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Sociedad Internacional de Biología Computacional

La Sociedad Internacional de Biología Computacional ( ISCB ) es una sociedad académica para investigadores en biología computacional y bioinformática . La sociedad se fundó en 1997 para brindar un hogar financiero estable para la conferencia de Sistemas Inteligentes para Biología Molecular (ISMB) y ha crecido hasta convertirse en una sociedad más grande que trabaja para avanzar en la comprensión de los sistemas vivos a través de la computación y para comunicar los avances científicos en todo el mundo.

Además de la ISMB, la sociedad también organiza un número cada vez mayor de conferencias más pequeñas, más centradas en regiones o temas, y otorga una serie de premios anuales a los logros científicos, incluidos el Premio Overton y los Premios a los Científicos Senior de la ISCB . [3] [4] [5]

Descripción general

La ISCB organiza cada año la conferencia de Sistemas Inteligentes para Biología Molecular (ISMB), un número cada vez mayor de conferencias anuales y bianuales más pequeñas, más centradas en regiones o temas, y tiene tres revistas oficiales: ISCB Community Journal, PLOS Computational Biology y Bioinformatics . La sociedad otorga anualmente tres premios a los logros científicos: el Premio Overton , el Premio al Innovador de la ISCB [6] y los Premios al Científico Sénior de la ISCB . La sociedad elige anualmente a los miembros de la ISCB para honrar a los miembros que se han distinguido por sus contribuciones sobresalientes en los campos de la biología computacional y la bioinformática. La ISCB también otorga el Premio a las Contribuciones Sobresalientes de la ISCB para reconocer a los miembros de la comunidad que han contribuido significativamente al éxito de la organización.

Historia

Establecimiento

La serie de conferencias de Sistemas Inteligentes para Biología Molecular (ISMB) comenzó en 1993. [7] Como respuesta a la expansión de la conferencia, la ISCB se fundó en 1997 con una parte significativa de su cometido siendo proporcionar un hogar financiero estable para la ISMB. [8] [9] La ISCB se constituyó legalmente a principios de 1997, [9] con Lawrence Hunter elegido como su presidente inaugural por los miembros de la junta directiva fundadora, que incluía a Russ Altman , Philip Bourne , David States y Alfonso Valencia . [10] La ISCB ha organizado la conferencia ISMB desde 1998. [11]

Durante los años siguientes la atención se centró en la gestión de la conferencia anual de la ISMB, cuya asistencia en 1993, de aproximadamente 200 investigadores, se había más que triplicado en 1999.

El nuevo milenio trajo consigo un nuevo presidente , Russ Altman , actualmente [¿ cuándo? ] presidente del departamento de bioingeniería de la Universidad de Stanford y director del programa de informática biomédica, y más de 1200 delegados asistieron a la ISMB 2000 en San Diego . Altman tomó medidas para formalizar algunos de los aspectos legales y administrativos de la ISCB antes de pasarle la antorcha en 2002 a Philip E. Bourne , actualmente [¿ cuándo? ] profesor del departamento de farmacología y de la Escuela Skaggs de Farmacia y Ciencias Farmacéuticas de la Universidad de California en San Diego . Bourne le dio a la ISCB un hogar más permanente en la UCSD, que incluyó el compromiso de la universidad de albergar a la sociedad al menos hasta 2005 y su oferta de apoyo del personal. Aunque Bourne sirvió como presidente solo durante un año, dejó su huella en la sociedad al aumentar la interacción con los grupos regionales y los organizadores de conferencias en todo el mundo, y a través de una mejor presencia en la web. Durante su mandato, el número de miembros aumentó a más de 1.700 investigadores y la conferencia ISMB de 2002 en Edmonton, Alberta, Canadá, recibió a más de 1.600 asistentes.

Expansión

Michael Gribskov , entonces en el departamento de Supercomputadoras de San Diego de la UCSD y ahora en el departamento de ciencias biológicas de la Universidad de Purdue , fue elegido presidente en 2003. Ese año la ISMB tuvo lugar en Brisbane , Australia, que fue la primera vez que la reunión se celebró fuera de América del Norte o Europa. Esta fase trajo muchas incertidumbres para la sociedad cuando la asistencia se redujo a la mitad de las expectativas presupuestadas debido a los temores de viaje y las restricciones relacionadas con los brotes del síndrome respiratorio agudo severo o SARS , el comienzo de la guerra en Irak y la ubicación, que rompió con el patrón de los lugares de América del Norte y Europa. Aunque científicamente exitosa, las pérdidas financieras de la ISMB 2003 dejaron a la ISCB financieramente inestable por primera vez en su historia.

