 (6): 591–8. doi :10.1080/07315724.2001.10719063. PMID  11771674. S2CID  28013583. Archivado desde el original el 16 de diciembre de 2008.
  48. ^ Buchanan BB, Gruissem W, Jones RL (2000). Bioquímica y biología molecular de las plantas (1.ª ed.). Sociedad Americana de Fisiología Vegetal. ISBN 978-0-943088-39-6.
  49. ^ Grill D, Tausz T, De Kok LJ (2001). Importancia del glutatión en la adaptación de las plantas al medio ambiente. Springer. ISBN 978-1-4020-0178-9.
  50. ^ Meister A, Anderson ME (1983). "Glutatión". Revista anual de bioquímica . 52 : 711–60. doi :10.1146/annurev.bi.52.070183.003431. PMID  6137189.
  51. ^ Wijayanti N, Katz N, Immenschuh S (2004). "Biología del hemo en la salud y la enfermedad". Curr. Med. Chem . 11 (8): 981–6. doi :10.2174/0929867043455521. PMID  15078160.
  52. ^ Vorholt JA , Thauer RK (septiembre de 1997). "Las especies activas de 'CO2' utilizadas por la formilmetanofurano deshidrogenasa de Archaea metanogénica". Revista Europea de Bioquímica . 248 (3): 919–24. doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.00919.x . PMID  9342247.
  53. ^ Mendel RR, Hänsch R (agosto de 2002). "Molibdoenzimas y cofactor de molibdeno en plantas". Journal of Experimental Botany . 53 (375): 1689–98. doi : 10.1093/jxb/erf038 . PMID  12147719.
  54. ^ Mendel RR, Bittner F (2006). "Biología celular del molibdeno". Biochim. Biophys. Acta . 1763 (7): 621–35. doi :10.1016/j.bbamcr.2006.03.013. PMID  16784786.
  55. ^ Ginsburg V (1978). "Bioquímica comparativa de azúcares ligados a nucleótidos". Progreso en la investigación clínica y biológica . 23 : 595–600. PMID  351635.
  56. ^ Negishi M, Pedersen LG, Petrotchenko E, Shevtsov S, Gorokhov A, Kakuta Y, Pedersen LC (junio de 2001). "Estructura y función de las sulfotransferasas". Archivos de bioquímica y biofísica . 390 (2): 149–57. doi :10.1006/abbi.2001.2368. PMID  11396917.
  57. ^ Salisbury SA, Forrest HS, Cruse WB, Kennard O (agosto de 1979). "Una nueva coenzima de las alcohol deshidrogenasas primarias bacterianas". Nature . 280 (5725): 843–4. Bibcode :1979Natur.280..843S. doi :10.1038/280843a0. PMID  471057. S2CID  3094647.
  58. ^ Thöny B, Auerbach G, Blau N (abril de 2000). "Biosíntesis, regeneración y funciones de la tetrahidrobiopterina". The Biochemical Journal . 347 (1): 1–16. doi :10.1042/0264-6021:3470001. PMC 1220924 . PMID  10727395. 
  59. ^ DiMarco AA, Bobik TA, Wolfe RS (1990). "Coenzimas inusuales de la metanogénesis". Revisión anual de bioquímica . 59 : 355–94. doi :10.1146/annurev.bi.59.070190.002035. PMID  2115763.
  60. ^ Mitchell P (marzo de 1979). "La novena conferencia Sir Hans Krebs. Compartimentación y comunicación en sistemas vivos. Conducción de ligandos: un principio catalítico general en sistemas de reacción química, osmótica y quimiosmótica". Revista Europea de Bioquímica . 95 (1): 1–20. doi : 10.1111/j.1432-1033.1979.tb12934.x . PMID  378655.
  61. ^ Wimmer MJ, Rose IA (1978). "Mecanismos de reacciones de transferencia de grupos catalizadas por enzimas". Revista Anual de Bioquímica . 47 : 1031–78. doi :10.1146/annurev.bi.47.070178.005123. PMID  354490.
