Joe Shuster nació en Toronto, Ontario, hijo de inmigrantes judíos.
En Cleveland, Shuster asistió a la Escuela Secundaria Glenville, donde entabló amistad con el que luego sería su colaborador, el escritor Jerry Siegel, con quien comenzó a publicar un fanzine de ciencia ficción.
El dúo entró en el mundo del cómic en la National Allied Publications (futuro DC Comics), propiedad del comandante Malcolm Wheeler-Nicholson, trabajando en la revista New Fun (que fue el primer comic-book compuesto únicamente de material original en vez de usar reimpresiones de tiras cómicas publicadas en periódicos), debutando con el romántico y pendenciero mosquetero "Henri Duval" y con una tira sobre un justiciero sobrenatural llamado Doctor Oculto, ambos en New Fun #6 (octubre de 1935).
Siegel y Shuster utilizaron una primera versión del personaje que posteriormente se convertiría en Superman en unas historias cortas de 1933 para una propuesta para unas tiras cómicas.
En 1947, se volvieron a unir al editor Sullivan, en ese momento fundador y editor de la compañía de comic-book Magazine Enterprises donde crearon la efímera historia del justiciero Funnyman.
Si bien Siegel continuó escribiendo historietas para una variedad de editores, Shuster quedó más apartado.
En 1975, Siegel puso en marcha una campaña de publicidad, en la que participó Shuster, en protesta por como DC Comics les había tratado a él y a Shuster.