En parte para reducir la dependencia de la ISCB de los ingresos de la ISMB para financiar las actividades de la sociedad y los gastos generales anuales, se organizó una conferencia regional piloto en los EE. UU. para evaluar el interés en reuniones más pequeñas y localizadas. En diciembre de 2003, se lanzó la conferencia regional de bioinformática de las Montañas Rocosas, Rocky 1, en Aspen , Colorado. La reunión se ha celebrado anualmente desde entonces y ahora atrae a asistentes de todo el mundo.

En 2005, como parte de los debates de la sociedad sobre el papel de las publicaciones y la revista oficial de la sociedad, acompañados por el advenimiento de la publicación de acceso abierto, la ISCB anunció una asociación con la Biblioteca Pública de Ciencias y lanzó una nueva revista de acceso abierto , PLoS Computational Biology . La revista tiene como objetivo enfatizar los métodos computacionales aplicados a los sistemas vivos en todas las escalas, desde la biología molecular hasta las poblaciones de pacientes y los ecosistemas, y que ofrecen información para los experimentalistas. El ex presidente y ex presidente del comité de publicaciones Phil Bourne se desempeñó como editor en jefe de la nueva publicación y continúa en ese papel. El primer número de la nueva revista coincidió con el día de apertura de ISMB 2005, celebrado en Detroit , Michigan .

Burkhard Rost , entonces profesor en el departamento de bioquímica y biofísica molecular en la Universidad de Columbia y ahora profesor Alexander von Humboldt y presidente de bioinformática y biología computacional, ciencias computacionales en la Universidad Técnica de Múnich , sucedió a Michael Gribskov como presidente en 2007 y ha sido reelegido dos veces con un vencimiento del mandato actual fijado para enero de 2013. Bajo su mandato, la conferencia ISMB/ECCB 2007 en Viena, Austria, presidida por Thomas Lengauer del Instituto Max-Planck de Informática, y copresidida por Burkhard Rost y Peter Schuster de la Universidad de Viena , se amplió aún más para incluir un total de ocho pistas paralelas, y la asistencia a la conferencia de 2007 de aproximadamente 1.700 personas volvió a estar en línea con las expectativas. Tanto Viena como destino como el Austria Center Vienna fueron tan bien recibidos por los organizadores de la conferencia y los asistentes que el país fue seleccionado para albergar también la conferencia de 2011, algo que es una novedad para la serie ISMB, que nunca antes había repetido una ubicación.

En 2010 se realizó la primera ISCB Latinoamérica en Montevideo , Uruguay.

Liderazgo y Estructura

El liderazgo científico de la ISCB está integrado por un presidente, un comité ejecutivo y una junta directiva , que se compone de investigadores distinguidos y de renombre internacional que son elegidos para su mandato por los miembros de la sociedad en general. El director ejecutivo lidera al personal de la ISCB y apoya a un conjunto diverso de comités dedicados a cuestiones específicas que son importantes para la comunidad de la biología computacional y la bioinformática, como la educación, las políticas y las publicaciones.

Presidentes

Junta Directiva

A partir de 2018 , los miembros notables de la junta directiva incluyen: Alex Bateman , Bonnie Berger , Terry Gaasterland , Janet Kelso , Thomas Lengauer , Yves Moreau , Christine Orengo , Burkhard Rost , Alfonso Valencia y Martin Vingron . [12]

Compañeros

La ISCB ha elegido a sus miembros desde 2009. Estas distinciones se otorgan en honor a las contribuciones destacadas en los campos de la biología computacional y la bioinformática. [13] La clase inaugural se entregó a los destinatarios anteriores del premio ISCB Accomplishment by a Senior Scientist Award ; en los años siguientes, la ISCB ha solicitado nominaciones para miembros entre sus miembros. Los miembros son presentados tradicionalmente en la conferencia insignia de la ISCB, Intelligent Systems for Molecular Biology, cada año. Hasta la clase de 2017, se han elegido 64 miembros. [14]

Comunidades de Interés Especial (COSIs)

Las comunidades de interés especial (COSI) de la ISCB son comunidades de miembros con intereses compartidos que se han autoorganizado y tienen múltiples actividades o interacciones a lo largo del año, en lugar de reunirse únicamente durante el programa SIG de la conferencia de la ISMB. [15] Un objetivo importante de cualquier COSI es fomentar una comunidad colaborativa centrada en un tema en el que los científicos se comuniquen entre sí sobre problemas de investigación y/o oportunidades en áreas específicas de la biología computacional. Dicha comunicación suele realizarse en forma de reuniones, pero también puede realizarse a través de otras herramientas de redes sociales que permiten una participación vibrante en un entorno virtual.

