La Copa de la UEFA 1998-99 fue ganada por el Parma en la final contra el Marsella . Fue su segundo título en la competición.
Fue la última edición del antiguo formato de la Copa de la UEFA, antes de que se fusionara con la Recopa para incluir a los campeones de copa nacionales y se añadiera una ronda eliminatoria adicional. El nuevo formato se jugó por última vez en la temporada 2003-04 y luego fue reemplazado por un formato de fase de grupos en 2004-05.
Las etiquetas entre paréntesis muestran cómo cada equipo clasificó para el lugar de su ronda inicial: [1]
Argeş Piteşti ganó 7-1 en el global.
El Inter de Bratislava ganó 4-0 en el global.
El Polonia Varsovia ganó 5-1 en el global.
3-3 en el global; Zalgiris Vilnius ganó por el valor doble de los goles marcados fuera de casa.
Wisła Kraków ganó 7-0 en el global.
El CSKA de Sofía ganó 3-1 en el global.
Hapoel Tel Aviv ganó 6-2 en el global.
El Shakhtar Donetsk ganó 6-1 en el global.
Mura ganó 8-2 en el global.
VPS ganó 4-2 en el global.
Malmö ganó 7-0 en el global.
IFK Göteborg ganó 7-0 en el global.
El Estrella Roja de Belgrado ganó 11-0 en el global.
Germinal Ekeren ganó 4-1 en el global.
Oţelul Galaţi ganó 4-1 en el global.
Anderlecht ganó 6-0 en el global.
Omonia ganó 8-6 en el global.
Kilmarnock ganó 2-1 en el global.
Los Rangers ganaron 7-3 en el global.
Ferencváros ganó 14-1 en el global.
Brann ganó 1-0 en el global.
Vejle ganó 6-0 en el global.
El CSKA de Sofía ganó 2-0 en el global.
El Dinamo de Moscú ganó 2-0 en el global.
El Estrella Roja de Belgrado ganó 4-2 en el global.
El Zúrich ganó 6-3 en el global.
3-3 en el global; el Rapid de Viena ganó por el valor doble de los goles marcados fuera de casa.
Silkeborg ganó 2-0 en el global.
El Slavia de Praga ganó 4-2 en el global.
El Hajduk Split ganó 3-2 en el global.
1–1 en total; Strømsgodset ganó 4-2 en los penaltis.
2-2 en el global; el Fenerbahçe ganó por el valor doble de los goles marcados fuera de casa.
Wisła Kraków ganó 7-2 en el global.
El AEK de Atenas ganó 6-4 en el global.
El Servette ganó 5-3 en el global.
3-3 en el global; Anderlecht ganó por los goles de visitante.
Los Rangers ganaron 2-0 en el global.
GAK ganó 3-0 en el global.
El Sigma Olomouc ganó 4-0 en el global.
4–4 en total; Argeş Piteşti ganó gracias a los goles a domicilio.
Wisła Kraków ganó 5-0 en el global.
1-1 en el global; Slavia Praga ganó 5-4 en los penaltis.
El Bolonia ganó 4-1 en el global.
El Willem II ganó 6-0 en el global.
2-2 en el global; el CSKA de Sofía ganó por el valor doble de los goles marcados fuera de casa.
El Dinamo de Moscú ganó 5-4 en el global.
La Fiorentina ganó 2-1 en el global.
Aston Villa ganó 6-2 en el global.
GAK ganó 3-1 en el global.
3-3 en el global; Estrella Roja de Belgrado ganó 4-3 en los penaltis.
El Werder Bremen ganó 4-2 en el global.
El Zúrich ganó 7-2 en el global.
El Marsella ganó 6-2 en el global.
La Real Sociedad ganó 5-2 en el global.
El Stuttgart ganó 4-3 en el global.
El Vitesse ganó 6-3 en el global.
Mónaco ganó 3-1 en el global.
Los Grasshoppers ganaron 2-0 en el global.
El Club Brugge ganó 7-2 en el global.
El Burdeos ganó 3-2 en el global.
El Atlético de Madrid ganó 3-0 en el global.
El Parma ganó 3-2 en el global.
El Celtic ganó 4-2 en el global.
La Roma ganó 3-0 en el global.
El Liverpool ganó 8-0 en el global.
El Bayer Leverkusen ganó 2-1 en el global.
El Lyon ganó 3-2 en el global.
El Celta de Vigo ganó 8-0 en el global.
El Real Betis ganó 5-1 en el global.
El Valencia ganó 7-3 en el global.
1-1 en el global; Leeds United ganó 4-1 en los penaltis.
Los Rangers ganaron 5-3 en el global.
El Bolonia ganó 4-1 en el global.
El Burdeos ganó 3-1 en el global.
El Parma ganó 3-2 en el global.
El Club Brugge ganó 4-3 en el global.
Mónaco ganó 7-3 en el global.
La Real Sociedad ganó 6-2 en el global.
El Zúrich ganó 5-3 en el global.
El Lyon ganó 5-3 en el global.
El partido fue abandonado en el descanso después de que el cuarto árbitro, el belga Philippe Flament, sufriera una lesión en la rodilla y un hematoma por un petardo lanzado al campo por los aficionados desde las gradas. En el momento del incidente, la Fiorentina ganaba 2-1 en la noche y 4-1 en el global. Cuatro días después, en una reunión de emergencia de la UEFA, la Fiorentina fue expulsada de la Copa de la UEFA y el partido se registró como una victoria del Grasshopper por 0-3. La UEFA también consideró la posibilidad de expulsar a la Fiorentina de la competición europea en el futuro, pero finalmente se descartó debido a circunstancias atenuantes , específicamente que el partido, como parte de un castigo anterior, no se jugó en el estadio local de la Fiorentina sino en Salerno y evidencia creíble de que el petardo probablemente fue lanzado por fanáticos del club local Salernitana que guardaban rencor después de un reciente partido de la Serie A entre los dos clubes. [2]
Grasshopper ganó 3-2 en el global.
El Celta de Vigo ganó por 3-2 en el global.
El Marsella ganó 4-3 en el global.
La Roma ganó 1-0 en el global.
El Atlético de Madrid ganó 5-2 en el global.
2-2 en el global; Liverpool ganó por los goles de visitante.
El Real Betis ganó 4-1 en el global.
Los Rangers ganaron 3-2 en el global.
El Parma ganó 4-2 en el global.
El Bolonia ganó 4-2 en el global.
El Lyon ganó 5-3 en el global.
3-3 en el global; el Burdeos ganó por el valor doble de los goles marcados fuera de casa.
Roma won 3–2 on aggregate.
Celta de Vigo won 4–1 on aggregate.
Marseille won 3–2 on aggregate.
Atlético Madrid won 5–3 on aggregate.
Parma won 7–2 on aggregate.
Bologna won 3–2 on aggregate.
Atlético Madrid won 4–2 on aggregate.
Marseille won 2–1 on aggregate.
1–1 on aggregate; Marseille won on away goals.
Parma won 5–2 on aggregate.