  62. ^ Di Carlo SE, Collins HL (2001). "Estimación de la resíntesis de ATP durante una carrera de maratón: un método para introducir el metabolismo". Advan. Physiol. Edu . 25 (2): 70–1.
  63. ^ Chen X, Li N, Ellington AD (2007). "Catálisis del metabolismo mediante ribozimas en el mundo del ARN". Química y biodiversidad . 4 (4): 633–55. doi :10.1002/cbdv.200790055. PMID  17443876. S2CID  44873410.
  64. ^ Koch AL (1998). ¿Cómo se originaron las bacterias? . Avances en fisiología microbiana. Vol. 40. págs. 353–99. doi :10.1016/S0065-2911(08)60135-6. ISBN 9780120277407. Número de identificación personal  9889982.
  65. ^ Ouzounis C, Kyrpides N (julio de 1996). "La aparición de los principales procesos celulares en la evolución". FEBS Letters . 390 (2): 119–23. Bibcode :1996FEBSL.390..119O. doi : 10.1016/0014-5793(96)00631-X . PMID  8706840. S2CID  39128865.
  66. ^ White HB (marzo de 1976). "Coenzimas como fósiles de un estado metabólico anterior". Journal of Molecular Evolution . 7 (2): 101–4. Bibcode :1976JMolE...7..101W. doi :10.1007/BF01732468. PMID  1263263. S2CID  22282629.
  67. ^ Saran D, Frank J, Burke DH (2003). "La tiranía del reconocimiento de adenosina entre los aptámeros de ARN para la coenzima A". BMC Evol. Biol . 3 : 26. doi : 10.1186/1471-2148-3-26 . PMC 317284. PMID  14687414 . 
  68. ^ Jadhav VR, Yarus M (2002). "Coenzimas como coribozimas". Bioquimia . 84 (9): 877–88. doi :10.1016/S0300-9084(02)01404-9. PMID  12458080.
  69. ^ Dowler, MJ; Fuller, WD; Orgel, LE; Sanchez, RA (25 de septiembre de 1970). "Síntesis prebiótica de propiolaldehído y nicotinamida". Science . 169 (3952): 1320–1321. Bibcode :1970Sci...169.1320D. doi :10.1126/science.169.3952.1320. ISSN  0036-8075. PMID  4247738.
  70. ^ Keefe, AD; Newton, GL; Miller, SL (23 de febrero de 1995). "Una posible síntesis prebiótica de panteteína, un precursor de la coenzima A". Nature . 373 (6516): 683–685. Bibcode :1995Natur.373..683K. doi :10.1038/373683a0. ISSN  0028-0836. PMID  7854449.
  71. ^ Monteverde, República Dominicana; Gómez-Consarnau, L.; Suffridge, C.; Sañudo-Wilhelmy, SA (enero 2017). "La utilización de las vitaminas B por parte de la vida en la Tierra primitiva". Geobiología . 15 (1): 3–18. Código Bib : 2017Gbio...15....3M. doi :10.1111/gbi.12202. ISSN  1472-4677. PMID  27477998.
  72. ^ Khoury GA, Fazelinia H, Chin JW, Pantazes RJ, Cirino PC, Maranas CD (octubre de 2009). "Diseño computacional de la xilosa reductasa de Candida boidinii para la especificidad del cofactor alterada". Protein Science . 18 (10): 2125–38. doi :10.1002/pro.227. PMC 2786976 . PMID  19693930. 
  73. ^ Cinética enzimática completa. 2004. doi :10.1007/b100340. ISBN 0-306-46712-7.
  74. ^ Garrett, R.; Grisham, Charles M. (2010). Bioquímica (4.ª ed.). Belmont, CA: Brooks/Cole, Cengage Learning. ISBN 978-0-495-10935-8.
