Cloud en ese tiempo es un joven inocente que anhela con ser un SOLDADO, cuya misión es la paz de Shin-Ra, pero por sus pocas habilidades no lo consigue.
Durante la misión, Tifa, Barret y Cloud son detenidos por los soldados de ShinRa, la organización que gobierna Midgar.
Durante el curso de sus viajes, se desarrolla un triángulo amoroso entre Cloud, Tifa y Aeris.
Tifa había sido elegida por un mafioso de Mercado Muro, Don Corneo, que está buscando nueva novia.
Sabiendo esto, Don Corneo activa una trampa, enviándoles a la alcantarilla, retrasando su regreso al suburbio.
Cloud, Tifa, Barret y Marlene, que Aeris se había llevado a casa de su madre adoptiva, son los únicos supervivientes del derrumbe.
Su nombre es Nanaki, pero Hojo le puso Red XIII y es el último de su especie, como Aeris.
Cloud decide luchar contra él solo y dar a los otros tiempo para que puedan huir.
Cloud y compañía deciden ir al pueblo vecino de Kalm para pensar que hacer.
El grupo alcanza Junon en su base, en el que está un empobrecido y contaminado pueblo pesquero, allí en la playa, una jovencita juega con un delfín cuando es atacada con un gran monstruo marino llamado Bottomswell, tras derrotarlo y reanimar a la niña, llamada Priscila, esta les regala la materia Shiva y le permite a Cloud alcanzar la ciudad de Junon con su delfín, en las alturas.
Cloud finalmente embarca tras sus enemigos y se reúne con sus amigos, que también han entrado de polizontes.
Tras una dura batalla la extremidad cae derrotada y con grandes dudas, el grupo desembarca en Costa del Sol, donde tras tomar un breve descanso, prosiguen su viaje hacia las montañas.
El grupo se detiene en un tupido bosque que rodea un enorme reactor destrozado, cuando se internan en él son atacados por los turcos Reno y Ruda, que los esperaban, tras derrotarlos y hacerlos huir Cloud comienza a dudar de sus amigos.
Mientras exploran Gongaga, alcanzan el destrozado reactor, pero deben esconderse ya que Tseng y Escarlata hacen acto de aparición buscando Materias Enormes con las que crear el arma definitiva, no obstante su búsqueda es baldía y se van.
Cloud y los suyos cada vez se preocupan más, pero solo pueden continuar tras los pasos de Sephiroth.
Tras derrotarlo, Nanaki conoce la verdad: su padre Seto defendió esa parte del Cañón incluso cuando su cuerpo quedó petrificado.
Cid comenta que Rufus planeaba encontrar a Sephiroth en el Templo de los Ancianos, Cloud decide buscar información en tierra firme.
Tras esto Yuffie devuelve la materia robada y se une al grupo para detener a Sephiroth.
Allí Dio accede a prestarles la piedra si Cloud pelea en su Battle Square, y tras hacer el exmiembro de SOLDADO un buen papel, la llave es suya.
Tras un laberíntico recorrido logran alcanzar la entrada principal, donde encuentran a Tseng gravemente herido por Sephiroth.
Allí gracias a unos excavadores logran atravesar el Bosque Dormido con un artefacto oculto y alcanzar la Ciudad Olvidada, morada de los Ancianos.
Tras vencer, un desconsolado Cloud deposita a Aeris en el lago, donde su cuerpo se hunde y desaparece.
Dejando la Ciudad Olvidada atrás, el grupo se encamina a través del acantilado y las llanuras nevadas al norte, donde alcanzan la apartada Aldea de Iciclos.
En ese momento, hicieron la promesa de que si algo le pasará a Tifa, Cloud aparecería para salvarla.
Él hizo todo lo posible para evitar que Tifa, su guía en la misión, no le descubriera.
Cuando Cloud llegó al reactor, colocó a Tifa en un lugar seguro y vio como su amigo Zack fue derrotado por Sephiroth.
Las células de Jenova no hacen efecto sobre Zack, pero sí sobre Cloud, por lo que más adelante sus habilidades físicas mejoran considerablemente.
Debido al lamentable estado de Cloud, decidieron abandonarlo pensando que estaba demasiado débil para sobrevivir.
Sephiroth se desvanece diciendo que nunca será un recuerdo, y deja a Kadaj detrás.
Tras el paso de Kadaj a la corriente vital Cloud se encuentra con unos maltrechos Loz y Yazoo, que le disparan por detrás.