Consejo estudiantil

En 2004, Manuel Corpas fundó el Consejo de Estudiantes de la ISCB para promover el desarrollo de una comunidad mundial de estudiantes de biología computacional. Una de las principales funciones del consejo de estudiantes es promover las habilidades interpersonales para desarrollar el potencial de los estudiantes de bioinformática y biología computacional. En 2017 , el consejo de estudiantes representa a más de 1000 estudiantes de todo el mundo. [ cita requerida ]

Conferencias

La ISCB surgió de la necesidad de una estructura organizativa estable que respaldara la planificación y la gestión financiera de la serie de conferencias de Sistemas Inteligentes para la Biología Molecular (ISMB), que comenzó en 1993. La ISMB es la actividad anual más destacada de la ISCB, a la que se dedica una parte importante de los recursos cada año. Desde 2004, cuando la ISMB se celebra en Europa, se lleva a cabo conjuntamente con la Conferencia Europea de Biología Computacional (ECCB).

La ISCB comenzó a ampliar su oferta de conferencias con la introducción de la serie anual de conferencias de bioinformática de las Montañas Rocosas en 2003, la Conferencia sobre semántica en el cuidado de la salud y las ciencias de la vida (CSHALS) en 2008, la Conferencia bianual de bioinformática de la ISCB África ASBCB en 2009 y la Conferencia bianual de América Latina de la ISCB en 2010. La ISCB también organiza una conferencia anual de bioinformática de los Grandes Lagos y se asocia con RECOMB para producir la Conferencia de genómica regulatoria y de sistemas con DREAM Challenges. La reunión de la ISCB-Asia comenzó en 2012 y continúa tomando forma después de su última conferencia en 2014 en Japón en conjunto con GIW.

Además de las conferencias organizadas por la ISCB, la sociedad apoya otras conferencias sobre biología computacional y bioinformática a través de afiliaciones y patrocinios. Entre ellas se incluyen el Simposio anual del Pacífico sobre bioinformática (PSB), la conferencia internacional anual sobre investigación en biología molecular computacional (RECOMB), la conferencia internacional anual sobre bioinformática (InCoB) y la reunión general anual de la Red Europea de Biología Molecular o EMBnet.

Diarios oficiales

Organizaciones afiliadas

La ISCB tiene varias organizaciones afiliadas (principalmente regionales), incluidas la Red Europea de Biología Molecular (EMBnet), el Centro Holandés de Bioinformática (NBIC), la Sociedad Africana de Bioinformática y Biología Computacional y la Sociedad Japonesa de Bioinformática . [21]

La ISCB también es miembro fundador de la Organización Mundial para el Aprendizaje, la Educación y la Formación en Bioinformática (GOBLET). En colaboración con GOBLET, la ISCB participa en el desarrollo de competencias básicas para diferentes tipos de estudiantes de bioinformática; estas competencias se están utilizando en el desarrollo de nuevos planes de estudio de bioinformática. [22] [23] [24]