  75. ^ Carlberg, Inger; Mannervik, Bengt (1985), [59] Glutatión reductasa, Methods in Enzymology, vol. 113, Elsevier, págs. 484–490, doi :10.1016/s0076-6879(85)13062-4, ISBN 978-0-12-182013-8, PMID  3003504 , consultado el 21 de septiembre de 2024
  76. ^ Harden A, Young WJ (24 de octubre de 1906). "La fermentación alcohólica del jugo de levadura". Actas de la Royal Society B: Ciencias Biológicas . 78 (526): 369–75. doi : 10.1098/rspb.1906.0070 .
  77. ^ "Fermentación de azúcares y enzimas fermentativas: Conferencia Nobel, 23 de mayo de 1930" (PDF) . Fundación Nobel . Consultado el 30 de septiembre de 2007 .
  78. ^ Lohmann K (agosto de 1929). "Über die Pyrophosphatfraktion im Muskel". Naturwissenschaften . 17 (31): 624–5. Código bibliográfico : 1929NW.....17..624.. doi : 10.1007/BF01506215. S2CID  20328411.
  79. ^ Lipmann F (1 de septiembre de 1945). "Acetilación de sulfanilamida por homogeneizados y extractos de hígado". J. Biol. Chem . 160 (1): 173–90. doi : 10.1016/S0021-9258(18)43110-9 .
  80. ^ Warburg O, Christian W (1936). "Piridin, el componente de transferencia de hidrógeno de las enzimas de fermentación (nucleótido de piridina)". Biochemische Zeitschrift . 287 : E79–E88. doi :10.1002/hlca.193601901199.
  81. ^ Kalckar HM (noviembre de 1974). "Orígenes del concepto de fosforilación oxidativa". Bioquímica molecular y celular . 5 (1–2): 55–63. doi :10.1007/BF01874172. PMID  4279328. S2CID  26999163.
  82. ^ Lipmann F (1941). "Generación metabólica y utilización de la energía de enlace de fosfato". Un libro de consulta sobre química, 1900-1950 . Adv Enzymol. Vol. 1. págs. 99-162. doi :10.4159/harvard.9780674366701.c141. ISBN 9780674366701.
  83. ^ Friedkin M, Lehninger AL (1949). "Esterificación de fosfato inorgánico acoplada al transporte de electrones entre el nucleótido dihidrodifosfopiridina y el oxígeno". J. Biol. Chem . 178 (2): 611–23. doi : 10.1016/S0021-9258(18)56879-4 . PMID  18116985.
  84. ^ ab Davidson VL (2007). "Cofactores derivados de proteínas. Ampliando el alcance de las modificaciones postraduccionales†". Bioquímica . 46 (18): 5283–5292. doi :10.1021/bi700468t. PMID  17439161.
  85. ^ Davidson VL, Wilmot CM (2013). "Biosíntesis postraduccional del cofactor derivado de proteína triptófano triptofilquinona". Revisión anual de bioquímica . 82 : 531–50. doi :10.1146/annurev-biochem-051110-133601. PMC 4082410 . PMID  23746262. 
  86. ^ Huang SX, Lohman JR, Huang T, Shen B (mayo de 2013). "Un nuevo miembro de la familia de aminomutasas que contienen 4-metilideneimidazol-5-ona de la vía biosintética de la enediina kedarcidina". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 110 (20): 8069–74. Bibcode :2013PNAS..110.8069H. doi : 10.1073/pnas.1304733110 . PMC 3657804 . PMID  23633564. 
  87. ^ Lodish, Harvey; Berk, Arnold; Zipursky, S. Lawrence; Matsudaira, Paul; Baltimore, David; Darnell, James (1 de enero de 2000). "Receptores acoplados a proteína G y sus efectores". Biología celular molecular (4.ª ed.).
  88. ^ O'Malley BW, McKenna NJ (octubre de 2008). "Coactivadores y correpresores: ¿qué hay en un nombre?". Endocrinología molecular . 22 (10): 2213–4. doi :10.1210/me.2008-0201. PMC 2582534. PMID  18701638 . 

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