Referencias

  1. ^ "Contáctenos". iscb.org . Consultado el 11 de agosto de 2016 .
  2. ^ "Miembros de la ISCB". iscb.org . Consultado el 11 de agosto de 2016 .
  3. ^ Fogg, Christiana N.; Kovats, Diane E. (2014). "La Sociedad Internacional de Biología Computacional honra a Dana Pe'er con el premio Top Bioinformática/Biología Computacional de 2014". PLOS Computational Biology . 10 (6): e1003682. Bibcode :2014PLSCB..10E3682F. doi : 10.1371/journal.pcbi.1003682 . PMC 4063598 . PMID  24945496. 
  4. ^ Fogg, CN; Kovats, DE (2014). "Premio ISCB 2014 al logro de un científico sénior: Gene Myers". PLOS Computational Biology . 10 (5): e1003621. Bibcode :2014PLSCB..10E3621F. doi : 10.1371/journal.pcbi.1003621 . PMC 4031058 . PMID  24853264. 
  5. ^ Premio al logro de un científico sénior
  6. ^ "Premio a la innovación de la ISCB". iscb.org . Consultado el 2 de febrero de 2017 .
  7. ^ "Acerca de ISMB". iscb.org . Consultado el 27 de octubre de 2017 .
  8. ^ abc Hunter, Lawrence; Altman, Russ B.; Bourne, Philip E. (2007). "El décimo aniversario de la Sociedad Internacional de Biología Computacional". PLOS Computational Biology . 3 (6): e135. Bibcode :2007PLSCB...3..135H. doi : 10.1371/journal.pcbi.0030135 . PMC 1904389 . 
  9. ^ abcde «Historia de la ISCB». iscb.org . Consultado el 27 de octubre de 2017 .
  10. ^ "Ex funcionarios y directores". iscb.org . Consultado el 27 de octubre de 2017 .
  11. ^ Linial, Michal; Mesirov, Jill P.; Morrison McKay, BJ; Rost, Burkhard (27 de junio de 2008). "ISMB 2008 Toronto" (PDF) . PLOS Computational Biology . 4 (6): e1000094. Bibcode :2008PLSCB...4E0094L. doi : 10.1371/journal.pcbi.1000094 . PMC 2427177 . PMID  18584023. 
  12. ^ "Funcionarios y directores". www.iscb.org . Consultado el 25 de octubre de 2017 .
  13. ^ "ISCB Fellows". Archivado desde el original el 20 de marzo de 2017 . Consultado el 10 de marzo de 2016 .
  14. ^ "13 de febrero de 2017: La Sociedad Internacional de Biología Computacional nombra a siete miembros como la Clase de Becarios ISCB de 2017". www.iscb.org . Consultado el 13 de febrero de 2017 .
  15. ^ "COSIs" . Consultado el 15 de febrero de 2017 .
  16. ^ Brunak, S.; Krogh, A. (1 de junio de 2001). "ISMB 2001". Bioinformática . 17 (Supl 1): S1–S4. doi : 10.1093/bioinformatics/17.suppl_1.S1 .
  17. ^ "Actas de la ISMB". www.iscb.org . Consultado el 30 de octubre de 2017 .
  18. ^ "Bioinformática". www.iscb.org . Consultado el 30 de octubre de 2017 .
  19. ^ "F1000Research publicará la revista comunitaria ISCB". 30 de abril de 2015. Consultado el 30 de abril de 2015 .
  20. ^ "Comunicado de prensa de la ISCB/F1000" (PDF) . Archivado desde el original (PDF) el 4 de marzo de 2016 . Consultado el 30 de abril de 2015 .
  21. ^ "Afiliados y COSI". www.iscb.org . Consultado el 29 de agosto de 2016 .
  22. ^ Attwood, Teresa K.; Black, Pamela; Blatter, Marie-Claude; Brooksbank, Cath; Fernandes, Pedro; Mulder, Nicola; Palagi, Patricia M.; Rustici, Gabriella; Schneider, Maria Victoria; van Gelder, Celia WG (2016). "Actividades de aprendizaje, educación y formación en bioinformática de GOBLET [v1; no revisadas por pares]". F1000Research . 5(ISCB Comm J): 1944 (póster). doi : 10.7490/f1000research.1112737.1 . Consultado el 25 de agosto de 2016 .
  23. ^ Welch, Lonnie; Lewitter, Fran; Schwartz, Russell; Brooksbank, Cath; Radivojac, Predrag; Gaeta, Bruno; Schneider, Maria Victoria (6 de marzo de 2014). "Directrices curriculares de bioinformática: hacia una definición de competencias básicas". PLOS Computational Biology . 10 (3): e1003496. Bibcode :2014PLSCB..10E3496W. doi : 10.1371/journal.pcbi.1003496 . PMC 3945096 . PMID  24603430. 
  24. ^ Schiffthaler, Bastian; Kostadima, Myrto; Delhomme, Nicolas; Rustici, Gabriella; Ouellette, Francis (16 de junio de 2016). "Capacitación en secuenciación de alto rendimiento: pautas comunes para permitir el intercambio, la difusión y la reutilización de materiales". PLOS Computational Biology . 12 (6): e1004937. Bibcode :2016PLSCB..12E4937S. doi : 10.1371/journal.pcbi.1004937 . PMC 4910983 . PMID  27309738.